RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514810.1

FLT4-211, Transcript of fms related tyrosine kinase 4, humanhuman

TSL 4

Gene FLT4, Length 690 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4-211ENST00000514810 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.88■■■■■ 7.02
FLT4-211ENST00000514810 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.08■■■■■ 5.93
FLT4-211ENST00000514810 ABCC9O60706 1549 aa50.01■■■■■ 5.6
FLT4-211ENST00000514810 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.22■■■■■ 5.47
FLT4-211ENST00000514810 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.97■■■■■ 5.43
FLT4-211ENST00000514810 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.87■■■■■ 5.41
FLT4-211ENST00000514810 NACADO15069 1562 aa48.81■■■■■ 5.4
FLT4-211ENST00000514810 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.81■■■■■ 5.4
FLT4-211ENST00000514810 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.68■■■■■ 5.38
FLT4-211ENST00000514810 SCRIBQ14160 1630 aa47.45■■■■■ 5.19
FLT4-211ENST00000514810 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.23■■■■■ 5.15
FLT4-211ENST00000514810 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
FLT4-211ENST00000514810 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.84■■■■■ 5.09
FLT4-211ENST00000514810 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.09
FLT4-211ENST00000514810 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
FLT4-211ENST00000514810 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
FLT4-211ENST00000514810 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.59■■■■■ 4.89
FLT4-211ENST00000514810 SMARCA4P51532 1647 aa45.5■■■■■ 4.87
FLT4-211ENST00000514810 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.28■■■■■ 4.84
FLT4-211ENST00000514810 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.27■■■■■ 4.84
FLT4-211ENST00000514810 SMARCA2P51531 1590 aa45.21■■■■■ 4.83
FLT4-211ENST00000514810 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
FLT4-211ENST00000514810 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.8
FLT4-211ENST00000514810 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.04■■■■■ 4.8
FLT4-211ENST00000514810 NCAPD3P42695 1498 aa44.95■■■■■ 4.79
FLT4-211ENST00000514810 HMGXB3Q12766 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
FLT4-211ENST00000514810 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.85■■■■■ 4.77
FLT4-211ENST00000514810 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
FLT4-211ENST00000514810 WIZO95785 1651 aa44.82■■■■■ 4.77
FLT4-211ENST00000514810 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
FLT4-211ENST00000514810 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
FLT4-211ENST00000514810 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.94■■■■■ 4.62
FLT4-211ENST00000514810 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.71■■■■■ 4.59
FLT4-211ENST00000514810 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.71■■■■■ 4.59
FLT4-211ENST00000514810 CFTRP13569 1480 aa43.58■■■■■ 4.57
FLT4-211ENST00000514810 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
FLT4-211ENST00000514810 NESP48681 1621 aa43.4■■■■■ 4.54
FLT4-211ENST00000514810 PRDM2Q13029 1718 aa43.34■■■■■ 4.53
FLT4-211ENST00000514810 ERCC6Q03468 1493 aa43.27■■■■■ 4.52
FLT4-211ENST00000514810 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.19■■■■■ 4.51
FLT4-211ENST00000514810 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.14■■■■■ 4.5
FLT4-211ENST00000514810 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.97■■■■■ 4.47
FLT4-211ENST00000514810 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.87■■■■■ 4.45
FLT4-211ENST00000514810 ABCC8Q09428 1581 aa42.86■■■■■ 4.45
FLT4-211ENST00000514810 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
FLT4-211ENST00000514810 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
FLT4-211ENST00000514810 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
FLT4-211ENST00000514810 WDR62O43379 1518 aa42.63■■■■■ 4.42
FLT4-211ENST00000514810 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
FLT4-211ENST00000514810 TOPBP1Q92547 1522 aa42.55■■■■■ 4.4
FLT4-211ENST00000514810 CUX2O14529 1486 aa42.49■■■■■ 4.39
FLT4-211ENST00000514810 CUX1P39880 1505 aa42.46■■■■■ 4.39
FLT4-211ENST00000514810 TOP2BQ02880 1626 aa42.42■■■■■ 4.38
FLT4-211ENST00000514810 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.38■■■■■ 4.38
FLT4-211ENST00000514810 TRIM41Q8WV44 630 aa42.34■■■■■ 4.37
FLT4-211ENST00000514810 SYNJ1O43426 1573 aa42.31■■■■■ 4.36
FLT4-211ENST00000514810 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
FLT4-211ENST00000514810 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
FLT4-211ENST00000514810 IFT140Q96RY7 1462 aa42.21■■■■■ 4.35
FLT4-211ENST00000514810 SOGA1O94964 1423 aa42.16■■■■■ 4.34
FLT4-211ENST00000514810 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.13■■■■■ 4.33
FLT4-211ENST00000514810 WDR97A6NE52 1622 aa41.96■■■■■ 4.31
FLT4-211ENST00000514810 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.95■■■■■ 4.31
FLT4-211ENST00000514810 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.95■■■■■ 4.31
FLT4-211ENST00000514810 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
FLT4-211ENST00000514810 KIF27Q86VH2 1401 aa41.82■■■■■ 4.29
FLT4-211ENST00000514810 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
FLT4-211ENST00000514810 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
FLT4-211ENST00000514810 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
FLT4-211ENST00000514810 EEA1Q15075 1411 aa41.68■■■■■ 4.26
FLT4-211ENST00000514810 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
FLT4-211ENST00000514810 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.63■■■■■ 4.26
FLT4-211ENST00000514810 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
FLT4-211ENST00000514810 GRIN2BQ13224 1484 aa41.61■■■■■ 4.25
FLT4-211ENST00000514810 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.52■■■■■ 4.24
FLT4-211ENST00000514810 PBRM1Q86U86 1689 aa41.47■■■■■ 4.23
FLT4-211ENST00000514810 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
FLT4-211ENST00000514810 CUL7Q14999 1698 aa41.34■■■■■ 4.21
FLT4-211ENST00000514810 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.34■■■■■ 4.21
FLT4-211ENST00000514810 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.33■■■■■ 4.21
FLT4-211ENST00000514810 IGF1RP08069 1367 aa41.32■■■■■ 4.21
FLT4-211ENST00000514810 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.29■■■■■ 4.2
FLT4-211ENST00000514810 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
FLT4-211ENST00000514810 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
FLT4-211ENST00000514810 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
FLT4-211ENST00000514810 SYNJ2O15056 1496 aa41.22■■■■■ 4.19
FLT4-211ENST00000514810 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.22■■■■■ 4.19
FLT4-211ENST00000514810 ADAMTS12P58397 1594 aa41.21■■■■■ 4.19
FLT4-211ENST00000514810 FBLN2P98095 1184 aa41.16■■■■■ 4.18
FLT4-211ENST00000514810 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.09■■■■■ 4.17
FLT4-211ENST00000514810 PRXQ9BXM0 1461 aa41.03■■■■■ 4.16
FLT4-211ENST00000514810 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
FLT4-211ENST00000514810 KIF21BO75037 1637 aa40.97■■■■■ 4.15
FLT4-211ENST00000514810 CHD1O14646 1710 aa40.93■■■■■ 4.14
FLT4-211ENST00000514810 OSCARQ8IYS5 282 aa40.89■■■■■ 4.14
FLT4-211ENST00000514810 GOLGA3Q08378 1498 aa40.88■■■■■ 4.13
FLT4-211ENST00000514810 NUP160Q12769 1436 aa40.76■■■■■ 4.12
FLT4-211ENST00000514810 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
FLT4-211ENST00000514810 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.67■■■■■ 4.1
FLT4-211ENST00000514810 CEP170Q5SW79 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms