RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.98■■■■□ 3.35
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.45■■■□□ 2.62
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC9O60706 1549 aa30.35■■■□□ 2.45
TRPS1-206ENST00000517323 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
TRPS1-206ENST00000517323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.1■■■□□ 2.41
TRPS1-206ENST00000517323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.57■■■□□ 2.32
TRPS1-206ENST00000517323 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.41■■■□□ 2.3
TRPS1-206ENST00000517323 NACADO15069 1562 aa29.37■■■□□ 2.29
TRPS1-206ENST00000517323 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
TRPS1-206ENST00000517323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.26■■■□□ 2.27
TRPS1-206ENST00000517323 SCRIBQ14160 1630 aa29.12■■■□□ 2.25
TRPS1-206ENST00000517323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.86■■■□□ 2.21
TRPS1-206ENST00000517323 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
TRPS1-206ENST00000517323 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.51■■■□□ 2.15
TRPS1-206ENST00000517323 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.14■■■□□ 2.1
TRPS1-206ENST00000517323 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TRPS1-206ENST00000517323 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.89■■■□□ 2.06
TRPS1-206ENST00000517323 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TRPS1-206ENST00000517323 SMARCA4P51532 1647 aa27.77■■■□□ 2.04
TRPS1-206ENST00000517323 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TRPS1-206ENST00000517323 WIZO95785 1651 aa27.69■■■□□ 2.02
TRPS1-206ENST00000517323 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TRPS1-206ENST00000517323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.39■■□□□ 1.98
TRPS1-206ENST00000517323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.38■■□□□ 1.97
TRPS1-206ENST00000517323 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.33■■□□□ 1.97
TRPS1-206ENST00000517323 SMARCA2P51531 1590 aa27.28■■□□□ 1.96
TRPS1-206ENST00000517323 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TRPS1-206ENST00000517323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TRPS1-206ENST00000517323 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.2■■□□□ 1.94
TRPS1-206ENST00000517323 NCAPD3P42695 1498 aa27.13■■□□□ 1.93
TRPS1-206ENST00000517323 HMGXB3Q12766 1538 aa27.05■■□□□ 1.92
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.03■■□□□ 1.92
TRPS1-206ENST00000517323 NESP48681 1621 aa26.56■■□□□ 1.84
TRPS1-206ENST00000517323 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.52■■□□□ 1.84
TRPS1-206ENST00000517323 CFTRP13569 1480 aa26.47■■□□□ 1.83
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC8Q09428 1581 aa26.47■■□□□ 1.83
TRPS1-206ENST00000517323 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
TRPS1-206ENST00000517323 PRDM2Q13029 1718 aa26.32■■□□□ 1.8
TRPS1-206ENST00000517323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.28■■□□□ 1.8
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM41Q8WV44 630 aa26.24■■□□□ 1.79
TRPS1-206ENST00000517323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.23■■□□□ 1.79
TRPS1-206ENST00000517323 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.19■■□□□ 1.78
TRPS1-206ENST00000517323 SYNJ1O43426 1573 aa26.18■■□□□ 1.78
TRPS1-206ENST00000517323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
TRPS1-206ENST00000517323 CUX1P39880 1505 aa26.08■■□□□ 1.77
TRPS1-206ENST00000517323 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
TRPS1-206ENST00000517323 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.07■■□□□ 1.76
TRPS1-206ENST00000517323 TOP2BQ02880 1626 aa25.98■■□□□ 1.75
TRPS1-206ENST00000517323 ERCC6Q03468 1493 aa25.97■■□□□ 1.75
TRPS1-206ENST00000517323 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TRPS1-206ENST00000517323 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TRPS1-206ENST00000517323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.95■■□□□ 1.74
TRPS1-206ENST00000517323 TOPBP1Q92547 1522 aa25.9■■□□□ 1.74
TRPS1-206ENST00000517323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.87■■□□□ 1.73
TRPS1-206ENST00000517323 SOGA1O94964 1423 aa25.85■■□□□ 1.73
TRPS1-206ENST00000517323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.84■■□□□ 1.73
TRPS1-206ENST00000517323 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.84■■□□□ 1.73
TRPS1-206ENST00000517323 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.82■■□□□ 1.72
TRPS1-206ENST00000517323 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.78■■□□□ 1.72
TRPS1-206ENST00000517323 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
TRPS1-206ENST00000517323 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.77■■□□□ 1.72
TRPS1-206ENST00000517323 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TRPS1-206ENST00000517323 WDR62O43379 1518 aa25.7■■□□□ 1.7
TRPS1-206ENST00000517323 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.66■■□□□ 1.7
TRPS1-206ENST00000517323 CUX2O14529 1486 aa25.61■■□□□ 1.69
TRPS1-206ENST00000517323 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TRPS1-206ENST00000517323 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TRPS1-206ENST00000517323 WDR97A6NE52 1622 aa25.53■■□□□ 1.68
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.51■■□□□ 1.67
TRPS1-206ENST00000517323 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.49■■□□□ 1.67
TRPS1-206ENST00000517323 KIF27Q86VH2 1401 aa25.49■■□□□ 1.67
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TRPS1-206ENST00000517323 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
TRPS1-206ENST00000517323 EEA1Q15075 1411 aa25.41■■□□□ 1.66
TRPS1-206ENST00000517323 IFT140Q96RY7 1462 aa25.41■■□□□ 1.66
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.38■■□□□ 1.65
TRPS1-206ENST00000517323 IGF1RP08069 1367 aa25.36■■□□□ 1.65
TRPS1-206ENST00000517323 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.36■■□□□ 1.65
TRPS1-206ENST00000517323 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TRPS1-206ENST00000517323 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.31■■□□□ 1.64
TRPS1-206ENST00000517323 PBRM1Q86U86 1689 aa25.29■■□□□ 1.64
TRPS1-206ENST00000517323 PRXQ9BXM0 1461 aa25.24■■□□□ 1.63
TRPS1-206ENST00000517323 KIF21BO75037 1637 aa25.23■■□□□ 1.63
TRPS1-206ENST00000517323 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRPS1-206ENST00000517323 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.22■■□□□ 1.63
TRPS1-206ENST00000517323 GOLGA3Q08378 1498 aa25.18■■□□□ 1.62
TRPS1-206ENST00000517323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.18■■□□□ 1.62
TRPS1-206ENST00000517323 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRPS1-206ENST00000517323 GRIN2BQ13224 1484 aa25.16■■□□□ 1.62
TRPS1-206ENST00000517323 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.14■■□□□ 1.62
TRPS1-206ENST00000517323 CUL7Q14999 1698 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS12P58397 1594 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-206ENST00000517323 FBLN2P98095 1184 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-206ENST00000517323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-206ENST00000517323 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-206ENST00000517323 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TRPS1-206ENST00000517323 CEP162Q5TB80 1403 aa24.96■■□□□ 1.59
TRPS1-206ENST00000517323 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TRPS1-206ENST00000517323 SYNJ2O15056 1496 aa24.91■■□□□ 1.58
TRPS1-206ENST00000517323 GRIN2AQ12879 1464 aa24.91■■□□□ 1.58
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