RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525750.1

IRF7-208, Transcript of interferon regulatory factor 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF7, Length 656 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7-208ENST00000525750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.59■■■■■ 7.93
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IRF7-208ENST00000525750 NACADO15069 1562 aa53.89■■■■■ 6.22
IRF7-208ENST00000525750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.86■■■■■ 6.21
IRF7-208ENST00000525750 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.84■■■■■ 6.21
IRF7-208ENST00000525750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.8■■■■■ 6.2
IRF7-208ENST00000525750 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.72■■■■■ 6.19
IRF7-208ENST00000525750 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.54■■■■■ 6.16
IRF7-208ENST00000525750 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.49■■■■■ 5.99
IRF7-208ENST00000525750 SCRIBQ14160 1630 aa52.2■■■■■ 5.95
IRF7-208ENST00000525750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.12■■■■■ 5.93
IRF7-208ENST00000525750 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.11■■■■■ 5.93
IRF7-208ENST00000525750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.81■■■■■ 5.88
IRF7-208ENST00000525750 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.9■■■■■ 5.74
IRF7-208ENST00000525750 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
IRF7-208ENST00000525750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.47■■■■■ 5.67
IRF7-208ENST00000525750 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.2■■■■■ 5.63
IRF7-208ENST00000525750 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.08■■■■■ 5.61
IRF7-208ENST00000525750 SMARCA4P51532 1647 aa50.03■■■■■ 5.6
IRF7-208ENST00000525750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.73■■■■■ 5.55
IRF7-208ENST00000525750 SMARCA2P51531 1590 aa49.73■■■■■ 5.55
IRF7-208ENST00000525750 NCAPD3P42695 1498 aa49.72■■■■■ 5.55
IRF7-208ENST00000525750 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.7■■■■■ 5.55
IRF7-208ENST00000525750 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.61■■■■■ 5.53
IRF7-208ENST00000525750 HMGXB3Q12766 1538 aa49.48■■■■■ 5.51
IRF7-208ENST00000525750 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.33■■■■■ 5.49
IRF7-208ENST00000525750 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.27■■■■■ 5.48
IRF7-208ENST00000525750 WIZO95785 1651 aa49.16■■■■■ 5.46
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IRF7-208ENST00000525750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.35■■■■■ 5.33
IRF7-208ENST00000525750 NESP48681 1621 aa48.28■■■■■ 5.32
IRF7-208ENST00000525750 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.27■■■■■ 5.32
IRF7-208ENST00000525750 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
IRF7-208ENST00000525750 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.14■■■■■ 5.3
IRF7-208ENST00000525750 ERCC6Q03468 1493 aa48.1■■■■■ 5.29
IRF7-208ENST00000525750 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.06■■■■■ 5.28
IRF7-208ENST00000525750 CFTRP13569 1480 aa48.03■■■■■ 5.28
IRF7-208ENST00000525750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.73■■■■■ 5.23
IRF7-208ENST00000525750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.66■■■■■ 5.22
IRF7-208ENST00000525750 PRDM2Q13029 1718 aa47.63■■■■■ 5.22
IRF7-208ENST00000525750 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.6■■■■■ 5.21
IRF7-208ENST00000525750 CUX2O14529 1486 aa47.58■■■■■ 5.21
IRF7-208ENST00000525750 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
IRF7-208ENST00000525750 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.48■■■■■ 5.19
IRF7-208ENST00000525750 WDR62O43379 1518 aa47.3■■■■■ 5.16
IRF7-208ENST00000525750 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
IRF7-208ENST00000525750 ABCC8Q09428 1581 aa47.08■■■■■ 5.13
IRF7-208ENST00000525750 TOPBP1Q92547 1522 aa46.93■■■■■ 5.1
IRF7-208ENST00000525750 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.91■■■■■ 5.1
IRF7-208ENST00000525750 IFT140Q96RY7 1462 aa46.63■■■■■ 5.05
IRF7-208ENST00000525750 CUX1P39880 1505 aa46.62■■■■■ 5.05
IRF7-208ENST00000525750 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
IRF7-208ENST00000525750 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.49■■■■■ 5.03
IRF7-208ENST00000525750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.45■■■■■ 5.03
IRF7-208ENST00000525750 SOGA1O94964 1423 aa46.39■■■■■ 5.02
IRF7-208ENST00000525750 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
IRF7-208ENST00000525750 TOP2BQ02880 1626 aa46.35■■■■■ 5.01
IRF7-208ENST00000525750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.32■■■■■ 5.01
IRF7-208ENST00000525750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.28■■■■■ 5
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IRF7-208ENST00000525750 SYNJ1O43426 1573 aa46.26■■■■■ 5
IRF7-208ENST00000525750 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.23■■■■■ 4.99
IRF7-208ENST00000525750 WDR97A6NE52 1622 aa46.17■■■■■ 4.98
IRF7-208ENST00000525750 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
IRF7-208ENST00000525750 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.08■■■■■ 4.97
IRF7-208ENST00000525750 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.07■■■■■ 4.972e-7■■□□□ 12.5
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IRF7-208ENST00000525750 GRIN2BQ13224 1484 aa45.84■■■■■ 4.93
IRF7-208ENST00000525750 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.81■■■■■ 4.92
IRF7-208ENST00000525750 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
IRF7-208ENST00000525750 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.67■■■■■ 4.9
IRF7-208ENST00000525750 PBRM1Q86U86 1689 aa45.66■■■■■ 4.9
IRF7-208ENST00000525750 OSCARQ8IYS5 282 aa45.66■■■■■ 4.9
IRF7-208ENST00000525750 TRIM41Q8WV44 630 aa45.58■■■■■ 4.89
IRF7-208ENST00000525750 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.55■■■■■ 4.88
IRF7-208ENST00000525750 KIF27Q86VH2 1401 aa45.54■■■■■ 4.88
IRF7-208ENST00000525750 SYNJ2O15056 1496 aa45.5■■■■■ 4.87
IRF7-208ENST00000525750 FBLN2P98095 1184 aa45.5■■■■■ 4.87
IRF7-208ENST00000525750 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
IRF7-208ENST00000525750 CHD1O14646 1710 aa45.46■■■■■ 4.87
IRF7-208ENST00000525750 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.37■■■■■ 4.85
IRF7-208ENST00000525750 ADAMTS12P58397 1594 aa45.35■■■■■ 4.85
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IRF7-208ENST00000525750 GRIN2AQ12879 1464 aa45.22■■■■■ 4.83
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IRF7-208ENST00000525750 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.13■■■■■ 4.82
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IRF7-208ENST00000525750 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.04■■■■■ 4.8
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IRF7-208ENST00000525750 NUP160Q12769 1436 aa45.02■■■■■ 4.8
IRF7-208ENST00000525750 CEP170Q5SW79 1584 aa44.92■■■■■ 4.78
IRF7-208ENST00000525750 EEA1Q15075 1411 aa44.9■■■■■ 4.78
IRF7-208ENST00000525750 ARHGEF11O15085 1522 aa44.82■■■■■ 4.77
IRF7-208ENST00000525750 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.8■■■■■ 4.76
IRF7-208ENST00000525750 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
IRF7-208ENST00000525750 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
IRF7-208ENST00000525750 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
IRF7-208ENST00000525750 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.74■■■■■ 4.75
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