RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523167.1

RNF19A-211, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 4

Gene RNF19A, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19A-211ENST00000523167 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.28■■■■■ 7.08
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RNF19A-211ENST00000523167 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.57■■■■■ 5.53
RNF19A-211ENST00000523167 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.25■■■■■ 5.47
RNF19A-211ENST00000523167 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.12■■■■■ 5.45
RNF19A-211ENST00000523167 NACADO15069 1562 aa49.03■■■■■ 5.44
RNF19A-211ENST00000523167 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.02■■■■■ 5.44
RNF19A-211ENST00000523167 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.88■■■■■ 5.42
RNF19A-211ENST00000523167 SCRIBQ14160 1630 aa47.79■■■■■ 5.24
RNF19A-211ENST00000523167 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.6■■■■■ 5.21
RNF19A-211ENST00000523167 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.35■■■■■ 5.17
RNF19A-211ENST00000523167 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.25■■■■■ 5.15
RNF19A-211ENST00000523167 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.22■■■■■ 5.15
RNF19A-211ENST00000523167 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.03■■■■■ 4.96
RNF19A-211ENST00000523167 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
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RNF19A-211ENST00000523167 SMARCA4P51532 1647 aa45.8■■■■■ 4.92
RNF19A-211ENST00000523167 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.66■■■■■ 4.9
RNF19A-211ENST00000523167 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.58■■■■■ 4.89
RNF19A-211ENST00000523167 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
RNF19A-211ENST00000523167 SMARCA2P51531 1590 aa45.39■■■■■ 4.86
RNF19A-211ENST00000523167 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.36■■■■■ 4.85
RNF19A-211ENST00000523167 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.36■■■■■ 4.85
RNF19A-211ENST00000523167 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.34■■■■■ 4.85
RNF19A-211ENST00000523167 NCAPD3P42695 1498 aa45.22■■■■■ 4.83
RNF19A-211ENST00000523167 WIZO95785 1651 aa45.19■■■■■ 4.83
RNF19A-211ENST00000523167 HMGXB3Q12766 1538 aa45.08■■■■■ 4.81
RNF19A-211ENST00000523167 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
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RNF19A-211ENST00000523167 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.28■■■■■ 4.68
RNF19A-211ENST00000523167 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.96■■■■■ 4.63
RNF19A-211ENST00000523167 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.89■■■■■ 4.62
RNF19A-211ENST00000523167 CFTRP13569 1480 aa43.86■■■■■ 4.61
RNF19A-211ENST00000523167 NESP48681 1621 aa43.8■■■■■ 4.6
RNF19A-211ENST00000523167 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.63■■■■■ 4.57
RNF19A-211ENST00000523167 PRDM2Q13029 1718 aa43.53■■■■■ 4.56
RNF19A-211ENST00000523167 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.45■■■■■ 4.55
RNF19A-211ENST00000523167 ERCC6Q03468 1493 aa43.44■■■■■ 4.54
RNF19A-211ENST00000523167 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.34■■■■■ 4.53
RNF19A-211ENST00000523167 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.28■■■■■ 4.52
RNF19A-211ENST00000523167 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.08■■■■■ 4.49
RNF19A-211ENST00000523167 ABCC8Q09428 1581 aa42.96■■■■■ 4.47
RNF19A-211ENST00000523167 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
RNF19A-211ENST00000523167 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.46
RNF19A-211ENST00000523167 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
RNF19A-211ENST00000523167 WDR62O43379 1518 aa42.88■■■■■ 4.46
RNF19A-211ENST00000523167 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.86■■■■■ 4.45
RNF19A-211ENST00000523167 TOPBP1Q92547 1522 aa42.83■■■■■ 4.45
RNF19A-211ENST00000523167 CUX1P39880 1505 aa42.8■■■■■ 4.44
RNF19A-211ENST00000523167 TOP2BQ02880 1626 aa42.68■■■■■ 4.42
RNF19A-211ENST00000523167 SYNJ1O43426 1573 aa42.67■■■■■ 4.42
RNF19A-211ENST00000523167 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.64■■■■■ 4.42
RNF19A-211ENST00000523167 CUX2O14529 1486 aa42.63■■■■■ 4.42
RNF19A-211ENST00000523167 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
RNF19A-211ENST00000523167 TRIM41Q8WV44 630 aa42.54■■■■■ 4.4
RNF19A-211ENST00000523167 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
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RNF19A-211ENST00000523167 SOGA1O94964 1423 aa42.4■■■■■ 4.38
RNF19A-211ENST00000523167 IFT140Q96RY7 1462 aa42.39■■■■■ 4.38
RNF19A-211ENST00000523167 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
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RNF19A-211ENST00000523167 WDR97A6NE52 1622 aa42.09■■■■■ 4.33
RNF19A-211ENST00000523167 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
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RNF19A-211ENST00000523167 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.92■■■■■ 4.3
RNF19A-211ENST00000523167 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.91■■■■■ 4.3
RNF19A-211ENST00000523167 GRIN2BQ13224 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
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RNF19A-211ENST00000523167 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.72■■■■■ 4.27
RNF19A-211ENST00000523167 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.72■■■■■ 4.27
RNF19A-211ENST00000523167 PBRM1Q86U86 1689 aa41.71■■■■■ 4.27
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RNF19A-211ENST00000523167 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
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RNF19A-211ENST00000523167 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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RNF19A-211ENST00000523167 ADAMTS12P58397 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
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RNF19A-211ENST00000523167 SYNJ2O15056 1496 aa41.43■■■■■ 4.22
RNF19A-211ENST00000523167 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
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RNF19A-211ENST00000523167 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.3■■■■■ 4.2
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RNF19A-211ENST00000523167 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
RNF19A-211ENST00000523167 KIF21BO75037 1637 aa41.2■■■■■ 4.19
RNF19A-211ENST00000523167 GOLGA3Q08378 1498 aa41.08■■■■■ 4.17
RNF19A-211ENST00000523167 OSCARQ8IYS5 282 aa41.05■■■■■ 4.16
RNF19A-211ENST00000523167 NUP160Q12769 1436 aa41.02■■■■■ 4.16
RNF19A-211ENST00000523167 CEP170Q5SW79 1584 aa40.95■■■■■ 4.15
RNF19A-211ENST00000523167 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.94■■■■■ 4.14
RNF19A-211ENST00000523167 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
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