RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.51■■■■□ 3.12
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.62■■■□□ 2.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC9O60706 1549 aa30.32■■■□□ 2.44
PDGFRB-202ENST00000517488 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.02■■■□□ 2.24
PDGFRB-202ENST00000517488 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.98■■■□□ 2.23
PDGFRB-202ENST00000517488 NACADO15069 1562 aa28.92■■■□□ 2.22
PDGFRB-202ENST00000517488 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PDGFRB-202ENST00000517488 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
PDGFRB-202ENST00000517488 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.49■■■□□ 2.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
PDGFRB-202ENST00000517488 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.23■■■□□ 2.11
PDGFRB-202ENST00000517488 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.16■■■□□ 2.1
PDGFRB-202ENST00000517488 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.11■■■□□ 2.09
PDGFRB-202ENST00000517488 SCRIBQ14160 1630 aa28.03■■■□□ 2.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.78■■■□□ 2.04
PDGFRB-202ENST00000517488 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PDGFRB-202ENST00000517488 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.35■■□□□ 1.97
PDGFRB-202ENST00000517488 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
PDGFRB-202ENST00000517488 SMARCA4P51532 1647 aa26.76■■□□□ 1.87
PDGFRB-202ENST00000517488 NCAPD3P42695 1498 aa26.75■■□□□ 1.87
PDGFRB-202ENST00000517488 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
PDGFRB-202ENST00000517488 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PDGFRB-202ENST00000517488 SMARCA2P51531 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
PDGFRB-202ENST00000517488 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.62■■□□□ 1.85
PDGFRB-202ENST00000517488 HMGXB3Q12766 1538 aa26.53■■□□□ 1.84
PDGFRB-202ENST00000517488 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.5■■□□□ 1.83
PDGFRB-202ENST00000517488 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PDGFRB-202ENST00000517488 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PDGFRB-202ENST00000517488 WIZO95785 1651 aa26.26■■□□□ 1.79
PDGFRB-202ENST00000517488 NESP48681 1621 aa26.19■■□□□ 1.78
PDGFRB-202ENST00000517488 ERCC6Q03468 1493 aa26.12■■□□□ 1.77
PDGFRB-202ENST00000517488 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.99■■□□□ 1.75
PDGFRB-202ENST00000517488 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.99■■□□□ 1.75
PDGFRB-202ENST00000517488 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PDGFRB-202ENST00000517488 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.9■■□□□ 1.74
PDGFRB-202ENST00000517488 CUX2O14529 1486 aa25.88■■□□□ 1.73
PDGFRB-202ENST00000517488 CFTRP13569 1480 aa25.77■■□□□ 1.72
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.74■■□□□ 1.71
PDGFRB-202ENST00000517488 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.73■■□□□ 1.71
PDGFRB-202ENST00000517488 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.66■■□□□ 1.7
PDGFRB-202ENST00000517488 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.63■■□□□ 1.69
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.62■■□□□ 1.69
PDGFRB-202ENST00000517488 WDR62O43379 1518 aa25.53■■□□□ 1.68
PDGFRB-202ENST00000517488 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PDGFRB-202ENST00000517488 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PDGFRB-202ENST00000517488 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.41■■□□□ 1.66
PDGFRB-202ENST00000517488 PRDM2Q13029 1718 aa25.34■■□□□ 1.65
PDGFRB-202ENST00000517488 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC8Q09428 1581 aa25.16■■□□□ 1.62
PDGFRB-202ENST00000517488 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.14■■□□□ 1.61
PDGFRB-202ENST00000517488 IFT140Q96RY7 1462 aa25.1■■□□□ 1.61
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PDGFRB-202ENST00000517488 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PDGFRB-202ENST00000517488 CUX1P39880 1505 aa24.97■■□□□ 1.59
PDGFRB-202ENST00000517488 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.94■■□□□ 1.58
PDGFRB-202ENST00000517488 SOGA1O94964 1423 aa24.92■■□□□ 1.58
PDGFRB-202ENST00000517488 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
PDGFRB-202ENST00000517488 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PDGFRB-202ENST00000517488 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PDGFRB-202ENST00000517488 OSCARQ8IYS5 282 aa24.86■■□□□ 1.57
PDGFRB-202ENST00000517488 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PDGFRB-202ENST00000517488 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PDGFRB-202ENST00000517488 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PDGFRB-202ENST00000517488 FBLN2P98095 1184 aa24.67■■□□□ 1.54
PDGFRB-202ENST00000517488 SYNJ1O43426 1573 aa24.67■■□□□ 1.54
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.66■■□□□ 1.54
PDGFRB-202ENST00000517488 WDR97A6NE52 1622 aa24.64■■□□□ 1.54
PDGFRB-202ENST00000517488 TOP2BQ02880 1626 aa24.64■■□□□ 1.54
PDGFRB-202ENST00000517488 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.63■■□□□ 1.53
PDGFRB-202ENST00000517488 GRIN2BQ13224 1484 aa24.62■■□□□ 1.53
PDGFRB-202ENST00000517488 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.61■■□□□ 1.53
PDGFRB-202ENST00000517488 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.61■■□□□ 1.53
PDGFRB-202ENST00000517488 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PDGFRB-202ENST00000517488 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PDGFRB-202ENST00000517488 CHD1O14646 1710 aa24.52■■□□□ 1.52
PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM41Q8WV44 630 aa24.52■■□□□ 1.52
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.51■■□□□ 1.51
PDGFRB-202ENST00000517488 SYNJ2O15056 1496 aa24.48■■□□□ 1.51
PDGFRB-202ENST00000517488 PBRM1Q86U86 1689 aa24.43■■□□□ 1.5
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF11O15085 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
PDGFRB-202ENST00000517488 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.39■■□□□ 1.49
PDGFRB-202ENST00000517488 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.39■■□□□ 1.49
PDGFRB-202ENST00000517488 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.39■■□□□ 1.49
PDGFRB-202ENST00000517488 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.33■■□□□ 1.49
PDGFRB-202ENST00000517488 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.32■■□□□ 1.48
PDGFRB-202ENST00000517488 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAMTS12P58397 1594 aa24.31■■□□□ 1.48
PDGFRB-202ENST00000517488 GRIN2AQ12879 1464 aa24.3■■□□□ 1.48
PDGFRB-202ENST00000517488 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.28■■□□□ 1.48
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF27Q86VH2 1401 aa24.24■■□□□ 1.47
PDGFRB-202ENST00000517488 IGF1RP08069 1367 aa24.23■■□□□ 1.47
PDGFRB-202ENST00000517488 ARAP1Q96P48 1450 aa24.22■■□□□ 1.47
PDGFRB-202ENST00000517488 NUP160Q12769 1436 aa24.22■■□□□ 1.47
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP170Q5SW79 1584 aa24.17■■□□□ 1.46
PDGFRB-202ENST00000517488 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.05■■□□□ 1.44
PDGFRB-202ENST00000517488 JPH4Q96JJ6 628 aa24.03■■□□□ 1.44
PDGFRB-202ENST00000517488 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.03■■□□□ 1.44
PDGFRB-202ENST00000517488 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.01■■□□□ 1.43
PDGFRB-202ENST00000517488 CUL7Q14999 1698 aa24■■□□□ 1.43
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