RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496086.6

GPR17-205, Transcript of G protein-coupled receptor 17, humanhuman

TSL 4

Gene GPR17, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR17-205ENST00000496086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.26■■■■□ 3.72
GPR17-205ENST00000496086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.9■■■■□ 3.02
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GPR17-205ENST00000496086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
GPR17-205ENST00000496086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.88■■■□□ 2.69
GPR17-205ENST00000496086 NACADO15069 1562 aa31.85■■■□□ 2.69
GPR17-205ENST00000496086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.85■■■□□ 2.69
GPR17-205ENST00000496086 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.7■■■□□ 2.67
GPR17-205ENST00000496086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.64■■■□□ 2.66
GPR17-205ENST00000496086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.18■■■□□ 2.58
GPR17-205ENST00000496086 SCRIBQ14160 1630 aa31■■■□□ 2.55
GPR17-205ENST00000496086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
GPR17-205ENST00000496086 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.96■■■□□ 2.55
GPR17-205ENST00000496086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.54■■■□□ 2.48
GPR17-205ENST00000496086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.33■■■□□ 2.45
GPR17-205ENST00000496086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
GPR17-205ENST00000496086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.94■■■□□ 2.38
GPR17-205ENST00000496086 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.84■■■□□ 2.37
GPR17-205ENST00000496086 SMARCA4P51532 1647 aa29.65■■■□□ 2.34
GPR17-205ENST00000496086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
GPR17-205ENST00000496086 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.52■■■□□ 2.32
GPR17-205ENST00000496086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.48■■■□□ 2.31
GPR17-205ENST00000496086 NCAPD3P42695 1498 aa29.42■■■□□ 2.3
GPR17-205ENST00000496086 SMARCA2P51531 1590 aa29.39■■■□□ 2.29
GPR17-205ENST00000496086 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.35■■■□□ 2.29
GPR17-205ENST00000496086 HMGXB3Q12766 1538 aa29.27■■■□□ 2.28
GPR17-205ENST00000496086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
GPR17-205ENST00000496086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
GPR17-205ENST00000496086 WIZO95785 1651 aa29.19■■■□□ 2.26
GPR17-205ENST00000496086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GPR17-205ENST00000496086 NESP48681 1621 aa28.72■■■□□ 2.19
GPR17-205ENST00000496086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
GPR17-205ENST00000496086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
GPR17-205ENST00000496086 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.56■■■□□ 2.16
GPR17-205ENST00000496086 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.55■■■□□ 2.16
GPR17-205ENST00000496086 ERCC6Q03468 1493 aa28.46■■■□□ 2.15
GPR17-205ENST00000496086 CFTRP13569 1480 aa28.43■■■□□ 2.14
GPR17-205ENST00000496086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.38■■■□□ 2.13
GPR17-205ENST00000496086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.34■■■□□ 2.13
GPR17-205ENST00000496086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.24■■■□□ 2.11
GPR17-205ENST00000496086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GPR17-205ENST00000496086 PRDM2Q13029 1718 aa28.18■■■□□ 2.1
GPR17-205ENST00000496086 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.17■■■□□ 2.1
GPR17-205ENST00000496086 CUX2O14529 1486 aa28.13■■■□□ 2.09
GPR17-205ENST00000496086 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.12■■■□□ 2.09
GPR17-205ENST00000496086 WDR62O43379 1518 aa28.02■■■□□ 2.08
GPR17-205ENST00000496086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GPR17-205ENST00000496086 TOPBP1Q92547 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
GPR17-205ENST00000496086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.77■■■□□ 2.04
GPR17-205ENST00000496086 ABCC8Q09428 1581 aa27.75■■■□□ 2.03
GPR17-205ENST00000496086 CUX1P39880 1505 aa27.67■■■□□ 2.02
GPR17-205ENST00000496086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
GPR17-205ENST00000496086 IFT140Q96RY7 1462 aa27.57■■■□□ 2
GPR17-205ENST00000496086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.54■■■□□ 2
GPR17-205ENST00000496086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.49■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 SYNJ1O43426 1573 aa27.48■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 SOGA1O94964 1423 aa27.46■■□□□ 1.99
GPR17-205ENST00000496086 TOP2BQ02880 1626 aa27.44■■□□□ 1.98
GPR17-205ENST00000496086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.44■■□□□ 1.98
GPR17-205ENST00000496086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GPR17-205ENST00000496086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
GPR17-205ENST00000496086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
GPR17-205ENST00000496086 WDR97A6NE52 1622 aa27.3■■□□□ 1.96
GPR17-205ENST00000496086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.27■■□□□ 1.96
GPR17-205ENST00000496086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.16■■□□□ 1.94
GPR17-205ENST00000496086 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.14■■□□□ 1.94
GPR17-205ENST00000496086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.14■■□□□ 1.94
GPR17-205ENST00000496086 GRIN2BQ13224 1484 aa27.12■■□□□ 1.93
GPR17-205ENST00000496086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.08■■□□□ 1.93
GPR17-205ENST00000496086 PBRM1Q86U86 1689 aa27.07■■□□□ 1.92
GPR17-205ENST00000496086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
GPR17-205ENST00000496086 CHD1O14646 1710 aa26.99■■□□□ 1.91
GPR17-205ENST00000496086 OSCARQ8IYS5 282 aa26.98■■□□□ 1.91
GPR17-205ENST00000496086 FBLN2P98095 1184 aa26.94■■□□□ 1.9
GPR17-205ENST00000496086 TRIM41Q8WV44 630 aa26.93■■□□□ 1.9
GPR17-205ENST00000496086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.93■■□□□ 1.9
GPR17-205ENST00000496086 SYNJ2O15056 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
GPR17-205ENST00000496086 KIF27Q86VH2 1401 aa26.9■■□□□ 1.9
GPR17-205ENST00000496086 ADAMTS12P58397 1594 aa26.88■■□□□ 1.89
GPR17-205ENST00000496086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
GPR17-205ENST00000496086 IGF1RP08069 1367 aa26.83■■□□□ 1.88
GPR17-205ENST00000496086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.82■■□□□ 1.88
GPR17-205ENST00000496086 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
GPR17-205ENST00000496086 GRIN2AQ12879 1464 aa26.78■■□□□ 1.88
GPR17-205ENST00000496086 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.76■■□□□ 1.87
GPR17-205ENST00000496086 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.72■■□□□ 1.87
GPR17-205ENST00000496086 CUL7Q14999 1698 aa26.7■■□□□ 1.86
GPR17-205ENST00000496086 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
GPR17-205ENST00000496086 CEP170Q5SW79 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
GPR17-205ENST00000496086 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.65■■□□□ 1.86
GPR17-205ENST00000496086 ARHGEF11O15085 1522 aa26.58■■□□□ 1.85
GPR17-205ENST00000496086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
GPR17-205ENST00000496086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
GPR17-205ENST00000496086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
GPR17-205ENST00000496086 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.49■■□□□ 1.83
GPR17-205ENST00000496086 PRXQ9BXM0 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
GPR17-205ENST00000496086 EEA1Q15075 1411 aa26.46■■□□□ 1.83
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