RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.19■■■■■ 4.5
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.35■■■■□ 3.73
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC9O60706 1549 aa37.53■■■■□ 3.6
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-215ENST00000514625 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-215ENST00000514625 NACADO15069 1562 aa36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-215ENST00000514625 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-215ENST00000514625 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.73■■■■□ 3.31
FAAP20-215ENST00000514625 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.19■■■■□ 3.22
FAAP20-215ENST00000514625 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
FAAP20-215ENST00000514625 SCRIBQ14160 1630 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-215ENST00000514625 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.96■■■■□ 3.19
FAAP20-215ENST00000514625 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.67■■■■□ 3.14
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-215ENST00000514625 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
FAAP20-215ENST00000514625 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-215ENST00000514625 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.73■■■□□ 2.99
FAAP20-215ENST00000514625 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
FAAP20-215ENST00000514625 SMARCA4P51532 1647 aa33.49■■■□□ 2.95
FAAP20-215ENST00000514625 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.32■■■□□ 2.92
FAAP20-215ENST00000514625 NCAPD3P42695 1498 aa33.31■■■□□ 2.92
FAAP20-215ENST00000514625 SMARCA2P51531 1590 aa33.3■■■□□ 2.92
FAAP20-215ENST00000514625 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.27■■■□□ 2.92
FAAP20-215ENST00000514625 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.15■■■□□ 2.9
FAAP20-215ENST00000514625 HMGXB3Q12766 1538 aa33.12■■■□□ 2.89
FAAP20-215ENST00000514625 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
FAAP20-215ENST00000514625 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
FAAP20-215ENST00000514625 WIZO95785 1651 aa32.91■■■□□ 2.86
FAAP20-215ENST00000514625 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
FAAP20-215ENST00000514625 NESP48681 1621 aa32.46■■■□□ 2.79
FAAP20-215ENST00000514625 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.41■■■□□ 2.78
FAAP20-215ENST00000514625 ERCC6Q03468 1493 aa32.4■■■□□ 2.78
FAAP20-215ENST00000514625 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.36■■■□□ 2.77
FAAP20-215ENST00000514625 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.26■■■□□ 2.75
FAAP20-215ENST00000514625 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.22■■■□□ 2.75
FAAP20-215ENST00000514625 CFTRP13569 1480 aa32.15■■■□□ 2.74
FAAP20-215ENST00000514625 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.05■■■□□ 2.72
FAAP20-215ENST00000514625 CUX2O14529 1486 aa32■■■□□ 2.71
FAAP20-215ENST00000514625 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
FAAP20-215ENST00000514625 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.94■■■□□ 2.7
FAAP20-215ENST00000514625 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
FAAP20-215ENST00000514625 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.87■■■□□ 2.69
FAAP20-215ENST00000514625 PRDM2Q13029 1718 aa31.84■■■□□ 2.69
FAAP20-215ENST00000514625 WDR62O43379 1518 aa31.74■■■□□ 2.67
FAAP20-215ENST00000514625 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC8Q09428 1581 aa31.51■■■□□ 2.63
FAAP20-215ENST00000514625 TOPBP1Q92547 1522 aa31.45■■■□□ 2.63
FAAP20-215ENST00000514625 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.42■■■□□ 2.62
FAAP20-215ENST00000514625 IFT140Q96RY7 1462 aa31.27■■■□□ 2.6
FAAP20-215ENST00000514625 CUX1P39880 1505 aa31.21■■■□□ 2.59
FAAP20-215ENST00000514625 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
FAAP20-215ENST00000514625 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.13■■■□□ 2.57
FAAP20-215ENST00000514625 SOGA1O94964 1423 aa31.11■■■□□ 2.57
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
FAAP20-215ENST00000514625 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.08■■■□□ 2.57
FAAP20-215ENST00000514625 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
FAAP20-215ENST00000514625 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.06■■■□□ 2.56
FAAP20-215ENST00000514625 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.99■■■□□ 2.55
FAAP20-215ENST00000514625 TOP2BQ02880 1626 aa30.96■■■□□ 2.55
FAAP20-215ENST00000514625 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
FAAP20-215ENST00000514625 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.54
FAAP20-215ENST00000514625 SYNJ1O43426 1573 aa30.94■■■□□ 2.54
FAAP20-215ENST00000514625 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.94■■■□□ 2.54
FAAP20-215ENST00000514625 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
FAAP20-215ENST00000514625 WDR97A6NE52 1622 aa30.87■■■□□ 2.53
FAAP20-215ENST00000514625 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.83■■■□□ 2.53
FAAP20-215ENST00000514625 OSCARQ8IYS5 282 aa30.75■■■□□ 2.51
FAAP20-215ENST00000514625 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.74■■■□□ 2.51
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN2BQ13224 1484 aa30.72■■■□□ 2.51
FAAP20-215ENST00000514625 FBLN2P98095 1184 aa30.66■■■□□ 2.5
FAAP20-215ENST00000514625 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.65■■■□□ 2.5
FAAP20-215ENST00000514625 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.65■■■□□ 2.5
FAAP20-215ENST00000514625 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
FAAP20-215ENST00000514625 PBRM1Q86U86 1689 aa30.59■■■□□ 2.49
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
FAAP20-215ENST00000514625 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
FAAP20-215ENST00000514625 SYNJ2O15056 1496 aa30.51■■■□□ 2.48
FAAP20-215ENST00000514625 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.47■■■□□ 2.47
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM41Q8WV44 630 aa30.46■■■□□ 2.47
FAAP20-215ENST00000514625 KIF27Q86VH2 1401 aa30.46■■■□□ 2.47
FAAP20-215ENST00000514625 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.39■■■□□ 2.45
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTS12P58397 1594 aa30.37■■■□□ 2.45
FAAP20-215ENST00000514625 GRIN2AQ12879 1464 aa30.31■■■□□ 2.44
FAAP20-215ENST00000514625 IGF1RP08069 1367 aa30.29■■■□□ 2.44
FAAP20-215ENST00000514625 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.22■■■□□ 2.43
FAAP20-215ENST00000514625 CUL7Q14999 1698 aa30.19■■■□□ 2.42
FAAP20-215ENST00000514625 ARHGEF11O15085 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-215ENST00000514625 NUP160Q12769 1436 aa30.16■■■□□ 2.42
FAAP20-215ENST00000514625 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.15■■■□□ 2.42
FAAP20-215ENST00000514625 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
FAAP20-215ENST00000514625 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
FAAP20-215ENST00000514625 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
FAAP20-215ENST00000514625 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-215ENST00000514625 CEP170Q5SW79 1584 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-215ENST00000514625 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-215ENST00000514625 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-215ENST00000514625 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.96■■■□□ 2.39
FAAP20-215ENST00000514625 JPH4Q96JJ6 628 aa29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms