RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
LINC00491-204ENST00000513815 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.55□□□□□ -0.56
LINC00491-204ENST00000513815 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC9O60706 1549 aa11.19□□□□□ -0.62
LINC00491-204ENST00000513815 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00491-204ENST00000513815 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.81□□□□□ -0.68
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa10.73□□□□□ -0.69
LINC00491-204ENST00000513815 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
LINC00491-204ENST00000513815 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10.5□□□□□ -0.73
LINC00491-204ENST00000513815 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
LINC00491-204ENST00000513815 NACADO15069 1562 aa10.31□□□□□ -0.76
LINC00491-204ENST00000513815 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
LINC00491-204ENST00000513815 POTEDQ86YR6 584 aa10.25□□□□□ -0.77
LINC00491-204ENST00000513815 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00491-204ENST00000513815 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.2□□□□□ -0.78
LINC00491-204ENST00000513815 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.18□□□□□ -0.78
LINC00491-204ENST00000513815 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.16□□□□□ -0.78
LINC00491-204ENST00000513815 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.15□□□□□ -0.78
LINC00491-204ENST00000513815 CUX2O14529 1486 aa10.1□□□□□ -0.79
LINC00491-204ENST00000513815 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.03□□□□□ -0.8
LINC00491-204ENST00000513815 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LINC00491-204ENST00000513815 FOXD1Q16676 465 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00491-204ENST00000513815 TRIM41Q8WV44 630 aa9.88□□□□□ -0.83
LINC00491-204ENST00000513815 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.83□□□□□ -0.84
LINC00491-204ENST00000513815 ERCC6Q03468 1493 aa9.76□□□□□ -0.85
LINC00491-204ENST00000513815 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.61□□□□□ -0.87
LINC00491-204ENST00000513815 SCRIBQ14160 1630 aa9.6□□□□□ -0.87
LINC00491-204ENST00000513815 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00491-204ENST00000513815 NCAPD3P42695 1498 aa9.52□□□□□ -0.89
LINC00491-204ENST00000513815 MSH5O43196 834 aa9.48□□□□□ -0.89
LINC00491-204ENST00000513815 OSCARQ8IYS5 282 aa9.46□□□□□ -0.9
LINC00491-204ENST00000513815 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LINC00491-204ENST00000513815 NESP48681 1621 aa9.41□□□□□ -0.9
LINC00491-204ENST00000513815 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
LINC00491-204ENST00000513815 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.4□□□□□ -0.9
LINC00491-204ENST00000513815 HMGXB3Q12766 1538 aa9.38□□□□□ -0.91
LINC00491-204ENST00000513815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC00491-204ENST00000513815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC00491-204ENST00000513815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC00491-204ENST00000513815 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.36□□□□□ -0.91
LINC00491-204ENST00000513815 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.33□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 SMARCA2P51531 1590 aa9.33□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.31□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 WDR62O43379 1518 aa9.3□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGEF11O15085 1522 aa9.29□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.28□□□□□ -0.92
LINC00491-204ENST00000513815 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LINC00491-204ENST00000513815 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.19□□□□□ -0.94
LINC00491-204ENST00000513815 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LINC00491-204ENST00000513815 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.15□□□□□ -0.94
LINC00491-204ENST00000513815 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.15□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 ARAP1Q96P48 1450 aa9.14□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 SMARCA4P51532 1647 aa9.13□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.09□□□□□ -0.95
LINC00491-204ENST00000513815 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00491-204ENST00000513815 IFT140Q96RY7 1462 aa8.96□□□□□ -0.97
LINC00491-204ENST00000513815 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.96□□□□□ -0.98
LINC00491-204ENST00000513815 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
LINC00491-204ENST00000513815 CHD1O14646 1710 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00491-204ENST00000513815 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00491-204ENST00000513815 CFTRP13569 1480 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00491-204ENST00000513815 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.9□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 FBXO41Q8TF61 875 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC8Q09428 1581 aa8.82□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.82□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 SOCS7O14512 581 aa8.81□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 ADRA2BP18089 450 aa8.81□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.8□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.8□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 SYNJ1O43426 1573 aa8.8□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.79□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 PRDM2Q13029 1718 aa8.79□□□□□ -1
LINC00491-204ENST00000513815 FBLN2P98095 1184 aa8.77□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 TOPBP1Q92547 1522 aa8.76□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 WDR97A6NE52 1622 aa8.75□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.74□□□□□ -1.01
LINC00491-204ENST00000513815 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 KDM6BO15054 1643 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.68□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 SYNJ2O15056 1496 aa8.67□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 WIZO95785 1651 aa8.66□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.66□□□□□ -1.02
LINC00491-204ENST00000513815 ADGRL1O94910 1474 aa8.64□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 MAPKBP1O60336 1514 aa8.63□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 ILDR2Q71H61 639 aa8.62□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 GRIN2BQ13224 1484 aa8.61□□□□□ -1.03
LINC00491-204ENST00000513815 DIP2BQ9P265 1576 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms