RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522553.5

KALRN-222, Transcript of kalirin RhoGEF kinase, human

TSL 2

Gene KALRN, Length 858 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KALRN-222	ENST00000522553	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.65	■■■■■ 4.26
KALRN-222	ENST00000522553	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.81	■■■■□ 3.48
KALRN-222	ENST00000522553	ABCC9	O60706	1549 aa		35.54	■■■■□ 3.28
KALRN-222	ENST00000522553	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.81	■■■■□ 3.16
KALRN-222	ENST00000522553	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.66	■■■■□ 3.14
KALRN-222	ENST00000522553	NACAD	O15069	1562 aa		34.48	■■■■□ 3.11
KALRN-222	ENST00000522553	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.47	■■■■□ 3.11
KALRN-222	ENST00000522553	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.42	■■■■□ 3.1
KALRN-222	ENST00000522553	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.4	■■■■□ 3.1
KALRN-222	ENST00000522553	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.65	■■■□□ 2.98
KALRN-222	ENST00000522553	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.62	■■■□□ 2.97
KALRN-222	ENST00000522553	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.32	■■■□□ 2.92
KALRN-222	ENST00000522553	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.31	■■■□□ 2.92
KALRN-222	ENST00000522553	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.27	■■■□□ 2.92
KALRN-222	ENST00000522553	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
KALRN-222	ENST00000522553	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.39	■■■□□ 2.78
KALRN-222	ENST00000522553	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
KALRN-222	ENST00000522553	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KALRN-222	ENST00000522553	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.16	■■■□□ 2.74
KALRN-222	ENST00000522553	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KALRN-222	ENST00000522553	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KALRN-222	ENST00000522553	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
KALRN-222	ENST00000522553	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KALRN-222	ENST00000522553	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KALRN-222	ENST00000522553	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.88	■■■□□ 2.69
KALRN-222	ENST00000522553	WIZ	O95785	1651 aa		31.81	■■■□□ 2.68
KALRN-222	ENST00000522553	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KALRN-222	ENST00000522553	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.7	■■■□□ 2.67
KALRN-222	ENST00000522553	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.66
KALRN-222	ENST00000522553	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
KALRN-222	ENST00000522553	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
KALRN-222	ENST00000522553	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.12	■■■□□ 2.57
KALRN-222	ENST00000522553	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.92	■■■□□ 2.54
KALRN-222	ENST00000522553	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.9	■■■□□ 2.54
KALRN-222	ENST00000522553	NES	P48681	1621 aa		30.9	■■■□□ 2.54
KALRN-222	ENST00000522553	CFTR	P13569	1480 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KALRN-222	ENST00000522553	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.68	■■■□□ 2.5
KALRN-222	ENST00000522553	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.67	■■■□□ 2.5
KALRN-222	ENST00000522553	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.62	■■■□□ 2.49
KALRN-222	ENST00000522553	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.57	■■■□□ 2.48
KALRN-222	ENST00000522553	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.56	■■■□□ 2.48
KALRN-222	ENST00000522553	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.5	■■■□□ 2.47
KALRN-222	ENST00000522553	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KALRN-222	ENST00000522553	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.31	■■■□□ 2.44
KALRN-222	ENST00000522553	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.22	■■■□□ 2.43
KALRN-222	ENST00000522553	WDR62	O43379	1518 aa		30.21	■■■□□ 2.43
KALRN-222	ENST00000522553	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.17	■■■□□ 2.42
KALRN-222	ENST00000522553	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.15	■■■□□ 2.42
KALRN-222	ENST00000522553	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.14	■■■□□ 2.42
KALRN-222	ENST00000522553	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.12	■■■□□ 2.41
KALRN-222	ENST00000522553	CUX1	P39880	1505 aa		30.1	■■■□□ 2.41
KALRN-222	ENST00000522553	CUX2	O14529	1486 aa		30.07	■■■□□ 2.4
KALRN-222	ENST00000522553	SYNJ1	O43426	1573 aa		30	■■■□□ 2.39
KALRN-222	ENST00000522553	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.99	■■■□□ 2.39
KALRN-222	ENST00000522553	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.97	■■■□□ 2.39
KALRN-222	ENST00000522553	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.93	■■■□□ 2.38
KALRN-222	ENST00000522553	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
KALRN-222	ENST00000522553	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.83	■■■□□ 2.37
KALRN-222	ENST00000522553	SOGA1	O94964	1423 aa		29.81	■■■□□ 2.36
KALRN-222	ENST00000522553	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.79	■■■□□ 2.36
KALRN-222	ENST00000522553	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.79	■■■□□ 2.36
KALRN-222	ENST00000522553	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
KALRN-222	ENST00000522553	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.74	■■■□□ 2.35
KALRN-222	ENST00000522553	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.65	■■■□□ 2.34
KALRN-222	ENST00000522553	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.64	■■■□□ 2.34
KALRN-222	ENST00000522553	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
KALRN-222	ENST00000522553	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
KALRN-222	ENST00000522553	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
KALRN-222	ENST00000522553	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.55	■■■□□ 2.32
KALRN-222	ENST00000522553	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.49	■■■□□ 2.31
KALRN-222	ENST00000522553	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.48	■■■□□ 2.31
KALRN-222	ENST00000522553	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.45	■■■□□ 2.3
KALRN-222	ENST00000522553	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.4	■■■□□ 2.3
KALRN-222	ENST00000522553	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.39	■■■□□ 2.3
KALRN-222	ENST00000522553	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.32	■■■□□ 2.28
KALRN-222	ENST00000522553	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.31	■■■□□ 2.28
KALRN-222	ENST00000522553	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.29	■■■□□ 2.28
KALRN-222	ENST00000522553	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
KALRN-222	ENST00000522553	IGF1R	P08069	1367 aa		29.25	■■■□□ 2.27
KALRN-222	ENST00000522553	EEA1	Q15075	1411 aa		29.23	■■■□□ 2.27
KALRN-222	ENST00000522553	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
KALRN-222	ENST00000522553	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.18	■■■□□ 2.26
KALRN-222	ENST00000522553	CUL7	Q14999	1698 aa		29.16	■■■□□ 2.26
KALRN-222	ENST00000522553	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.15	■■■□□ 2.26
KALRN-222	ENST00000522553	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.15	■■■□□ 2.26
KALRN-222	ENST00000522553	FBLN2	P98095	1184 aa		29.13	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.12	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.1	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	CHD1	O14646	1710 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.09	■■■□□ 2.25
KALRN-222	ENST00000522553	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.02	■■■□□ 2.24
KALRN-222	ENST00000522553	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.99	■■■□□ 2.23
KALRN-222	ENST00000522553	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.98	■■■□□ 2.23
KALRN-222	ENST00000522553	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.94	■■■□□ 2.22
KALRN-222	ENST00000522553	KIF21B	O75037	1637 aa		28.88	■■■□□ 2.21
KALRN-222	ENST00000522553	NUP160	Q12769	1436 aa		28.86	■■■□□ 2.21
KALRN-222	ENST00000522553	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.85	■■■□□ 2.21
KALRN-222	ENST00000522553	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.77	■■■□□ 2.2
KALRN-222	ENST00000522553	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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