RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529673.5

SNX15-206, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 3

Gene SNX15, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-206ENST00000529673 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.69■■■□□ 2.98
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SNX15-206ENST00000529673 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.58■■■□□ 2.49
SNX15-206ENST00000529673 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.83■■■□□ 2.37
SNX15-206ENST00000529673 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX15-206ENST00000529673 NACADO15069 1562 aa29.09■■■□□ 2.25
SNX15-206ENST00000529673 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
SNX15-206ENST00000529673 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.69■■■□□ 2.18
SNX15-206ENST00000529673 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.67■■■□□ 2.18
SNX15-206ENST00000529673 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.57■■■□□ 2.16
SNX15-206ENST00000529673 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.49■■■□□ 2.15
SNX15-206ENST00000529673 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
SNX15-206ENST00000529673 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.22■■■□□ 2.11
SNX15-206ENST00000529673 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.17■■■□□ 2.1
SNX15-206ENST00000529673 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28■■■□□ 2.07
SNX15-206ENST00000529673 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SNX15-206ENST00000529673 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SNX15-206ENST00000529673 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.84■■■□□ 2.05
SNX15-206ENST00000529673 SCRIBQ14160 1630 aa27.76■■■□□ 2.03
SNX15-206ENST00000529673 CUX2O14529 1486 aa27.27■■□□□ 1.96
SNX15-206ENST00000529673 ERCC6Q03468 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
SNX15-206ENST00000529673 NCAPD3P42695 1498 aa26.85■■□□□ 1.89
SNX15-206ENST00000529673 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.64■■□□□ 1.86
SNX15-206ENST00000529673 HMGXB3Q12766 1538 aa26.6■■□□□ 1.85
SNX15-206ENST00000529673 NESP48681 1621 aa26.58■■□□□ 1.85
SNX15-206ENST00000529673 SMARCA2P51531 1590 aa26.58■■□□□ 1.85
SNX15-206ENST00000529673 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX15-206ENST00000529673 TRIM41Q8WV44 630 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX15-206ENST00000529673 SMARCA4P51532 1647 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX15-206ENST00000529673 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SNX15-206ENST00000529673 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.37■■□□□ 1.81
SNX15-206ENST00000529673 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
SNX15-206ENST00000529673 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SNX15-206ENST00000529673 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.22■■□□□ 1.79
SNX15-206ENST00000529673 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.22■■□□□ 1.79
SNX15-206ENST00000529673 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX15-206ENST00000529673 WDR62O43379 1518 aa26.01■■□□□ 1.75
SNX15-206ENST00000529673 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.99■■□□□ 1.75
SNX15-206ENST00000529673 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX15-206ENST00000529673 OSCARQ8IYS5 282 aa25.86■■□□□ 1.73
SNX15-206ENST00000529673 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX15-206ENST00000529673 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.7■■□□□ 1.7
SNX15-206ENST00000529673 WIZO95785 1651 aa25.63■■□□□ 1.69
SNX15-206ENST00000529673 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX15-206ENST00000529673 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX15-206ENST00000529673 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
SNX15-206ENST00000529673 CFTRP13569 1480 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX15-206ENST00000529673 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SNX15-206ENST00000529673 ARHGEF11O15085 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX15-206ENST00000529673 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SNX15-206ENST00000529673 IFT140Q96RY7 1462 aa25.33■■□□□ 1.65
SNX15-206ENST00000529673 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SNX15-206ENST00000529673 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SNX15-206ENST00000529673 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.26■■□□□ 1.63
SNX15-206ENST00000529673 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNX15-206ENST00000529673 PRDM2Q13029 1718 aa25.21■■□□□ 1.63
SNX15-206ENST00000529673 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SNX15-206ENST00000529673 ARAP1Q96P48 1450 aa25.15■■□□□ 1.62
SNX15-206ENST00000529673 TOPBP1Q92547 1522 aa25.12■■□□□ 1.61
SNX15-206ENST00000529673 ABCC8Q09428 1581 aa25.07■■□□□ 1.6
SNX15-206ENST00000529673 CHD1O14646 1710 aa25.06■■□□□ 1.6
SNX15-206ENST00000529673 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SNX15-206ENST00000529673 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
SNX15-206ENST00000529673 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.99■■□□□ 1.59
SNX15-206ENST00000529673 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
SNX15-206ENST00000529673 FBLN2P98095 1184 aa24.95■■□□□ 1.58
SNX15-206ENST00000529673 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SNX15-206ENST00000529673 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SNX15-206ENST00000529673 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-206ENST00000529673 SYNJ1O43426 1573 aa24.76■■□□□ 1.55
SNX15-206ENST00000529673 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.73■■□□□ 1.55
SNX15-206ENST00000529673 WDR97A6NE52 1622 aa24.72■■□□□ 1.55
SNX15-206ENST00000529673 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SNX15-206ENST00000529673 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.7■■□□□ 1.55
SNX15-206ENST00000529673 SOGA1O94964 1423 aa24.69■■□□□ 1.54
SNX15-206ENST00000529673 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNX15-206ENST00000529673 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SNX15-206ENST00000529673 SYNJ2O15056 1496 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-206ENST00000529673 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-206ENST00000529673 GRIN2BQ13224 1484 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-206ENST00000529673 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX15-206ENST00000529673 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-206ENST00000529673 CUX1P39880 1505 aa24.4■■□□□ 1.5
SNX15-206ENST00000529673 PBRM1Q86U86 1689 aa24.4■■□□□ 1.5
SNX15-206ENST00000529673 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.3■■□□□ 1.48
SNX15-206ENST00000529673 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.28■■□□□ 1.48
SNX15-206ENST00000529673 GRIN2AQ12879 1464 aa24.26■■□□□ 1.47
SNX15-206ENST00000529673 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.26■■□□□ 1.47
SNX15-206ENST00000529673 CEP170Q5SW79 1584 aa24.25■■□□□ 1.47
SNX15-206ENST00000529673 NUP160Q12769 1436 aa24.21■■□□□ 1.47
SNX15-206ENST00000529673 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.2■■□□□ 1.46
SNX15-206ENST00000529673 SHROOM2Q13796 1616 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX15-206ENST00000529673 ADAMTS12P58397 1594 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX15-206ENST00000529673 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX15-206ENST00000529673 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX15-206ENST00000529673 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SNX15-206ENST00000529673 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX15-206ENST00000529673 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 MAPKBP1O60336 1514 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX15-206ENST00000529673 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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