RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.63■■■■■ 6.02
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.4■■■■■ 5.02
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCC9O60706 1549 aa44.92■■■■■ 4.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
GRAMD1C-215ENST00000498183 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.83■■■■■ 4.61
GRAMD1C-215ENST00000498183 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.48■■■■■ 4.55
GRAMD1C-215ENST00000498183 NACADO15069 1562 aa43.48■■■■■ 4.55
GRAMD1C-215ENST00000498183 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.38■■■■■ 4.54
GRAMD1C-215ENST00000498183 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.38■■■■■ 4.54
GRAMD1C-215ENST00000498183 SCRIBQ14160 1630 aa42.53■■■■■ 4.4
GRAMD1C-215ENST00000498183 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.48■■■■■ 4.39
GRAMD1C-215ENST00000498183 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
GRAMD1C-215ENST00000498183 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
GRAMD1C-215ENST00000498183 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.13■■■■■ 4.33
GRAMD1C-215ENST00000498183 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
GRAMD1C-215ENST00000498183 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
GRAMD1C-215ENST00000498183 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
GRAMD1C-215ENST00000498183 SMARCA4P51532 1647 aa40.69■■■■■ 4.1
GRAMD1C-215ENST00000498183 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.69■■■■■ 4.1
GRAMD1C-215ENST00000498183 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.64■■■■■ 4.1
GRAMD1C-215ENST00000498183 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.61■■■■■ 4.09
GRAMD1C-215ENST00000498183 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
GRAMD1C-215ENST00000498183 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.31■■■■■ 4.04
GRAMD1C-215ENST00000498183 WIZO95785 1651 aa40.24■■■■■ 4.03
GRAMD1C-215ENST00000498183 SMARCA2P51531 1590 aa40.23■■■■■ 4.03
GRAMD1C-215ENST00000498183 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.22■■■■■ 4.03
GRAMD1C-215ENST00000498183 NCAPD3P42695 1498 aa40.14■■■■■ 4.02
GRAMD1C-215ENST00000498183 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
GRAMD1C-215ENST00000498183 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
GRAMD1C-215ENST00000498183 HMGXB3Q12766 1538 aa39.97■■■■□ 3.99
GRAMD1C-215ENST00000498183 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.37■■■■□ 3.89
GRAMD1C-215ENST00000498183 NESP48681 1621 aa39.09■■■■□ 3.85
GRAMD1C-215ENST00000498183 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.04■■■■□ 3.84
GRAMD1C-215ENST00000498183 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.95■■■■□ 3.83
GRAMD1C-215ENST00000498183 CFTRP13569 1480 aa38.93■■■■□ 3.82
GRAMD1C-215ENST00000498183 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.68■■■■□ 3.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.6■■■■□ 3.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.6■■■■□ 3.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ERCC6Q03468 1493 aa38.6■■■■□ 3.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.47■■■■□ 3.75
GRAMD1C-215ENST00000498183 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.28■■■■□ 3.72
GRAMD1C-215ENST00000498183 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
GRAMD1C-215ENST00000498183 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCC8Q09428 1581 aa38.17■■■■□ 3.7
GRAMD1C-215ENST00000498183 WDR62O43379 1518 aa38.11■■■■□ 3.69
GRAMD1C-215ENST00000498183 TOPBP1Q92547 1522 aa38.07■■■■□ 3.69
GRAMD1C-215ENST00000498183 CUX1P39880 1505 aa38.07■■■■□ 3.68
GRAMD1C-215ENST00000498183 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.06■■■■□ 3.68
GRAMD1C-215ENST00000498183 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.68
GRAMD1C-215ENST00000498183 SYNJ1O43426 1573 aa37.95■■■■□ 3.67
GRAMD1C-215ENST00000498183 CUX2O14529 1486 aa37.88■■■■□ 3.65
GRAMD1C-215ENST00000498183 TOP2BQ02880 1626 aa37.86■■■■□ 3.65
GRAMD1C-215ENST00000498183 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.85■■■■□ 3.65
GRAMD1C-215ENST00000498183 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.82■■■■□ 3.64
GRAMD1C-215ENST00000498183 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.7■■■■□ 3.63
GRAMD1C-215ENST00000498183 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.69■■■■□ 3.62
GRAMD1C-215ENST00000498183 TRIM41Q8WV44 630 aa37.66■■■■□ 3.62
GRAMD1C-215ENST00000498183 SOGA1O94964 1423 aa37.66■■■■□ 3.62
GRAMD1C-215ENST00000498183 IFT140Q96RY7 1462 aa37.63■■■■□ 3.61
GRAMD1C-215ENST00000498183 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
GRAMD1C-215ENST00000498183 WDR97A6NE52 1622 aa37.43■■■■□ 3.58
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.43■■■■□ 3.58
GRAMD1C-215ENST00000498183 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
GRAMD1C-215ENST00000498183 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
GRAMD1C-215ENST00000498183 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
GRAMD1C-215ENST00000498183 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.23■■■■□ 3.55
GRAMD1C-215ENST00000498183 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.22■■■■□ 3.55
GRAMD1C-215ENST00000498183 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.19■■■■□ 3.54
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF27Q86VH2 1401 aa37.17■■■■□ 3.54
GRAMD1C-215ENST00000498183 GRIN2BQ13224 1484 aa37.1■■■■□ 3.53
GRAMD1C-215ENST00000498183 PBRM1Q86U86 1689 aa37.09■■■■□ 3.53
GRAMD1C-215ENST00000498183 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.01■■■■□ 3.51
GRAMD1C-215ENST00000498183 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
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GRAMD1C-215ENST00000498183 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.97■■■■□ 3.51
GRAMD1C-215ENST00000498183 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
GRAMD1C-215ENST00000498183 EEA1Q15075 1411 aa36.85■■■■□ 3.49
GRAMD1C-215ENST00000498183 ADAMTS12P58397 1594 aa36.83■■■■□ 3.49
GRAMD1C-215ENST00000498183 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.83■■■■□ 3.49
GRAMD1C-215ENST00000498183 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.8■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 FBLN2P98095 1184 aa36.8■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.78■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 SYNJ2O15056 1496 aa36.77■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 CUL7Q14999 1698 aa36.77■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHD1O14646 1710 aa36.73■■■■□ 3.47
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GRAMD1C-215ENST00000498183 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.6■■■■□ 3.45
GRAMD1C-215ENST00000498183 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.51■■■■□ 3.44
GRAMD1C-215ENST00000498183 OSCARQ8IYS5 282 aa36.5■■■■□ 3.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF21BO75037 1637 aa36.47■■■■□ 3.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 CEP170Q5SW79 1584 aa36.46■■■■□ 3.43
GRAMD1C-215ENST00000498183 NUP160Q12769 1436 aa36.43■■■■□ 3.42
GRAMD1C-215ENST00000498183 GOLGA3Q08378 1498 aa36.34■■■■□ 3.41
GRAMD1C-215ENST00000498183 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.31■■■■□ 3.4
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