RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498526.1

CCDC74B-211, Transcript of coiled-coil domain containing 74B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC74B, Length 572 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74B-211ENST00000498526 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.19■■■■■ 6.27
CCDC74B-211ENST00000498526 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.14■■■■■ 5.3
CCDC74B-211ENST00000498526 ABCC9O60706 1549 aa47■■■■■ 5.11
CCDC74B-211ENST00000498526 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.31■■■■■ 4.84
CCDC74B-211ENST00000498526 NACADO15069 1562 aa45.3■■■■■ 4.84
CCDC74B-211ENST00000498526 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.23■■■■■ 4.83
CCDC74B-211ENST00000498526 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
CCDC74B-211ENST00000498526 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.11■■■■■ 4.81
CCDC74B-211ENST00000498526 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.91■■■■■ 4.78
CCDC74B-211ENST00000498526 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.13■■■■■ 4.66
CCDC74B-211ENST00000498526 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.93■■■■■ 4.62
CCDC74B-211ENST00000498526 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.86■■■■■ 4.61
CCDC74B-211ENST00000498526 SCRIBQ14160 1630 aa43.84■■■■■ 4.61
CCDC74B-211ENST00000498526 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.57■■■■■ 4.57
CCDC74B-211ENST00000498526 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.07■■■■■ 4.49
CCDC74B-211ENST00000498526 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
CCDC74B-211ENST00000498526 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.53■■■■■ 4.4
CCDC74B-211ENST00000498526 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.27■■■■■ 4.36
CCDC74B-211ENST00000498526 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CCDC74B-211ENST00000498526 SMARCA4P51532 1647 aa42■■■■■ 4.31
CCDC74B-211ENST00000498526 NCAPD3P42695 1498 aa41.82■■■■■ 4.29
CCDC74B-211ENST00000498526 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.8■■■■■ 4.28
CCDC74B-211ENST00000498526 SMARCA2P51531 1590 aa41.78■■■■■ 4.28
CCDC74B-211ENST00000498526 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.71■■■■■ 4.27
CCDC74B-211ENST00000498526 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.65■■■■■ 4.26
CCDC74B-211ENST00000498526 HMGXB3Q12766 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
CCDC74B-211ENST00000498526 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
CCDC74B-211ENST00000498526 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CCDC74B-211ENST00000498526 WIZO95785 1651 aa41.23■■■■■ 4.19
CCDC74B-211ENST00000498526 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
CCDC74B-211ENST00000498526 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.67■■■■■ 4.1
CCDC74B-211ENST00000498526 NESP48681 1621 aa40.66■■■■■ 4.1
CCDC74B-211ENST00000498526 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.6■■■■■ 4.09
CCDC74B-211ENST00000498526 ERCC6Q03468 1493 aa40.56■■■■■ 4.08
CCDC74B-211ENST00000498526 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.44■■■■■ 4.06
CCDC74B-211ENST00000498526 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.39■■■■■ 4.06
CCDC74B-211ENST00000498526 CFTRP13569 1480 aa40.35■■■■■ 4.05
CCDC74B-211ENST00000498526 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CCDC74B-211ENST00000498526 CUX2O14529 1486 aa40.16■■■■■ 4.02
CCDC74B-211ENST00000498526 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.15■■■■■ 4.02
CCDC74B-211ENST00000498526 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.08■■■■■ 4.01
CCDC74B-211ENST00000498526 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
CCDC74B-211ENST00000498526 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.04■■■■■ 4
CCDC74B-211ENST00000498526 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.97■■■■□ 3.99
CCDC74B-211ENST00000498526 PRDM2Q13029 1718 aa39.96■■■■□ 3.99
CCDC74B-211ENST00000498526 WDR62O43379 1518 aa39.82■■■■□ 3.97
CCDC74B-211ENST00000498526 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
CCDC74B-211ENST00000498526 ABCC8Q09428 1581 aa39.55■■■■□ 3.92
CCDC74B-211ENST00000498526 TOPBP1Q92547 1522 aa39.44■■■■□ 3.9
CCDC74B-211ENST00000498526 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.41■■■■□ 3.9
CCDC74B-211ENST00000498526 IFT140Q96RY7 1462 aa39.23■■■■□ 3.87
CCDC74B-211ENST00000498526 CUX1P39880 1505 aa39.14■■■■□ 3.86
CCDC74B-211ENST00000498526 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
CCDC74B-211ENST00000498526 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.01■■■■□ 3.84
CCDC74B-211ENST00000498526 SOGA1O94964 1423 aa38.99■■■■□ 3.83
CCDC74B-211ENST00000498526 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
CCDC74B-211ENST00000498526 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.97■■■■□ 3.83
CCDC74B-211ENST00000498526 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CCDC74B-211ENST00000498526 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.9■■■■□ 3.82
CCDC74B-211ENST00000498526 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.85■■■■□ 3.81
CCDC74B-211ENST00000498526 TOP2BQ02880 1626 aa38.85■■■■□ 3.81
CCDC74B-211ENST00000498526 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.81■■■■□ 3.8
CCDC74B-211ENST00000498526 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
CCDC74B-211ENST00000498526 SYNJ1O43426 1573 aa38.78■■■■□ 3.8
CCDC74B-211ENST00000498526 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
CCDC74B-211ENST00000498526 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.77■■■■□ 3.8
CCDC74B-211ENST00000498526 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
CCDC74B-211ENST00000498526 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.68■■■■□ 3.78
CCDC74B-211ENST00000498526 GRIN2BQ13224 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
CCDC74B-211ENST00000498526 OSCARQ8IYS5 282 aa38.53■■■■□ 3.76
CCDC74B-211ENST00000498526 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.53■■■■□ 3.76
CCDC74B-211ENST00000498526 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.46■■■■□ 3.75
CCDC74B-211ENST00000498526 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CCDC74B-211ENST00000498526 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.41■■■■□ 3.74
CCDC74B-211ENST00000498526 PBRM1Q86U86 1689 aa38.34■■■■□ 3.73
CCDC74B-211ENST00000498526 FBLN2P98095 1184 aa38.31■■■■□ 3.72
CCDC74B-211ENST00000498526 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
CCDC74B-211ENST00000498526 SYNJ2O15056 1496 aa38.27■■■■□ 3.72
CCDC74B-211ENST00000498526 CHD1O14646 1710 aa38.25■■■■□ 3.71
CCDC74B-211ENST00000498526 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.23■■■■□ 3.71
CCDC74B-211ENST00000498526 KIF27Q86VH2 1401 aa38.18■■■■□ 3.7
CCDC74B-211ENST00000498526 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
CCDC74B-211ENST00000498526 TRIM41Q8WV44 630 aa38.11■■■■□ 3.69
CCDC74B-211ENST00000498526 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
CCDC74B-211ENST00000498526 IGF1RP08069 1367 aa38.01■■■■□ 3.68
CCDC74B-211ENST00000498526 GRIN2AQ12879 1464 aa38■■■■□ 3.67
CCDC74B-211ENST00000498526 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.92■■■■□ 3.66
CCDC74B-211ENST00000498526 CUL7Q14999 1698 aa37.87■■■■□ 3.65
CCDC74B-211ENST00000498526 NUP160Q12769 1436 aa37.86■■■■□ 3.65
CCDC74B-211ENST00000498526 ARHGEF11O15085 1522 aa37.82■■■■□ 3.64
CCDC74B-211ENST00000498526 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.78■■■■□ 3.64
CCDC74B-211ENST00000498526 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
CCDC74B-211ENST00000498526 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
CCDC74B-211ENST00000498526 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
CCDC74B-211ENST00000498526 CEP170Q5SW79 1584 aa37.76■■■■□ 3.63
CCDC74B-211ENST00000498526 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.72■■■■□ 3.63
CCDC74B-211ENST00000498526 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.66■■■■□ 3.62
CCDC74B-211ENST00000498526 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.56■■■■□ 3.6
CCDC74B-211ENST00000498526 EEA1Q15075 1411 aa37.53■■■■□ 3.6
CCDC74B-211ENST00000498526 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms