RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515175.5

PARP8-222, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase family member 8, human

TSL 3

Gene PARP8, Length 513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARP8-222	ENST00000515175	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		46.4	■■■■■ 5.02
PARP8-222	ENST00000515175	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.96	■■■■■ 4.15
PARP8-222	ENST00000515175	ABCC9	O60706	1549 aa		39.53	■■■■□ 3.92
PARP8-222	ENST00000515175	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.74	■■■■□ 3.79
PARP8-222	ENST00000515175	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.56	■■■■□ 3.76
PARP8-222	ENST00000515175	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		38.48	■■■■□ 3.75
PARP8-222	ENST00000515175	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.45	■■■■□ 3.75
PARP8-222	ENST00000515175	NACAD	O15069	1562 aa		38.44	■■■■□ 3.74
PARP8-222	ENST00000515175	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.33	■■■■□ 3.73
PARP8-222	ENST00000515175	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.36	■■■■□ 3.57
PARP8-222	ENST00000515175	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.31	■■■■□ 3.56
PARP8-222	ENST00000515175	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.08	■■■■□ 3.53
PARP8-222	ENST00000515175	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.07	■■■■□ 3.52
PARP8-222	ENST00000515175	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.91	■■■■□ 3.5
PARP8-222	ENST00000515175	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.08	■■■■□ 3.37
PARP8-222	ENST00000515175	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.03	■■■■□ 3.36
PARP8-222	ENST00000515175	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.93	■■■■□ 3.34
PARP8-222	ENST00000515175	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.83	■■■■□ 3.33
PARP8-222	ENST00000515175	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.79	■■■■□ 3.32
PARP8-222	ENST00000515175	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.78	■■■■□ 3.32
PARP8-222	ENST00000515175	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.72	■■■■□ 3.31
PARP8-222	ENST00000515175	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.57	■■■■□ 3.28
PARP8-222	ENST00000515175	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.55	■■■■□ 3.28
PARP8-222	ENST00000515175	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.55	■■■■□ 3.28
PARP8-222	ENST00000515175	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.53	■■■■□ 3.28
PARP8-222	ENST00000515175	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.49	■■■■□ 3.27
PARP8-222	ENST00000515175	WIZ	O95785	1651 aa		35.33	■■■■□ 3.25
PARP8-222	ENST00000515175	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.32	■■■■□ 3.25
PARP8-222	ENST00000515175	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.29	■■■■□ 3.24
PARP8-222	ENST00000515175	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.09	■■■■□ 3.21
PARP8-222	ENST00000515175	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	35.05	■■■■□ 3.2
PARP8-222	ENST00000515175	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.65	■■■■□ 3.14
PARP8-222	ENST00000515175	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.49	■■■■□ 3.11
PARP8-222	ENST00000515175	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.42	■■■■□ 3.1
PARP8-222	ENST00000515175	CFTR	P13569	1480 aa		34.39	■■■■□ 3.1
PARP8-222	ENST00000515175	NES	P48681	1621 aa		34.34	■■■■□ 3.09
PARP8-222	ENST00000515175	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.24	■■■■□ 3.07
PARP8-222	ENST00000515175	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.07	■■■■□ 3.05
PARP8-222	ENST00000515175	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PARP8-222	ENST00000515175	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PARP8-222	ENST00000515175	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PARP8-222	ENST00000515175	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PARP8-222	ENST00000515175	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.78	■■■■□ 3
PARP8-222	ENST00000515175	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
PARP8-222	ENST00000515175	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PARP8-222	ENST00000515175	WDR62	O43379	1518 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PARP8-222	ENST00000515175	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PARP8-222	ENST00000515175	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PARP8-222	ENST00000515175	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PARP8-222	ENST00000515175	CUX2	O14529	1486 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PARP8-222	ENST00000515175	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.53	■■■□□ 2.96
PARP8-222	ENST00000515175	CUX1	P39880	1505 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PARP8-222	ENST00000515175	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PARP8-222	ENST00000515175	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PARP8-222	ENST00000515175	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PARP8-222	ENST00000515175	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PARP8-222	ENST00000515175	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PARP8-222	ENST00000515175	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PARP8-222	ENST00000515175	SOGA1	O94964	1423 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PARP8-222	ENST00000515175	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PARP8-222	ENST00000515175	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PARP8-222	ENST00000515175	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PARP8-222	ENST00000515175	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PARP8-222	ENST00000515175	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PARP8-222	ENST00000515175	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PARP8-222	ENST00000515175	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PARP8-222	ENST00000515175	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PARP8-222	ENST00000515175	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
PARP8-222	ENST00000515175	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PARP8-222	ENST00000515175	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PARP8-222	ENST00000515175	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PARP8-222	ENST00000515175	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PARP8-222	ENST00000515175	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.76	■■■□□ 2.84
PARP8-222	ENST00000515175	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PARP8-222	ENST00000515175	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	IGF1R	P08069	1367 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	EEA1	Q15075	1411 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PARP8-222	ENST00000515175	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PARP8-222	ENST00000515175	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PARP8-222	ENST00000515175	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PARP8-222	ENST00000515175	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PARP8-222	ENST00000515175	CUL7	Q14999	1698 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PARP8-222	ENST00000515175	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PARP8-222	ENST00000515175	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PARP8-222	ENST00000515175	FBLN2	P98095	1184 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PARP8-222	ENST00000515175	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PARP8-222	ENST00000515175	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PARP8-222	ENST00000515175	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PARP8-222	ENST00000515175	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PARP8-222	ENST00000515175	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PARP8-222	ENST00000515175	CHD1	O14646	1710 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PARP8-222	ENST00000515175	NUP160	Q12769	1436 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PARP8-222	ENST00000515175	KIF21B	O75037	1637 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PARP8-222	ENST00000515175	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PARP8-222	ENST00000515175	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PARP8-222	ENST00000515175	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PARP8-222	ENST00000515175	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.01	■■■□□ 2.71

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