RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494559.5

PDZRN3-211, Transcript of PDZ domain containing ring finger 3, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3, Length 2,080 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-211ENST00000494559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.93■■■■□ 3.02
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PDZRN3-211ENST00000494559 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
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PDZRN3-211ENST00000494559 SCRIBQ14160 1630 aa27.08■■□□□ 1.92
PDZRN3-211ENST00000494559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.79■■□□□ 1.88
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PDZRN3-211ENST00000494559 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.43■■□□□ 1.82
PDZRN3-211ENST00000494559 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.38■■□□□ 1.81
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PDZRN3-211ENST00000494559 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.27■■□□□ 1.8
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PDZRN3-211ENST00000494559 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.06■■□□□ 1.76
PDZRN3-211ENST00000494559 SMARCA4P51532 1647 aa25.97■■□□□ 1.75
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PDZRN3-211ENST00000494559 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
PDZRN3-211ENST00000494559 TRIM41Q8WV44 630 aa25.59■■□□□ 1.69
PDZRN3-211ENST00000494559 SMARCA2P51531 1590 aa25.59■■□□□ 1.69
PDZRN3-211ENST00000494559 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.56■■□□□ 1.68
PDZRN3-211ENST00000494559 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.48■■□□□ 1.67
PDZRN3-211ENST00000494559 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.42■■□□□ 1.66
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PDZRN3-211ENST00000494559 ABCC8Q09428 1581 aa25.22■■□□□ 1.63
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PDZRN3-211ENST00000494559 NCAPD3P42695 1498 aa25.08■■□□□ 1.61
PDZRN3-211ENST00000494559 HMGXB3Q12766 1538 aa25.08■■□□□ 1.6
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PDZRN3-211ENST00000494559 SYNJ1O43426 1573 aa24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3-211ENST00000494559 SOGA1O94964 1423 aa24.86■■□□□ 1.57
PDZRN3-211ENST00000494559 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3-211ENST00000494559 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.85■■□□□ 1.57
PDZRN3-211ENST00000494559 EEA1Q15075 1411 aa24.82■■□□□ 1.56
PDZRN3-211ENST00000494559 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.77■■□□□ 1.56
PDZRN3-211ENST00000494559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 CFTRP13569 1480 aa24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 TOP2BQ02880 1626 aa24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.66■■□□□ 1.54
PDZRN3-211ENST00000494559 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.59■■□□□ 1.53
PDZRN3-211ENST00000494559 PRDM2Q13029 1718 aa24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3-211ENST00000494559 HRCP23327 699 aa24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3-211ENST00000494559 GOLGA3Q08378 1498 aa24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3-211ENST00000494559 KIF21BO75037 1637 aa24.52■■□□□ 1.52
PDZRN3-211ENST00000494559 CUX1P39880 1505 aa24.52■■□□□ 1.52
PDZRN3-211ENST00000494559 CEP162Q5TB80 1403 aa24.5■■□□□ 1.51
PDZRN3-211ENST00000494559 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3-211ENST00000494559 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.48■■□□□ 1.51
PDZRN3-211ENST00000494559 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
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PDZRN3-211ENST00000494559 KIF27Q86VH2 1401 aa24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3-211ENST00000494559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3-211ENST00000494559 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3-211ENST00000494559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3-211ENST00000494559 CLIP1P30622 1438 aa24.18■■□□□ 1.46
PDZRN3-211ENST00000494559 NESP48681 1621 aa24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3-211ENST00000494559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.15■■□□□ 1.46
PDZRN3-211ENST00000494559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3-211ENST00000494559 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3-211ENST00000494559 CUX2O14529 1486 aa24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3-211ENST00000494559 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3-211ENST00000494559 TOPBP1Q92547 1522 aa24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3-211ENST00000494559 IGF1RP08069 1367 aa24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3-211ENST00000494559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.02■■□□□ 1.44
PDZRN3-211ENST00000494559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.93■■□□□ 1.42
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PDZRN3-211ENST00000494559 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 ARAP1Q96P48 1450 aa23.91■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.9■■□□□ 1.42
PDZRN3-211ENST00000494559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.85■■□□□ 1.41
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PDZRN3-211ENST00000494559 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.81■■□□□ 1.4
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PDZRN3-211ENST00000494559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.71■■□□□ 1.39
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PDZRN3-211ENST00000494559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.59■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.58■■□□□ 1.37
PDZRN3-211ENST00000494559 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PDZRN3-211ENST00000494559 MAP3K1Q13233 1512 aa23.51■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.51■■□□□ 1.35
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