RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511352.1

TNIP2-207, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP2, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-207ENST00000511352 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.42■■■■■ 5.5
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TNIP2-207ENST00000511352 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
TNIP2-207ENST00000511352 NACADO15069 1562 aa41.2■■■■■ 4.19
TNIP2-207ENST00000511352 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.2■■■■■ 4.19
TNIP2-207ENST00000511352 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.13■■■■■ 4.17
TNIP2-207ENST00000511352 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.03■■■■■ 4.16
TNIP2-207ENST00000511352 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.93■■■■■ 4.14
TNIP2-207ENST00000511352 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.3■■■■■ 4.04
TNIP2-207ENST00000511352 SCRIBQ14160 1630 aa40.05■■■■■ 4
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TNIP2-207ENST00000511352 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
TNIP2-207ENST00000511352 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.66■■■■□ 3.78
TNIP2-207ENST00000511352 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.45■■■■□ 3.75
TNIP2-207ENST00000511352 SMARCA4P51532 1647 aa38.33■■■■□ 3.73
TNIP2-207ENST00000511352 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
TNIP2-207ENST00000511352 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.08■■■■□ 3.69
TNIP2-207ENST00000511352 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
TNIP2-207ENST00000511352 SMARCA2P51531 1590 aa38.03■■■■□ 3.68
TNIP2-207ENST00000511352 NCAPD3P42695 1498 aa37.98■■■■□ 3.67
TNIP2-207ENST00000511352 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.95■■■■□ 3.67
TNIP2-207ENST00000511352 HMGXB3Q12766 1538 aa37.86■■■■□ 3.65
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TNIP2-207ENST00000511352 WIZO95785 1651 aa37.7■■■■□ 3.63
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TNIP2-207ENST00000511352 NESP48681 1621 aa37■■■■□ 3.51
TNIP2-207ENST00000511352 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.99■■■■□ 3.51
TNIP2-207ENST00000511352 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.88■■■■□ 3.49
TNIP2-207ENST00000511352 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
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TNIP2-207ENST00000511352 ERCC6Q03468 1493 aa36.81■■■■□ 3.48
TNIP2-207ENST00000511352 CFTRP13569 1480 aa36.72■■■■□ 3.47
TNIP2-207ENST00000511352 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.71■■■■□ 3.47
TNIP2-207ENST00000511352 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.63■■■■□ 3.45
TNIP2-207ENST00000511352 PRDM2Q13029 1718 aa36.54■■■■□ 3.44
TNIP2-207ENST00000511352 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.48■■■■□ 3.43
TNIP2-207ENST00000511352 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TNIP2-207ENST00000511352 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.43■■■■□ 3.42
TNIP2-207ENST00000511352 CUX2O14529 1486 aa36.36■■■■□ 3.41
TNIP2-207ENST00000511352 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.33■■■■□ 3.41
TNIP2-207ENST00000511352 WDR62O43379 1518 aa36.22■■■■□ 3.39
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TNIP2-207ENST00000511352 ABCC8Q09428 1581 aa35.94■■■■□ 3.34
TNIP2-207ENST00000511352 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.92■■■■□ 3.34
TNIP2-207ENST00000511352 TOPBP1Q92547 1522 aa35.92■■■■□ 3.34
TNIP2-207ENST00000511352 CUX1P39880 1505 aa35.73■■■■□ 3.31
TNIP2-207ENST00000511352 IFT140Q96RY7 1462 aa35.66■■■■□ 3.3
TNIP2-207ENST00000511352 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
TNIP2-207ENST00000511352 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.57■■■■□ 3.28
TNIP2-207ENST00000511352 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.28
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TNIP2-207ENST00000511352 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.5■■■■□ 3.27
TNIP2-207ENST00000511352 TOP2BQ02880 1626 aa35.49■■■■□ 3.27
TNIP2-207ENST00000511352 SYNJ1O43426 1573 aa35.48■■■■□ 3.27
TNIP2-207ENST00000511352 SOGA1O94964 1423 aa35.46■■■■□ 3.27
TNIP2-207ENST00000511352 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.45■■■■□ 3.27
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TNIP2-207ENST00000511352 WDR97A6NE52 1622 aa35.32■■■■□ 3.24
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TNIP2-207ENST00000511352 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.08■■■■□ 3.21
TNIP2-207ENST00000511352 GRIN2BQ13224 1484 aa35.05■■■■□ 3.2
TNIP2-207ENST00000511352 PBRM1Q86U86 1689 aa35.05■■■■□ 3.2
TNIP2-207ENST00000511352 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.98■■■■□ 3.19
TNIP2-207ENST00000511352 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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TNIP2-207ENST00000511352 CHD1O14646 1710 aa34.89■■■■□ 3.18
TNIP2-207ENST00000511352 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.84■■■■□ 3.17
TNIP2-207ENST00000511352 OSCARQ8IYS5 282 aa34.83■■■■□ 3.17
TNIP2-207ENST00000511352 TRIM41Q8WV44 630 aa34.82■■■■□ 3.16
TNIP2-207ENST00000511352 KIF27Q86VH2 1401 aa34.81■■■■□ 3.16
TNIP2-207ENST00000511352 SYNJ2O15056 1496 aa34.8■■■■□ 3.16
TNIP2-207ENST00000511352 FBLN2P98095 1184 aa34.78■■■■□ 3.16
TNIP2-207ENST00000511352 ADAMTS12P58397 1594 aa34.77■■■■□ 3.16
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TNIP2-207ENST00000511352 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.42■■■■□ 3.1
TNIP2-207ENST00000511352 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.32■■■■□ 3.08
TNIP2-207ENST00000511352 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.32■■■■□ 3.08
TNIP2-207ENST00000511352 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.32■■■■□ 3.08
TNIP2-207ENST00000511352 ARHGEF11O15085 1522 aa34.31■■■■□ 3.08
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TNIP2-207ENST00000511352 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.26■■■■□ 3.07
TNIP2-207ENST00000511352 PRXQ9BXM0 1461 aa34.19■■■■□ 3.06
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