RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519335.5

BIN3-204, Transcript of bridging integrator 3, humanhuman

TSL 3

Gene BIN3, Length 893 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3-204ENST00000519335 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.39■■■□□ 2.78
BIN3-204ENST00000519335 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.78■■■□□ 2.2
BIN3-204ENST00000519335 ABCC9O60706 1549 aa28.59■■■□□ 2.17
BIN3-204ENST00000519335 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.28■■□□□ 1.96
BIN3-204ENST00000519335 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.23■■□□□ 1.95
BIN3-204ENST00000519335 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.13■■□□□ 1.93
BIN3-204ENST00000519335 NACADO15069 1562 aa27.05■■□□□ 1.92
BIN3-204ENST00000519335 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
BIN3-204ENST00000519335 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.8■■□□□ 1.88
BIN3-204ENST00000519335 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.72■■□□□ 1.87
BIN3-204ENST00000519335 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
BIN3-204ENST00000519335 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.5■■□□□ 1.83
BIN3-204ENST00000519335 SCRIBQ14160 1630 aa26.39■■□□□ 1.81
BIN3-204ENST00000519335 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.24■■□□□ 1.79
BIN3-204ENST00000519335 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
BIN3-204ENST00000519335 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
BIN3-204ENST00000519335 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.78■■□□□ 1.72
BIN3-204ENST00000519335 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
BIN3-204ENST00000519335 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.32■■□□□ 1.64
BIN3-204ENST00000519335 SMARCA4P51532 1647 aa25.15■■□□□ 1.62
BIN3-204ENST00000519335 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
BIN3-204ENST00000519335 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25■■□□□ 1.59
BIN3-204ENST00000519335 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.99■■□□□ 1.59
BIN3-204ENST00000519335 SMARCA2P51531 1590 aa24.98■■□□□ 1.59
BIN3-204ENST00000519335 NCAPD3P42695 1498 aa24.94■■□□□ 1.58
BIN3-204ENST00000519335 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
BIN3-204ENST00000519335 HMGXB3Q12766 1538 aa24.84■■□□□ 1.57
BIN3-204ENST00000519335 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.82■■□□□ 1.56
BIN3-204ENST00000519335 CUX2O14529 1486 aa24.8■■□□□ 1.56
BIN3-204ENST00000519335 WIZO95785 1651 aa24.76■■□□□ 1.55
BIN3-204ENST00000519335 ERCC6Q03468 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
BIN3-204ENST00000519335 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
BIN3-204ENST00000519335 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
BIN3-204ENST00000519335 NESP48681 1621 aa24.44■■□□□ 1.5
BIN3-204ENST00000519335 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.33■■□□□ 1.48
BIN3-204ENST00000519335 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
BIN3-204ENST00000519335 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.26■■□□□ 1.47
BIN3-204ENST00000519335 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
BIN3-204ENST00000519335 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.19■■□□□ 1.46
BIN3-204ENST00000519335 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
BIN3-204ENST00000519335 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.15■■□□□ 1.46
BIN3-204ENST00000519335 CFTRP13569 1480 aa24.09■■□□□ 1.45
BIN3-204ENST00000519335 TRIM41Q8WV44 630 aa24.03■■□□□ 1.44
BIN3-204ENST00000519335 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.02■■□□□ 1.44
BIN3-204ENST00000519335 CEP164Q9UPV0 1460 aa24■■□□□ 1.43
BIN3-204ENST00000519335 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.94■■□□□ 1.42
BIN3-204ENST00000519335 PRDM2Q13029 1718 aa23.94■■□□□ 1.42
BIN3-204ENST00000519335 WDR62O43379 1518 aa23.82■■□□□ 1.4
BIN3-204ENST00000519335 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
BIN3-204ENST00000519335 OSCARQ8IYS5 282 aa23.67■■□□□ 1.38
BIN3-204ENST00000519335 TOPBP1Q92547 1522 aa23.63■■□□□ 1.37
BIN3-204ENST00000519335 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.6■■□□□ 1.37
BIN3-204ENST00000519335 ABCC8Q09428 1581 aa23.59■■□□□ 1.37
BIN3-204ENST00000519335 IFT140Q96RY7 1462 aa23.47■■□□□ 1.35
BIN3-204ENST00000519335 CUX1P39880 1505 aa23.44■■□□□ 1.34
BIN3-204ENST00000519335 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
BIN3-204ENST00000519335 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.4■■□□□ 1.34
BIN3-204ENST00000519335 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.36■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 SOGA1O94964 1423 aa23.35■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.33■■□□□ 1.33
BIN3-204ENST00000519335 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
BIN3-204ENST00000519335 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
BIN3-204ENST00000519335 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.324e-8■■■■■ 34.1
BIN3-204ENST00000519335 SYNJ1O43426 1573 aa23.27■■□□□ 1.32
BIN3-204ENST00000519335 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
BIN3-204ENST00000519335 TOP2BQ02880 1626 aa23.24■■□□□ 1.31
BIN3-204ENST00000519335 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.22■■□□□ 1.31
BIN3-204ENST00000519335 ARHGEF11O15085 1522 aa23.22■■□□□ 1.31
BIN3-204ENST00000519335 WDR97A6NE52 1622 aa23.15■■□□□ 1.3
BIN3-204ENST00000519335 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.14■■□□□ 1.29
BIN3-204ENST00000519335 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.12■■□□□ 1.29
BIN3-204ENST00000519335 FBLN2P98095 1184 aa23.11■■□□□ 1.29
BIN3-204ENST00000519335 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.07■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 GRIN2BQ13224 1484 aa23.06■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.06■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 PBRM1Q86U86 1689 aa23.04■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.03■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 CHD1O14646 1710 aa23.02■■□□□ 1.28
BIN3-204ENST00000519335 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
BIN3-204ENST00000519335 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
BIN3-204ENST00000519335 ARAP1Q96P48 1450 aa22.96■■□□□ 1.27
BIN3-204ENST00000519335 SYNJ2O15056 1496 aa22.91■■□□□ 1.26
BIN3-204ENST00000519335 KIF27Q86VH2 1401 aa22.84■■□□□ 1.25
BIN3-204ENST00000519335 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.84■■□□□ 1.25
BIN3-204ENST00000519335 ADAMTS12P58397 1594 aa22.84■■□□□ 1.25
BIN3-204ENST00000519335 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.8■■□□□ 1.24
BIN3-204ENST00000519335 GRIN2AQ12879 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
BIN3-204ENST00000519335 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.72■■□□□ 1.23
BIN3-204ENST00000519335 IGF1RP08069 1367 aa22.7■■□□□ 1.22
BIN3-204ENST00000519335 CUL7Q14999 1698 aa22.68■■□□□ 1.22
BIN3-204ENST00000519335 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
BIN3-204ENST00000519335 CEP170Q5SW79 1584 aa22.66■■□□□ 1.22
BIN3-204ENST00000519335 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
BIN3-204ENST00000519335 NUP160Q12769 1436 aa22.61■■□□□ 1.21
BIN3-204ENST00000519335 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms