RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526493.1

UBASH3B-204, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 3

Gene UBASH3B, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-204ENST00000526493 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.93■■■□□ 2.38
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UBASH3B-204ENST00000526493 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UBASH3B-204ENST00000526493 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
UBASH3B-204ENST00000526493 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.77■■□□□ 1.56
UBASH3B-204ENST00000526493 ABCC9O60706 1549 aa24.76■■□□□ 1.55
UBASH3B-204ENST00000526493 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.6■■□□□ 1.53
UBASH3B-204ENST00000526493 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.5■■□□□ 1.51
UBASH3B-204ENST00000526493 NACADO15069 1562 aa24.38■■□□□ 1.49
UBASH3B-204ENST00000526493 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.31■■□□□ 1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
UBASH3B-204ENST00000526493 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.19■■□□□ 1.46
UBASH3B-204ENST00000526493 SCRIBQ14160 1630 aa24.04■■□□□ 1.44
UBASH3B-204ENST00000526493 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.85■■□□□ 1.41
UBASH3B-204ENST00000526493 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.52■■□□□ 1.36
UBASH3B-204ENST00000526493 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
UBASH3B-204ENST00000526493 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UBASH3B-204ENST00000526493 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
UBASH3B-204ENST00000526493 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UBASH3B-204ENST00000526493 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.13■■□□□ 1.29
UBASH3B-204ENST00000526493 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UBASH3B-204ENST00000526493 SMARCA4P51532 1647 aa23.06■■□□□ 1.28
UBASH3B-204ENST00000526493 WIZO95785 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
UBASH3B-204ENST00000526493 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.79■■□□□ 1.24
UBASH3B-204ENST00000526493 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UBASH3B-204ENST00000526493 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UBASH3B-204ENST00000526493 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.66■■□□□ 1.22
UBASH3B-204ENST00000526493 SMARCA2P51531 1590 aa22.65■■□□□ 1.22
UBASH3B-204ENST00000526493 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBASH3B-204ENST00000526493 NCAPD3P42695 1498 aa22.47■■□□□ 1.19
UBASH3B-204ENST00000526493 HMGXB3Q12766 1538 aa22.47■■□□□ 1.19
UBASH3B-204ENST00000526493 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
UBASH3B-204ENST00000526493 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.44■■□□□ 1.18
UBASH3B-204ENST00000526493 PRDM2Q13029 1718 aa22■■□□□ 1.11
UBASH3B-204ENST00000526493 ABCC8Q09428 1581 aa21.96■■□□□ 1.11
UBASH3B-204ENST00000526493 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
UBASH3B-204ENST00000526493 CFTRP13569 1480 aa21.95■■□□□ 1.1
UBASH3B-204ENST00000526493 TRIM41Q8WV44 630 aa21.9■■□□□ 1.1
UBASH3B-204ENST00000526493 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.9■■□□□ 1.1
UBASH3B-204ENST00000526493 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.86■■□□□ 1.09
UBASH3B-204ENST00000526493 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 SYNJ1O43426 1573 aa21.77■■□□□ 1.08
UBASH3B-204ENST00000526493 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.76■■□□□ 1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 NESP48681 1621 aa21.73■■□□□ 1.07
UBASH3B-204ENST00000526493 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.7■■□□□ 1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 TOP2BQ02880 1626 aa21.69■■□□□ 1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 CUX1P39880 1505 aa21.65■■□□□ 1.06
UBASH3B-204ENST00000526493 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.64■■□□□ 1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UBASH3B-204ENST00000526493 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.56■■□□□ 1.04
UBASH3B-204ENST00000526493 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.52■■□□□ 1.04
UBASH3B-204ENST00000526493 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.52■■□□□ 1.03
UBASH3B-204ENST00000526493 SOGA1O94964 1423 aa21.49■■□□□ 1.03
UBASH3B-204ENST00000526493 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBASH3B-204ENST00000526493 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.48■■□□□ 1.03
UBASH3B-204ENST00000526493 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.45■■□□□ 1.02
UBASH3B-204ENST00000526493 EEA1Q15075 1411 aa21.43■■□□□ 1.02
UBASH3B-204ENST00000526493 TOPBP1Q92547 1522 aa21.42■■□□□ 1.02
UBASH3B-204ENST00000526493 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.41■■□□□ 1.02
UBASH3B-204ENST00000526493 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBASH3B-204ENST00000526493 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.39■■□□□ 1.01
UBASH3B-204ENST00000526493 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
UBASH3B-204ENST00000526493 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.29■■□□□ 1
UBASH3B-204ENST00000526493 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.28■■□□□ 1
UBASH3B-204ENST00000526493 WDR97A6NE52 1622 aa21.25■□□□□ 0.99
UBASH3B-204ENST00000526493 KIF27Q86VH2 1401 aa21.23■□□□□ 0.99
UBASH3B-204ENST00000526493 KIF21BO75037 1637 aa21.22■□□□□ 0.99
UBASH3B-204ENST00000526493 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.22■□□□□ 0.99
UBASH3B-204ENST00000526493 WDR62O43379 1518 aa21.21■□□□□ 0.99
UBASH3B-204ENST00000526493 CUX2O14529 1486 aa21.2■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 ERCC6Q03468 1493 aa21.2■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.2■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.17■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
UBASH3B-204ENST00000526493 GOLGA3Q08378 1498 aa21.13■□□□□ 0.97
UBASH3B-204ENST00000526493 PRXQ9BXM0 1461 aa21.1■□□□□ 0.97
UBASH3B-204ENST00000526493 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.08■□□□□ 0.97
UBASH3B-204ENST00000526493 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.08■□□□□ 0.96
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UBASH3B-204ENST00000526493 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.04■□□□□ 0.96
UBASH3B-204ENST00000526493 IFT140Q96RY7 1462 aa21■□□□□ 0.95
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UBASH3B-204ENST00000526493 PBRM1Q86U86 1689 aa20.99■□□□□ 0.95
UBASH3B-204ENST00000526493 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UBASH3B-204ENST00000526493 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
UBASH3B-204ENST00000526493 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBASH3B-204ENST00000526493 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.95■□□□□ 0.94
UBASH3B-204ENST00000526493 CEP162Q5TB80 1403 aa20.93■□□□□ 0.94
UBASH3B-204ENST00000526493 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
UBASH3B-204ENST00000526493 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
UBASH3B-204ENST00000526493 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBASH3B-204ENST00000526493 GRIN2BQ13224 1484 aa20.82■□□□□ 0.92
UBASH3B-204ENST00000526493 ADAMTS12P58397 1594 aa20.8■□□□□ 0.92
UBASH3B-204ENST00000526493 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.79■□□□□ 0.92
UBASH3B-204ENST00000526493 CLIP1P30622 1438 aa20.78■□□□□ 0.92
UBASH3B-204ENST00000526493 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.74■□□□□ 0.91
UBASH3B-204ENST00000526493 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.7■□□□□ 0.9
UBASH3B-204ENST00000526493 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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