RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510734.5

CLTB-207, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

TSL 2

Gene CLTB, Length 1,489 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-207ENST00000510734 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.02■■■■■ 6.24
CLTB-207ENST00000510734 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.5■■■■■ 5.19
CLTB-207ENST00000510734 ABCC9O60706 1549 aa45.83■■■■■ 4.93
CLTB-207ENST00000510734 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
CLTB-207ENST00000510734 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.02■■■■■ 4.8
CLTB-207ENST00000510734 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.68■■■■■ 4.74
CLTB-207ENST00000510734 NACADO15069 1562 aa44.53■■■■■ 4.72
CLTB-207ENST00000510734 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.52■■■■■ 4.72
CLTB-207ENST00000510734 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.38■■■■■ 4.69
CLTB-207ENST00000510734 SCRIBQ14160 1630 aa43.54■■■■■ 4.56
CLTB-207ENST00000510734 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.38■■■■■ 4.54
CLTB-207ENST00000510734 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.27■■■■■ 4.52
CLTB-207ENST00000510734 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.07■■■■■ 4.49
CLTB-207ENST00000510734 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.99■■■■■ 4.47
CLTB-207ENST00000510734 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.03■■■■■ 4.32
CLTB-207ENST00000510734 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CLTB-207ENST00000510734 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
CLTB-207ENST00000510734 SMARCA4P51532 1647 aa41.68■■■■■ 4.26
CLTB-207ENST00000510734 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.67■■■■■ 4.26
CLTB-207ENST00000510734 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
CLTB-207ENST00000510734 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.41■■■■■ 4.22
CLTB-207ENST00000510734 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CLTB-207ENST00000510734 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.32■■■■■ 4.2
CLTB-207ENST00000510734 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.3■■■■■ 4.2
CLTB-207ENST00000510734 SMARCA2P51531 1590 aa41.25■■■■■ 4.19
CLTB-207ENST00000510734 WIZO95785 1651 aa41.24■■■■■ 4.19
CLTB-207ENST00000510734 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.23■■■■■ 4.19
CLTB-207ENST00000510734 NCAPD3P42695 1498 aa41.13■■■■■ 4.18
CLTB-207ENST00000510734 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.15
CLTB-207ENST00000510734 HMGXB3Q12766 1538 aa40.94■■■■■ 4.14
CLTB-207ENST00000510734 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
CLTB-207ENST00000510734 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.42■■■■■ 4.06
CLTB-207ENST00000510734 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.03■■■■■ 4
CLTB-207ENST00000510734 CFTRP13569 1480 aa39.93■■■■□ 3.98
CLTB-207ENST00000510734 NESP48681 1621 aa39.91■■■■□ 3.98
CLTB-207ENST00000510734 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.85■■■■□ 3.97
CLTB-207ENST00000510734 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.65■■■■□ 3.94
CLTB-207ENST00000510734 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.55■■■■□ 3.92
CLTB-207ENST00000510734 PRDM2Q13029 1718 aa39.52■■■■□ 3.92
CLTB-207ENST00000510734 ERCC6Q03468 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
CLTB-207ENST00000510734 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.39■■■■□ 3.9
CLTB-207ENST00000510734 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
CLTB-207ENST00000510734 ABCC8Q09428 1581 aa39.2■■■■□ 3.87
CLTB-207ENST00000510734 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.15■■■■□ 3.86
CLTB-207ENST00000510734 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.15■■■■□ 3.86
CLTB-207ENST00000510734 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
