RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507582.1

LINC01018-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1018, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC01018, Length 2,223 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01018-202ENST00000507582 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.08■■■■■ 4.81
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LINC01018-202ENST00000507582 NACADO15069 1562 aa37.07■■■■□ 3.53
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LINC01018-202ENST00000507582 SCRIBQ14160 1630 aa36.48■■■■□ 3.43
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LINC01018-202ENST00000507582 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.45■■■■□ 3.11
LINC01018-202ENST00000507582 SMARCA2P51531 1590 aa34.36■■■■□ 3.09
LINC01018-202ENST00000507582 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.35■■■■□ 3.09
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LINC01018-202ENST00000507582 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.35■■■□□ 2.93
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LINC01018-202ENST00000507582 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.21■■■□□ 2.91
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LINC01018-202ENST00000507582 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33■■■□□ 2.87
LINC01018-202ENST00000507582 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33■■■□□ 2.87
LINC01018-202ENST00000507582 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.98■■■□□ 2.87
LINC01018-202ENST00000507582 ERCC6Q03468 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
LINC01018-202ENST00000507582 ABCC8Q09428 1581 aa32.9■■■□□ 2.86
LINC01018-202ENST00000507582 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.87■■■□□ 2.85
LINC01018-202ENST00000507582 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.7■■■□□ 2.82
LINC01018-202ENST00000507582 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.7■■■□□ 2.82
LINC01018-202ENST00000507582 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
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LINC01018-202ENST00000507582 CUX2O14529 1486 aa32.25■■■□□ 2.75
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LINC01018-202ENST00000507582 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
LINC01018-202ENST00000507582 IFT140Q96RY7 1462 aa32.08■■■□□ 2.73
LINC01018-202ENST00000507582 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
LINC01018-202ENST00000507582 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.07■■■□□ 2.72
LINC01018-202ENST00000507582 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
LINC01018-202ENST00000507582 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.03■■■□□ 2.72
LINC01018-202ENST00000507582 WDR97A6NE52 1622 aa32.01■■■□□ 2.71
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LINC01018-202ENST00000507582 KIF27Q86VH2 1401 aa31.92■■■□□ 2.7
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LINC01018-202ENST00000507582 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.85■■■□□ 2.69
LINC01018-202ENST00000507582 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.8■■■□□ 2.68
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LINC01018-202ENST00000507582 GRIN2BQ13224 1484 aa31.7■■■□□ 2.67
LINC01018-202ENST00000507582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.64■■■□□ 2.66
LINC01018-202ENST00000507582 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.63■■■□□ 2.65
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LINC01018-202ENST00000507582 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.54■■■□□ 2.64
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LINC01018-202ENST00000507582 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
LINC01018-202ENST00000507582 PRXQ9BXM0 1461 aa31.48■■■□□ 2.63
LINC01018-202ENST00000507582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
LINC01018-202ENST00000507582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.47■■■□□ 2.63
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LINC01018-202ENST00000507582 SYNJ2O15056 1496 aa31.4■■■□□ 2.62
LINC01018-202ENST00000507582 KIF21BO75037 1637 aa31.39■■■□□ 2.62
LINC01018-202ENST00000507582 CHD1O14646 1710 aa31.38■■■□□ 2.61
LINC01018-202ENST00000507582 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
LINC01018-202ENST00000507582 GRIN2AQ12879 1464 aa31.33■■■□□ 2.61
LINC01018-202ENST00000507582 GOLGA3Q08378 1498 aa31.32■■■□□ 2.6
LINC01018-202ENST00000507582 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
LINC01018-202ENST00000507582 CEP170Q5SW79 1584 aa31.18■■■□□ 2.58
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