RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505902.5

IPO11-207, Transcript of importin 11, humanhuman

TSL 4

Gene IPO11, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO11-207ENST00000505902 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.14■■■■■ 5.3
IPO11-207ENST00000505902 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.85■■■■■ 4.45
IPO11-207ENST00000505902 ABCC9O60706 1549 aa41.69■■■■■ 4.26
IPO11-207ENST00000505902 NACADO15069 1562 aa40.31■■■■■ 4.04
IPO11-207ENST00000505902 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.31■■■■■ 4.04
IPO11-207ENST00000505902 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.16■■■■■ 4.02
IPO11-207ENST00000505902 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
IPO11-207ENST00000505902 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.09■■■■■ 4.01
IPO11-207ENST00000505902 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.97■■■■□ 3.99
IPO11-207ENST00000505902 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.17■■■■□ 3.86
IPO11-207ENST00000505902 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.93■■■■□ 3.82
IPO11-207ENST00000505902 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.93■■■■□ 3.82
IPO11-207ENST00000505902 SCRIBQ14160 1630 aa38.91■■■■□ 3.82
IPO11-207ENST00000505902 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.84■■■■□ 3.81
IPO11-207ENST00000505902 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.12■■■■□ 3.69
IPO11-207ENST00000505902 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
IPO11-207ENST00000505902 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.76■■■■□ 3.63
IPO11-207ENST00000505902 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.54■■■■□ 3.6
IPO11-207ENST00000505902 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
IPO11-207ENST00000505902 SMARCA4P51532 1647 aa37.31■■■■□ 3.56
IPO11-207ENST00000505902 SMARCA2P51531 1590 aa37.17■■■■□ 3.54
IPO11-207ENST00000505902 NCAPD3P42695 1498 aa37.17■■■■□ 3.54
IPO11-207ENST00000505902 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.12■■■■□ 3.53
IPO11-207ENST00000505902 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.04■■■■□ 3.52
IPO11-207ENST00000505902 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
IPO11-207ENST00000505902 HMGXB3Q12766 1538 aa36.99■■■■□ 3.51
IPO11-207ENST00000505902 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
IPO11-207ENST00000505902 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
IPO11-207ENST00000505902 WIZO95785 1651 aa36.57■■■■□ 3.44
IPO11-207ENST00000505902 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
IPO11-207ENST00000505902 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.19■■■■□ 3.38
IPO11-207ENST00000505902 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.06■■■■□ 3.36
IPO11-207ENST00000505902 ERCC6Q03468 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
IPO11-207ENST00000505902 NESP48681 1621 aa36.04■■■■□ 3.36
IPO11-207ENST00000505902 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.98■■■■□ 3.35
IPO11-207ENST00000505902 CFTRP13569 1480 aa35.86■■■■□ 3.33
IPO11-207ENST00000505902 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.84■■■■□ 3.33
IPO11-207ENST00000505902 CUX2O14529 1486 aa35.73■■■■□ 3.31
IPO11-207ENST00000505902 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
IPO11-207ENST00000505902 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.65■■■■□ 3.3
IPO11-207ENST00000505902 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.6■■■■□ 3.29
IPO11-207ENST00000505902 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.59■■■■□ 3.29
IPO11-207ENST00000505902 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
IPO11-207ENST00000505902 PRDM2Q13029 1718 aa35.54■■■■□ 3.28
IPO11-207ENST00000505902 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.52■■■■□ 3.28
IPO11-207ENST00000505902 WDR62O43379 1518 aa35.39■■■■□ 3.26
IPO11-207ENST00000505902 ABCC8Q09428 1581 aa35.22■■■■□ 3.23
IPO11-207ENST00000505902 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
IPO11-207ENST00000505902 TOPBP1Q92547 1522 aa35.02■■■■□ 3.2
IPO11-207ENST00000505902 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.02■■■■□ 3.2
IPO11-207ENST00000505902 IFT140Q96RY7 1462 aa34.88■■■■□ 3.17
IPO11-207ENST00000505902 CUX1P39880 1505 aa34.73■■■■□ 3.15
IPO11-207ENST00000505902 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
IPO11-207ENST00000505902 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.63■■■■□ 3.13
IPO11-207ENST00000505902 SOGA1O94964 1423 aa34.63■■■■□ 3.13
IPO11-207ENST00000505902 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
IPO11-207ENST00000505902 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.13
IPO11-207ENST00000505902 WDR97A6NE52 1622 aa34.55■■■■□ 3.12
IPO11-207ENST00000505902 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
IPO11-207ENST00000505902 TOP2BQ02880 1626 aa34.52■■■■□ 3.12
IPO11-207ENST00000505902 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.51■■■■□ 3.12
IPO11-207ENST00000505902 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.5■■■■□ 3.11
IPO11-207ENST00000505902 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.49■■■■□ 3.11
IPO11-207ENST00000505902 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
IPO11-207ENST00000505902 SYNJ1O43426 1573 aa34.4■■■■□ 3.1
IPO11-207ENST00000505902 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.38■■■■□ 3.09
IPO11-207ENST00000505902 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
IPO11-207ENST00000505902 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
IPO11-207ENST00000505902 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
IPO11-207ENST00000505902 OSCARQ8IYS5 282 aa34.24■■■■□ 3.07
IPO11-207ENST00000505902 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.23■■■■□ 3.07
IPO11-207ENST00000505902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
IPO11-207ENST00000505902 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.17■■■■□ 3.06
IPO11-207ENST00000505902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.1■■■■□ 3.05
IPO11-207ENST00000505902 PBRM1Q86U86 1689 aa34.07■■■■□ 3.04
IPO11-207ENST00000505902 SYNJ2O15056 1496 aa34.01■■■■□ 3.04
IPO11-207ENST00000505902 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34■■■■□ 3.03
IPO11-207ENST00000505902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
IPO11-207ENST00000505902 FBLN2P98095 1184 aa33.99■■■■□ 3.03
IPO11-207ENST00000505902 CHD1O14646 1710 aa33.97■■■■□ 3.03
IPO11-207ENST00000505902 KIF27Q86VH2 1401 aa33.94■■■■□ 3.02
IPO11-207ENST00000505902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.87■■■■□ 3.01
IPO11-207ENST00000505902 ADAMTS12P58397 1594 aa33.84■■■■□ 3.01
IPO11-207ENST00000505902 TRIM41Q8WV44 630 aa33.82■■■■□ 3
IPO11-207ENST00000505902 GRIN2AQ12879 1464 aa33.77■■■■□ 3
IPO11-207ENST00000505902 IGF1RP08069 1367 aa33.72■■■□□ 2.99
IPO11-207ENST00000505902 CUL7Q14999 1698 aa33.69■■■□□ 2.98
IPO11-207ENST00000505902 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.69■■■□□ 2.98
IPO11-207ENST00000505902 NUP160Q12769 1436 aa33.63■■■□□ 2.97
IPO11-207ENST00000505902 ARHGEF11O15085 1522 aa33.58■■■□□ 2.97
IPO11-207ENST00000505902 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.55■■■□□ 2.96
IPO11-207ENST00000505902 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.54■■■□□ 2.96
IPO11-207ENST00000505902 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.54■■■□□ 2.96
IPO11-207ENST00000505902 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.54■■■□□ 2.96
IPO11-207ENST00000505902 CEP170Q5SW79 1584 aa33.51■■■□□ 2.96
IPO11-207ENST00000505902 EEA1Q15075 1411 aa33.41■■■□□ 2.94
IPO11-207ENST00000505902 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.39■■■□□ 2.94
IPO11-207ENST00000505902 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.37■■■□□ 2.93
IPO11-207ENST00000505902 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.36■■■□□ 2.93
IPO11-207ENST00000505902 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms