RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530578.1

UBASH3B-206, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBASH3B-206ENST00000530578 SMARCA2P51531 1590 aa16.68■□□□□ 0.26
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UBASH3B-206ENST00000530578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.22■□□□□ 0.19
UBASH3B-206ENST00000530578 ERCC6Q03468 1493 aa16.21■□□□□ 0.19
UBASH3B-206ENST00000530578 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.19■□□□□ 0.18
UBASH3B-206ENST00000530578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.17■□□□□ 0.18
UBASH3B-206ENST00000530578 CFTRP13569 1480 aa16.11■□□□□ 0.17
UBASH3B-206ENST00000530578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.05■□□□□ 0.16
UBASH3B-206ENST00000530578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.03■□□□□ 0.16
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UBASH3B-206ENST00000530578 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.98■□□□□ 0.15
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UBASH3B-206ENST00000530578 PRDM2Q13029 1718 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-206ENST00000530578 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.94■□□□□ 0.14
UBASH3B-206ENST00000530578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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UBASH3B-206ENST00000530578 ABCC8Q09428 1581 aa15.81■□□□□ 0.12
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UBASH3B-206ENST00000530578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-206ENST00000530578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-206ENST00000530578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.53■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 TOP2BQ02880 1626 aa15.53■□□□□ 0.08
UBASH3B-206ENST00000530578 SYNJ1O43426 1573 aa15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-206ENST00000530578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.5■□□□□ 0.07
UBASH3B-206ENST00000530578 OSCARQ8IYS5 282 aa15.47■□□□□ 0.07
UBASH3B-206ENST00000530578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UBASH3B-206ENST00000530578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-206ENST00000530578 FBLN2P98095 1184 aa15.45■□□□□ 0.06
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UBASH3B-206ENST00000530578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-206ENST00000530578 GRIN2BQ13224 1484 aa15.4■□□□□ 0.06
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UBASH3B-206ENST00000530578 PBRM1Q86U86 1689 aa15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-206ENST00000530578 KIF27Q86VH2 1401 aa15.3■□□□□ 0.04
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UBASH3B-206ENST00000530578 CHD1O14646 1710 aa15.29■□□□□ 0.04
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UBASH3B-206ENST00000530578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.24■□□□□ 0.03
UBASH3B-206ENST00000530578 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.18■□□□□ 0.02
UBASH3B-206ENST00000530578 GRIN2AQ12879 1464 aa15.18■□□□□ 0.02
UBASH3B-206ENST00000530578 ADAMTS12P58397 1594 aa15.18■□□□□ 0.02
UBASH3B-206ENST00000530578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.17■□□□□ 0.02
UBASH3B-206ENST00000530578 CUL7Q14999 1698 aa15.12■□□□□ 0.01
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UBASH3B-206ENST00000530578 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
UBASH3B-206ENST00000530578 NUP160Q12769 1436 aa15.09■□□□□ 0.01
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