RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523337.5

NDUFAF6-217, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6, humanhuman

TSL 3

Gene NDUFAF6, Length 796 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6-217ENST00000523337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.97
NDUFAF6-217ENST00000523337 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52■■■■■ 5.92
NDUFAF6-217ENST00000523337 ABCC9O60706 1549 aa50.85■■■■■ 5.73
NDUFAF6-217ENST00000523337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.08■■■■■ 5.45
NDUFAF6-217ENST00000523337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.94■■■■■ 5.43
NDUFAF6-217ENST00000523337 NACADO15069 1562 aa48.93■■■■■ 5.42
NDUFAF6-217ENST00000523337 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
NDUFAF6-217ENST00000523337 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.65■■■■■ 5.38
NDUFAF6-217ENST00000523337 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.48■■■■■ 5.35
NDUFAF6-217ENST00000523337 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.83■■■■■ 5.25
NDUFAF6-217ENST00000523337 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.61■■■■■ 5.21
NDUFAF6-217ENST00000523337 SCRIBQ14160 1630 aa47.47■■■■■ 5.19
NDUFAF6-217ENST00000523337 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.45■■■■■ 5.19
NDUFAF6-217ENST00000523337 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
NDUFAF6-217ENST00000523337 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.67■■■■■ 5.06
NDUFAF6-217ENST00000523337 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
NDUFAF6-217ENST00000523337 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.99■■■■■ 4.95
NDUFAF6-217ENST00000523337 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
NDUFAF6-217ENST00000523337 SMARCA4P51532 1647 aa45.42■■■■■ 4.86
NDUFAF6-217ENST00000523337 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
NDUFAF6-217ENST00000523337 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.19■■■■■ 4.82
NDUFAF6-217ENST00000523337 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
NDUFAF6-217ENST00000523337 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.17■■■■■ 4.82
NDUFAF6-217ENST00000523337 SMARCA2P51531 1590 aa45.13■■■■■ 4.82
NDUFAF6-217ENST00000523337 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.98■■■■■ 4.79
NDUFAF6-217ENST00000523337 HMGXB3Q12766 1538 aa44.89■■■■■ 4.78
NDUFAF6-217ENST00000523337 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
NDUFAF6-217ENST00000523337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
NDUFAF6-217ENST00000523337 WIZO95785 1651 aa44.69■■■■■ 4.74
NDUFAF6-217ENST00000523337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
NDUFAF6-217ENST00000523337 NESP48681 1621 aa44.03■■■■■ 4.64
NDUFAF6-217ENST00000523337 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.92■■■■■ 4.62
NDUFAF6-217ENST00000523337 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.88■■■■■ 4.61
NDUFAF6-217ENST00000523337 ERCC6Q03468 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
NDUFAF6-217ENST00000523337 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
NDUFAF6-217ENST00000523337 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.73■■■■■ 4.59
NDUFAF6-217ENST00000523337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.68■■■■■ 4.58
NDUFAF6-217ENST00000523337 CFTRP13569 1480 aa43.61■■■■■ 4.57
NDUFAF6-217ENST00000523337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.48■■■■■ 4.55
NDUFAF6-217ENST00000523337 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.33■■■■■ 4.53
NDUFAF6-217ENST00000523337 CUX2O14529 1486 aa43.3■■■■■ 4.52
NDUFAF6-217ENST00000523337 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
NDUFAF6-217ENST00000523337 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.25■■■■■ 4.51
NDUFAF6-217ENST00000523337 PRDM2Q13029 1718 aa43.23■■■■■ 4.51
NDUFAF6-217ENST00000523337 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.17■■■■■ 4.5
NDUFAF6-217ENST00000523337 WDR62O43379 1518 aa43■■■■■ 4.47
NDUFAF6-217ENST00000523337 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
NDUFAF6-217ENST00000523337 ABCC8Q09428 1581 aa42.69■■■■■ 4.43
NDUFAF6-217ENST00000523337 TOPBP1Q92547 1522 aa42.65■■■■■ 4.42
NDUFAF6-217ENST00000523337 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.58■■■■■ 4.41
NDUFAF6-217ENST00000523337 IFT140Q96RY7 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
NDUFAF6-217ENST00000523337 CUX1P39880 1505 aa42.36■■■■■ 4.37
NDUFAF6-217ENST00000523337 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
NDUFAF6-217ENST00000523337 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.19■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 SOGA1O94964 1423 aa42.19■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.15■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.13■■■■■ 4.34
NDUFAF6-217ENST00000523337 TOP2BQ02880 1626 aa42.02■■■■■ 4.32
NDUFAF6-217ENST00000523337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.99■■■■■ 4.31
NDUFAF6-217ENST00000523337 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
NDUFAF6-217ENST00000523337 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.98■■■■■ 4.31
NDUFAF6-217ENST00000523337 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.31
NDUFAF6-217ENST00000523337 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
NDUFAF6-217ENST00000523337 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
NDUFAF6-217ENST00000523337 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
NDUFAF6-217ENST00000523337 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.8■■■■■ 4.28
NDUFAF6-217ENST00000523337 OSCARQ8IYS5 282 aa41.67■■■■■ 4.26
NDUFAF6-217ENST00000523337 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.66■■■■■ 4.26
NDUFAF6-217ENST00000523337 GRIN2BQ13224 1484 aa41.63■■■■■ 4.25
NDUFAF6-217ENST00000523337 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.58■■■■■ 4.25
NDUFAF6-217ENST00000523337 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
NDUFAF6-217ENST00000523337 FBLN2P98095 1184 aa41.52■■■■■ 4.24
NDUFAF6-217ENST00000523337 PBRM1Q86U86 1689 aa41.5■■■■■ 4.23
NDUFAF6-217ENST00000523337 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
NDUFAF6-217ENST00000523337 CHD1O14646 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
NDUFAF6-217ENST00000523337 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
NDUFAF6-217ENST00000523337 SYNJ2O15056 1496 aa41.34■■■■■ 4.21
NDUFAF6-217ENST00000523337 TRIM41Q8WV44 630 aa41.33■■■■■ 4.21
NDUFAF6-217ENST00000523337 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
NDUFAF6-217ENST00000523337 KIF27Q86VH2 1401 aa41.28■■■■■ 4.2
NDUFAF6-217ENST00000523337 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.18■■■■■ 4.18
NDUFAF6-217ENST00000523337 ADAMTS12P58397 1594 aa41.16■■■■■ 4.18
NDUFAF6-217ENST00000523337 IGF1RP08069 1367 aa41.15■■■■■ 4.18
NDUFAF6-217ENST00000523337 GRIN2AQ12879 1464 aa41.08■■■■■ 4.17
NDUFAF6-217ENST00000523337 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.96■■■■■ 4.15
NDUFAF6-217ENST00000523337 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.93■■■■■ 4.14
NDUFAF6-217ENST00000523337 CUL7Q14999 1698 aa40.92■■■■■ 4.14
NDUFAF6-217ENST00000523337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.89■■■■■ 4.14
NDUFAF6-217ENST00000523337 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.89■■■■■ 4.14
NDUFAF6-217ENST00000523337 NUP160Q12769 1436 aa40.89■■■■■ 4.14
NDUFAF6-217ENST00000523337 ARHGEF11O15085 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
NDUFAF6-217ENST00000523337 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
NDUFAF6-217ENST00000523337 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
NDUFAF6-217ENST00000523337 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.85■■■■■ 4.13
NDUFAF6-217ENST00000523337 CEP170Q5SW79 1584 aa40.84■■■■■ 4.13
NDUFAF6-217ENST00000523337 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.63■■■■■ 4.09
NDUFAF6-217ENST00000523337 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.6■■■■■ 4.09
NDUFAF6-217ENST00000523337 JPH4Q96JJ6 628 aa40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms