RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495678.5

PLP1-218, Transcript of proteolipid protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PLP1, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLP1-218ENST00000495678 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PLP1-218ENST00000495678 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.12■■□□□ 1.29
PLP1-218ENST00000495678 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.71■■□□□ 1.23
PLP1-218ENST00000495678 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PLP1-218ENST00000495678 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PLP1-218ENST00000495678 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.16■□□□□ 0.82
PLP1-218ENST00000495678 ABCC9O60706 1549 aa19.06■□□□□ 0.64
PLP1-218ENST00000495678 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
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PLP1-218ENST00000495678 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.78■□□□□ 0.6
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PLP1-218ENST00000495678 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.64■□□□□ 0.58
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PLP1-218ENST00000495678 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.64■□□□□ 0.57
PLP1-218ENST00000495678 SCRIBQ14160 1630 aa18.43■□□□□ 0.54
PLP1-218ENST00000495678 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.38■□□□□ 0.53
PLP1-218ENST00000495678 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.35■□□□□ 0.53
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PLP1-218ENST00000495678 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
PLP1-218ENST00000495678 SMARCA2P51531 1590 aa17.37■□□□□ 0.37
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PLP1-218ENST00000495678 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.32■□□□□ 0.36
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PLP1-218ENST00000495678 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PLP1-218ENST00000495678 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.24■□□□□ 0.35
PLP1-218ENST00000495678 HMGXB3Q12766 1538 aa17.21■□□□□ 0.35
PLP1-218ENST00000495678 NCAPD3P42695 1498 aa17.09■□□□□ 0.33
PLP1-218ENST00000495678 PRDM2Q13029 1718 aa17.01■□□□□ 0.31
PLP1-218ENST00000495678 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.97■□□□□ 0.31
PLP1-218ENST00000495678 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.74■□□□□ 0.27
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PLP1-218ENST00000495678 CFTRP13569 1480 aa16.67■□□□□ 0.26
PLP1-218ENST00000495678 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.66■□□□□ 0.26
PLP1-218ENST00000495678 ABCC8Q09428 1581 aa16.65■□□□□ 0.26
PLP1-218ENST00000495678 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.64■□□□□ 0.26
PLP1-218ENST00000495678 NESP48681 1621 aa16.62■□□□□ 0.25
PLP1-218ENST00000495678 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.55■□□□□ 0.24
PLP1-218ENST00000495678 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.54■□□□□ 0.24
PLP1-218ENST00000495678 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.54■□□□□ 0.24
PLP1-218ENST00000495678 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.53■□□□□ 0.24
PLP1-218ENST00000495678 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
PLP1-218ENST00000495678 SYNJ1O43426 1573 aa16.51■□□□□ 0.23
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PLP1-218ENST00000495678 TRIM41Q8WV44 630 aa16.48■□□□□ 0.23
PLP1-218ENST00000495678 POTEDQ86YR6 584 aa16.47■□□□□ 0.23
PLP1-218ENST00000495678 ERCC6Q03468 1493 aa16.47■□□□□ 0.23
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PLP1-218ENST00000495678 CUX1P39880 1505 aa16.43■□□□□ 0.22
PLP1-218ENST00000495678 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.41■□□□□ 0.22
PLP1-218ENST00000495678 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PLP1-218ENST00000495678 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.37■□□□□ 0.21
PLP1-218ENST00000495678 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PLP1-218ENST00000495678 TOPBP1Q92547 1522 aa16.35■□□□□ 0.21
PLP1-218ENST00000495678 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PLP1-218ENST00000495678 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.31■□□□□ 0.2
PLP1-218ENST00000495678 WDR62O43379 1518 aa16.3■□□□□ 0.2
PLP1-218ENST00000495678 WDR97A6NE52 1622 aa16.29■□□□□ 0.2
PLP1-218ENST00000495678 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PLP1-218ENST00000495678 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.2■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 PBRM1Q86U86 1689 aa16.2■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 EEA1Q15075 1411 aa16.19■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 CUX2O14529 1486 aa16.16■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PLP1-218ENST00000495678 SOGA1O94964 1423 aa16.14■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 KIF27Q86VH2 1401 aa16.14■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.14■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.14■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.12■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 IFT140Q96RY7 1462 aa16.11■□□□□ 0.17
PLP1-218ENST00000495678 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.09■□□□□ 0.17
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PLP1-218ENST00000495678 GOLGA3Q08378 1498 aa15.99■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.99■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.99■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.98■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.98■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PLP1-218ENST00000495678 ADAMTS12P58397 1594 aa15.96■□□□□ 0.14
PLP1-218ENST00000495678 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PLP1-218ENST00000495678 GRIN2BQ13224 1484 aa15.93■□□□□ 0.14
PLP1-218ENST00000495678 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
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