RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527475.1

DTX4-202, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene DTX4, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-202ENST00000527475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.75■■□□□ 1.87
DTX4-202ENST00000527475 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.59■■□□□ 1.37
DTX4-202ENST00000527475 ABCC9O60706 1549 aa22.73■■□□□ 1.23
DTX4-202ENST00000527475 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
DTX4-202ENST00000527475 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.25■■□□□ 1.15
DTX4-202ENST00000527475 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.11■■□□□ 1.13
DTX4-202ENST00000527475 NACADO15069 1562 aa22.07■■□□□ 1.12
DTX4-202ENST00000527475 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
DTX4-202ENST00000527475 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.01■■□□□ 1.11
DTX4-202ENST00000527475 SCRIBQ14160 1630 aa21.64■■□□□ 1.05
DTX4-202ENST00000527475 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.52■■□□□ 1.03
DTX4-202ENST00000527475 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.51■■□□□ 1.03
DTX4-202ENST00000527475 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.31■■□□□ 1
DTX4-202ENST00000527475 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
DTX4-202ENST00000527475 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.81■□□□□ 0.92
DTX4-202ENST00000527475 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
DTX4-202ENST00000527475 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
DTX4-202ENST00000527475 SMARCA4P51532 1647 aa20.68■□□□□ 0.9
DTX4-202ENST00000527475 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.65■□□□□ 0.9
DTX4-202ENST00000527475 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.56■□□□□ 0.88
DTX4-202ENST00000527475 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
DTX4-202ENST00000527475 WIZO95785 1651 aa20.46■□□□□ 0.87
DTX4-202ENST00000527475 SMARCA2P51531 1590 aa20.45■□□□□ 0.86
DTX4-202ENST00000527475 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.44■□□□□ 0.86
DTX4-202ENST00000527475 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
DTX4-202ENST00000527475 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.42■□□□□ 0.86
DTX4-202ENST00000527475 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.41■□□□□ 0.86
DTX4-202ENST00000527475 NCAPD3P42695 1498 aa20.33■□□□□ 0.85
DTX4-202ENST00000527475 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
DTX4-202ENST00000527475 HMGXB3Q12766 1538 aa20.31■□□□□ 0.84
DTX4-202ENST00000527475 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
DTX4-202ENST00000527475 CCDC88BA6NC98 1476 aa20■□□□□ 0.79
DTX4-202ENST00000527475 NESP48681 1621 aa19.79■□□□□ 0.76
DTX4-202ENST00000527475 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.79■□□□□ 0.76
DTX4-202ENST00000527475 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.76■□□□□ 0.75
DTX4-202ENST00000527475 CFTRP13569 1480 aa19.76■□□□□ 0.75
DTX4-202ENST00000527475 PRDM2Q13029 1718 aa19.66■□□□□ 0.74
DTX4-202ENST00000527475 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.61■□□□□ 0.73
DTX4-202ENST00000527475 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.6■□□□□ 0.73
DTX4-202ENST00000527475 ERCC6Q03468 1493 aa19.57■□□□□ 0.72
DTX4-202ENST00000527475 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.56■□□□□ 0.72
DTX4-202ENST00000527475 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.54■□□□□ 0.72
DTX4-202ENST00000527475 ABCC8Q09428 1581 aa19.46■□□□□ 0.71
DTX4-202ENST00000527475 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.41■□□□□ 0.7
DTX4-202ENST00000527475 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
DTX4-202ENST00000527475 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
DTX4-202ENST00000527475 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
DTX4-202ENST00000527475 CUX1P39880 1505 aa19.35■□□□□ 0.69
DTX4-202ENST00000527475 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.35■□□□□ 0.69
DTX4-202ENST00000527475 TOPBP1Q92547 1522 aa19.33■□□□□ 0.68
DTX4-202ENST00000527475 SYNJ1O43426 1573 aa19.32■□□□□ 0.68
DTX4-202ENST00000527475 WDR62O43379 1518 aa19.32■□□□□ 0.68
DTX4-202ENST00000527475 TOP2BQ02880 1626 aa19.28■□□□□ 0.68
DTX4-202ENST00000527475 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.28■□□□□ 0.68
DTX4-202ENST00000527475 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.25■□□□□ 0.67
DTX4-202ENST00000527475 TRIM41Q8WV44 630 aa19.23■□□□□ 0.67
DTX4-202ENST00000527475 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.22■□□□□ 0.67
DTX4-202ENST00000527475 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
DTX4-202ENST00000527475 CUX2O14529 1486 aa19.15■□□□□ 0.66
DTX4-202ENST00000527475 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.13■□□□□ 0.65
DTX4-202ENST00000527475 SOGA1O94964 1423 aa19.11■□□□□ 0.65
DTX4-202ENST00000527475 IFT140Q96RY7 1462 aa19.09■□□□□ 0.65
DTX4-202ENST00000527475 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
DTX4-202ENST00000527475 WDR97A6NE52 1622 aa19.03■□□□□ 0.64
DTX4-202ENST00000527475 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.03■□□□□ 0.64
DTX4-202ENST00000527475 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
DTX4-202ENST00000527475 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
DTX4-202ENST00000527475 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 KIF27Q86VH2 1401 aa18.94■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.93■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.92■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.91■□□□□ 0.62
DTX4-202ENST00000527475 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
DTX4-202ENST00000527475 PBRM1Q86U86 1689 aa18.86■□□□□ 0.61
DTX4-202ENST00000527475 GRIN2BQ13224 1484 aa18.84■□□□□ 0.61
DTX4-202ENST00000527475 EEA1Q15075 1411 aa18.84■□□□□ 0.61
DTX4-202ENST00000527475 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.8■□□□□ 0.6
DTX4-202ENST00000527475 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.79■□□□□ 0.6
DTX4-202ENST00000527475 IGF1RP08069 1367 aa18.78■□□□□ 0.6
DTX4-202ENST00000527475 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.75■□□□□ 0.59
DTX4-202ENST00000527475 ADAMTS12P58397 1594 aa18.74■□□□□ 0.59
DTX4-202ENST00000527475 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
DTX4-202ENST00000527475 CUL7Q14999 1698 aa18.73■□□□□ 0.59
DTX4-202ENST00000527475 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.69■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.69■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 SYNJ2O15056 1496 aa18.67■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 PRXQ9BXM0 1461 aa18.66■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 FBLN2P98095 1184 aa18.66■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.66■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.65■□□□□ 0.58
DTX4-202ENST00000527475 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
DTX4-202ENST00000527475 KIF21BO75037 1637 aa18.63■□□□□ 0.57
DTX4-202ENST00000527475 CHD1O14646 1710 aa18.62■□□□□ 0.57
DTX4-202ENST00000527475 GRIN2AQ12879 1464 aa18.61■□□□□ 0.57
DTX4-202ENST00000527475 GOLGA3Q08378 1498 aa18.58■□□□□ 0.57
DTX4-202ENST00000527475 CEP170Q5SW79 1584 aa18.51■□□□□ 0.55
DTX4-202ENST00000527475 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.5■□□□□ 0.55
DTX4-202ENST00000527475 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
DTX4-202ENST00000527475 NUP160Q12769 1436 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms