RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCC9O60706 1549 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM41Q8WV44 630 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-548P-201ENST00000517083 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-548P-201ENST00000517083 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEDQ86YR6 584 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-548P-201ENST00000517083 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-548P-201ENST00000517083 CUX2O14529 1486 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-548P-201ENST00000517083 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-548P-201ENST00000517083 NISCHQ9Y2I1 1504 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOCS7O14512 581 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RNU6-548P-201ENST00000517083 ILDR2Q71H61 639 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO41Q8TF61 875 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-548P-201ENST00000517083 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERCC6Q03468 1493 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-548P-201ENST00000517083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-548P-201ENST00000517083 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RNU6-548P-201ENST00000517083 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSCARQ8IYS5 282 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-548P-201ENST00000517083 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF11O15085 1522 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-548P-201ENST00000517083 NACADO15069 1562 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNJ2O15056 1496 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCAF8L2P0C7V8 631 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARAP1Q96P48 1450 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSH5O43196 834 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 NESP48681 1621 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFFO2Q5TF58 517 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMARCA2P51531 1590 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-548P-201ENST00000517083 CERKQ8TCT0 537 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRL1O94910 1474 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXD1Q16676 465 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRC2Q9UBG0 1479 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR62O43379 1518 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCRIBQ14160 1630 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-548P-201ENST00000517083 NCAPD3P42695 1498 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBLN2P98095 1184 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO15BQ96JP2 1530 aa4.66□□□□□ -1.66
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM6BO15054 1643 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAPVD1Q14C86 1478 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC34A2O95436 690 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA2P54652 639 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOP2BQ02880 1626 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGXB3Q12766 1538 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFT140Q96RY7 1462 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA1LP34931 641 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRMP28827 1452 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.46□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.46□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRTO14522 1441 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms