RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517402.1

HOXA11-202, Transcript of homeobox A11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA11, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-202ENST00000517402 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.1■■■■■ 4.49
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HOXA11-202ENST00000517402 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXA11-202ENST00000517402 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXA11-202ENST00000517402 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.45■■■■□ 3.26
HOXA11-202ENST00000517402 ABCC9O60706 1549 aa34.9■■■■□ 3.18
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HOXA11-202ENST00000517402 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXA11-202ENST00000517402 SCRIBQ14160 1630 aa34.57■■■■□ 3.13
HOXA11-202ENST00000517402 NACADO15069 1562 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXA11-202ENST00000517402 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.07■■■■□ 3.05
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HOXA11-202ENST00000517402 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXA11-202ENST00000517402 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.61■■■□□ 2.97
HOXA11-202ENST00000517402 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.56■■■□□ 2.96
HOXA11-202ENST00000517402 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.45■■■□□ 2.94
HOXA11-202ENST00000517402 WIZO95785 1651 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXA11-202ENST00000517402 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
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HOXA11-202ENST00000517402 SMARCA4P51532 1647 aa33.04■■■□□ 2.88
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HOXA11-202ENST00000517402 TRIM41Q8WV44 630 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXA11-202ENST00000517402 SMARCA2P51531 1590 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXA11-202ENST00000517402 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
HOXA11-202ENST00000517402 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.51■■■□□ 2.8
HOXA11-202ENST00000517402 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXA11-202ENST00000517402 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXA11-202ENST00000517402 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXA11-202ENST00000517402 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
HOXA11-202ENST00000517402 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
HOXA11-202ENST00000517402 ABCC8Q09428 1581 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXA11-202ENST00000517402 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXA11-202ENST00000517402 HMGXB3Q12766 1538 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXA11-202ENST00000517402 NCAPD3P42695 1498 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXA11-202ENST00000517402 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.73■■■□□ 2.67
HOXA11-202ENST00000517402 SOGA1O94964 1423 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXA11-202ENST00000517402 SYNJ1O43426 1573 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXA11-202ENST00000517402 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXA11-202ENST00000517402 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXA11-202ENST00000517402 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXA11-202ENST00000517402 EEA1Q15075 1411 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXA11-202ENST00000517402 TOP2BQ02880 1626 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXA11-202ENST00000517402 CFTRP13569 1480 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXA11-202ENST00000517402 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXA11-202ENST00000517402 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.3■■■□□ 2.6
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HOXA11-202ENST00000517402 GOLGA3Q08378 1498 aa31.18■■■□□ 2.58
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HOXA11-202ENST00000517402 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXA11-202ENST00000517402 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.12■■■□□ 2.57
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HOXA11-202ENST00000517402 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.09■■■□□ 2.57
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HOXA11-202ENST00000517402 NESP48681 1621 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXA11-202ENST00000517402 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXA11-202ENST00000517402 KIF27Q86VH2 1401 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXA11-202ENST00000517402 PRXQ9BXM0 1461 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXA11-202ENST00000517402 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXA11-202ENST00000517402 CLIP1P30622 1438 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXA11-202ENST00000517402 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXA11-202ENST00000517402 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
HOXA11-202ENST00000517402 CUX2O14529 1486 aa30.69■■■□□ 2.5
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HOXA11-202ENST00000517402 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXA11-202ENST00000517402 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXA11-202ENST00000517402 TOPBP1Q92547 1522 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXA11-202ENST00000517402 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.54■■■□□ 2.48
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HOXA11-202ENST00000517402 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXA11-202ENST00000517402 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
HOXA11-202ENST00000517402 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.44■■■□□ 2.46
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HOXA11-202ENST00000517402 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.27■■■□□ 2.44
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HOXA11-202ENST00000517402 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
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HOXA11-202ENST00000517402 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.15■■■□□ 2.42
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HOXA11-202ENST00000517402 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
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HOXA11-202ENST00000517402 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXA11-202ENST00000517402 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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HOXA11-202ENST00000517402 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30■■■□□ 2.39
HOXA11-202ENST00000517402 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXA11-202ENST00000517402 P3H3Q8IVL6 736 aa29.92■■■□□ 2.38
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