RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515585.1

ABCC3-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3

Gene ABCC3, Length 484 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-216ENST00000515585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.09■■■□□ 2.73
ABCC3-216ENST00000515585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.21■■■□□ 2.11
ABCC3-216ENST00000515585 ABCC9O60706 1549 aa27.44■■□□□ 1.98
ABCC3-216ENST00000515585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ABCC3-216ENST00000515585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.67■■□□□ 1.86
ABCC3-216ENST00000515585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.58■■□□□ 1.85
ABCC3-216ENST00000515585 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.44■■□□□ 1.82
ABCC3-216ENST00000515585 NACADO15069 1562 aa26.21■■□□□ 1.79
ABCC3-216ENST00000515585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.08■■□□□ 1.77
ABCC3-216ENST00000515585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.99■■□□□ 1.75
ABCC3-216ENST00000515585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
ABCC3-216ENST00000515585 SCRIBQ14160 1630 aa25.68■■□□□ 1.7
ABCC3-216ENST00000515585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.6■■□□□ 1.69
ABCC3-216ENST00000515585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
ABCC3-216ENST00000515585 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.29■■□□□ 1.64
ABCC3-216ENST00000515585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.98■■□□□ 1.59
ABCC3-216ENST00000515585 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.87■■□□□ 1.57
ABCC3-216ENST00000515585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ABCC3-216ENST00000515585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ABCC3-216ENST00000515585 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.75■■□□□ 1.55
ABCC3-216ENST00000515585 SMARCA4P51532 1647 aa24.73■■□□□ 1.55
ABCC3-216ENST00000515585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.65■■□□□ 1.54
ABCC3-216ENST00000515585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ABCC3-216ENST00000515585 WIZO95785 1651 aa24.54■■□□□ 1.52
ABCC3-216ENST00000515585 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.54■■□□□ 1.52
ABCC3-216ENST00000515585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ABCC3-216ENST00000515585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
ABCC3-216ENST00000515585 SMARCA2P51531 1590 aa24.32■■□□□ 1.48
ABCC3-216ENST00000515585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
ABCC3-216ENST00000515585 HMGXB3Q12766 1538 aa24.18■■□□□ 1.46
ABCC3-216ENST00000515585 NCAPD3P42695 1498 aa24.17■■□□□ 1.46
ABCC3-216ENST00000515585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ABCC3-216ENST00000515585 CCDC88BA6NC98 1476 aa24■■□□□ 1.43
ABCC3-216ENST00000515585 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
ABCC3-216ENST00000515585 ERCC6Q03468 1493 aa23.75■■□□□ 1.39
ABCC3-216ENST00000515585 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.66■■□□□ 1.38
ABCC3-216ENST00000515585 PRDM2Q13029 1718 aa23.62■■□□□ 1.37
ABCC3-216ENST00000515585 CFTRP13569 1480 aa23.57■■□□□ 1.36
ABCC3-216ENST00000515585 TRIM41Q8WV44 630 aa23.55■■□□□ 1.36
ABCC3-216ENST00000515585 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.44■■□□□ 1.34
ABCC3-216ENST00000515585 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCC3-216ENST00000515585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
ABCC3-216ENST00000515585 NESP48681 1621 aa23.34■■□□□ 1.33
ABCC3-216ENST00000515585 SYNJ1O43426 1573 aa23.27■■□□□ 1.32
ABCC3-216ENST00000515585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
ABCC3-216ENST00000515585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.27■■□□□ 1.32
ABCC3-216ENST00000515585 TOP2BQ02880 1626 aa23.23■■□□□ 1.31
ABCC3-216ENST00000515585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.18■■□□□ 1.3
ABCC3-216ENST00000515585 CUX1P39880 1505 aa23.17■■□□□ 1.3
ABCC3-216ENST00000515585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ABCC3-216ENST00000515585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCC3-216ENST00000515585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.08■■□□□ 1.29
ABCC3-216ENST00000515585 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.06■■□□□ 1.28
ABCC3-216ENST00000515585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.04■■□□□ 1.28
ABCC3-216ENST00000515585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-216ENST00000515585 TOPBP1Q92547 1522 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCC3-216ENST00000515585 EEA1Q15075 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCC3-216ENST00000515585 SOGA1O94964 1423 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCC3-216ENST00000515585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCC3-216ENST00000515585 OSCARQ8IYS5 282 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCC3-216ENST00000515585 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCC3-216ENST00000515585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.85■■□□□ 1.25
ABCC3-216ENST00000515585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ABCC3-216ENST00000515585 WDR62O43379 1518 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCC3-216ENST00000515585 WDR97A6NE52 1622 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCC3-216ENST00000515585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.75■■□□□ 1.23
ABCC3-216ENST00000515585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ABCC3-216ENST00000515585 KIF21BO75037 1637 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 KIF27Q86VH2 1401 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.67■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.64■■□□□ 1.22
ABCC3-216ENST00000515585 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCC3-216ENST00000515585 PRXQ9BXM0 1461 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCC3-216ENST00000515585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCC3-216ENST00000515585 GOLGA3Q08378 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCC3-216ENST00000515585 IFT140Q96RY7 1462 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCC3-216ENST00000515585 IGF1RP08069 1367 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCC3-216ENST00000515585 CUL7Q14999 1698 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCC3-216ENST00000515585 PBRM1Q86U86 1689 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCC3-216ENST00000515585 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCC3-216ENST00000515585 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
ABCC3-216ENST00000515585 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.44■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.4■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ABCC3-216ENST00000515585 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ABCC3-216ENST00000515585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ABCC3-216ENST00000515585 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.37■■□□□ 1.17
ABCC3-216ENST00000515585 ARHGEF11O15085 1522 aa22.35■■□□□ 1.17
ABCC3-216ENST00000515585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
ABCC3-216ENST00000515585 GRIN2BQ13224 1484 aa22.33■■□□□ 1.16
ABCC3-216ENST00000515585 ADAMTS12P58397 1594 aa22.33■■□□□ 1.16
ABCC3-216ENST00000515585 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ABCC3-216ENST00000515585 CEP162Q5TB80 1403 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCC3-216ENST00000515585 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
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