CLTB-207ENST00000510734 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.05■■■■□ 3.84
CLTB-207ENST00000510734 CUX1P39880 1505 aa39.03■■■■□ 3.84
CLTB-207ENST00000510734 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
CLTB-207ENST00000510734 TOPBP1Q92547 1522 aa38.99■■■■□ 3.83
CLTB-207ENST00000510734 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.98■■■■□ 3.83
CLTB-207ENST00000510734 TRIM41Q8WV44 630 aa38.96■■■■□ 3.83
CLTB-207ENST00000510734 SYNJ1O43426 1573 aa38.94■■■■□ 3.82
CLTB-207ENST00000510734 WDR62O43379 1518 aa38.93■■■■□ 3.82
CLTB-207ENST00000510734 TOP2BQ02880 1626 aa38.89■■■■□ 3.82
CLTB-207ENST00000510734 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.84■■■■□ 3.81
CLTB-207ENST00000510734 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.76■■■■□ 3.8
CLTB-207ENST00000510734 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
CLTB-207ENST00000510734 SOGA1O94964 1423 aa38.65■■■■□ 3.78
CLTB-207ENST00000510734 CUX2O14529 1486 aa38.62■■■■□ 3.77
CLTB-207ENST00000510734 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.6■■■■□ 3.77
CLTB-207ENST00000510734 IFT140Q96RY7 1462 aa38.53■■■■□ 3.76
CLTB-207ENST00000510734 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CLTB-207ENST00000510734 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.42■■■■□ 3.74
CLTB-207ENST00000510734 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
CLTB-207ENST00000510734 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
CLTB-207ENST00000510734 WDR97A6NE52 1622 aa38.27■■■■□ 3.72
CLTB-207ENST00000510734 KIF27Q86VH2 1401 aa38.27■■■■□ 3.72
CLTB-207ENST00000510734 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
CLTB-207ENST00000510734 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.22■■■■□ 3.71
CLTB-207ENST00000510734 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.18■■■■□ 3.7
CLTB-207ENST00000510734 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
CLTB-207ENST00000510734 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.12■■■■□ 3.69
CLTB-207ENST00000510734 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
CLTB-207ENST00000510734 EEA1Q15075 1411 aa38.11■■■■□ 3.69
CLTB-207ENST00000510734 GRIN2BQ13224 1484 aa38.04■■■■□ 3.68
CLTB-207ENST00000510734 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.03■■■■□ 3.68
CLTB-207ENST00000510734 IGF1RP08069 1367 aa38.03■■■■□ 3.68
CLTB-207ENST00000510734 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.96■■■■□ 3.67
CLTB-207ENST00000510734 PBRM1Q86U86 1689 aa37.91■■■■□ 3.66
CLTB-207ENST00000510734 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.87■■■■□ 3.65
CLTB-207ENST00000510734 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.83■■■■□ 3.65
CLTB-207ENST00000510734 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
CLTB-207ENST00000510734 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.77■■■■□ 3.64
CLTB-207ENST00000510734 CUL7Q14999 1698 aa37.74■■■■□ 3.63
CLTB-207ENST00000510734 PRXQ9BXM0 1461 aa37.73■■■■□ 3.63
CLTB-207ENST00000510734 FBLN2P98095 1184 aa37.71■■■■□ 3.63
CLTB-207ENST00000510734 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
CLTB-207ENST00000510734 ADAMTS12P58397 1594 aa37.71■■■■□ 3.63
CLTB-207ENST00000510734 SYNJ2O15056 1496 aa37.67■■■■□ 3.62
CLTB-207ENST00000510734 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.67■■■■□ 3.62
CLTB-207ENST00000510734 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.65■■■■□ 3.62
CLTB-207ENST00000510734 KIF21BO75037 1637 aa37.57■■■■□ 3.61
CLTB-207ENST00000510734 GRIN2AQ12879 1464 aa37.54■■■■□ 3.6
CLTB-207ENST00000510734 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.51■■■■□ 3.59
CLTB-207ENST00000510734 GOLGA3Q08378 1498 aa37.5■■■■□ 3.59
CLTB-207ENST00000510734 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CLTB-207ENST00000510734 CHD1O14646 1710 aa37.43■■■■□ 3.58
CLTB-207ENST00000510734 NUP160Q12769 1436 aa37.33■■■■□ 3.57
CLTB-207ENST00000510734 OSCARQ8IYS5 282 aa37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms