RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520999.6

TSPAN18-209, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN18, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN18-209ENST00000520999 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.73■■■□□ 2.83
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TSPAN18-209ENST00000520999 SMARCA2P51531 1590 aa32.44■■■□□ 2.78
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TSPAN18-209ENST00000520999 NCAPD3P42695 1498 aa32.32■■■□□ 2.76
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TSPAN18-209ENST00000520999 SYNJ1O43426 1573 aa30.62■■■□□ 2.49
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TSPAN18-209ENST00000520999 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TSPAN18-209ENST00000520999 WDR97A6NE52 1622 aa30.08■■■□□ 2.41
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TSPAN18-209ENST00000520999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.73■■■□□ 2.35
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TSPAN18-209ENST00000520999 SYNJ2O15056 1496 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPAN18-209ENST00000520999 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TSPAN18-209ENST00000520999 GRIN2AQ12879 1464 aa29.43■■■□□ 2.3
TSPAN18-209ENST00000520999 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.41■■■□□ 2.3
TSPAN18-209ENST00000520999 NUP160Q12769 1436 aa29.32■■■□□ 2.28
TSPAN18-209ENST00000520999 FBLN2P98095 1184 aa29.3■■■□□ 2.28
TSPAN18-209ENST00000520999 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.3■■■□□ 2.28
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