RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492582.5

CHKB-212, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-212ENST00000492582 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.57■■■■■ 7.61
CHKB-212ENST00000492582 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.89■■■■■ 6.22
CHKB-212ENST00000492582 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.81■■■■■ 6.04
CHKB-212ENST00000492582 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.11■■■■■ 5.93
CHKB-212ENST00000492582 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.61■■■■■ 5.85
CHKB-212ENST00000492582 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.48■■■■■ 5.83
CHKB-212ENST00000492582 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
CHKB-212ENST00000492582 ABCC9O60706 1549 aa50.6■■■■■ 5.69
CHKB-212ENST00000492582 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.52■■■■■ 5.68
CHKB-212ENST00000492582 SCRIBQ14160 1630 aa49.94■■■■■ 5.59
CHKB-212ENST00000492582 NACADO15069 1562 aa49.94■■■■■ 5.58
CHKB-212ENST00000492582 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.26■■■■■ 5.48
CHKB-212ENST00000492582 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.06■■■■■ 5.44
CHKB-212ENST00000492582 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
CHKB-212ENST00000492582 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.65■■■■■ 5.38
CHKB-212ENST00000492582 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.47■■■■■ 5.35
CHKB-212ENST00000492582 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.43■■■■■ 5.34
CHKB-212ENST00000492582 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
CHKB-212ENST00000492582 WIZO95785 1651 aa48.16■■■■■ 5.3
CHKB-212ENST00000492582 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.87■■■■■ 5.25
CHKB-212ENST00000492582 SMARCA4P51532 1647 aa47.86■■■■■ 5.25
CHKB-212ENST00000492582 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.63■■■■■ 5.219e-7■□□□□ 10.2
CHKB-212ENST00000492582 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
CHKB-212ENST00000492582 TRIM41Q8WV44 630 aa47.45■■■■■ 5.19
CHKB-212ENST00000492582 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.33■■■■■ 5.17
CHKB-212ENST00000492582 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
CHKB-212ENST00000492582 SMARCA2P51531 1590 aa47.22■■■■■ 5.15
CHKB-212ENST00000492582 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.19■■■■■ 5.14
CHKB-212ENST00000492582 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.15■■■■■ 5.14
CHKB-212ENST00000492582 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
CHKB-212ENST00000492582 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
CHKB-212ENST00000492582 ABCC8Q09428 1581 aa46.65■■■■■ 5.06
CHKB-212ENST00000492582 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
CHKB-212ENST00000492582 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.38■■■■■ 5.02
CHKB-212ENST00000492582 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.17■■■■■ 4.98
CHKB-212ENST00000492582 HMGXB3Q12766 1538 aa46.15■■■■■ 4.98
CHKB-212ENST00000492582 NCAPD3P42695 1498 aa46.13■■■■■ 4.98
CHKB-212ENST00000492582 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.1■■■■■ 4.97
CHKB-212ENST00000492582 SOGA1O94964 1423 aa46.01■■■■■ 4.96
CHKB-212ENST00000492582 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
CHKB-212ENST00000492582 EEA1Q15075 1411 aa45.96■■■■■ 4.95
CHKB-212ENST00000492582 HRCP23327 699 aa45.94■■■■■ 4.95
CHKB-212ENST00000492582 SYNJ1O43426 1573 aa45.93■■■■■ 4.94
CHKB-212ENST00000492582 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.8■■■■■ 4.92
CHKB-212ENST00000492582 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.8■■■■■ 4.92
CHKB-212ENST00000492582 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.7■■■■■ 4.91
CHKB-212ENST00000492582 TOP2BQ02880 1626 aa45.56■■■■■ 4.88
CHKB-212ENST00000492582 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.55■■■■■ 4.88
CHKB-212ENST00000492582 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.49■■■■■ 4.87
CHKB-212ENST00000492582 CFTRP13569 1480 aa45.47■■■■■ 4.87
CHKB-212ENST00000492582 GOLGA3Q08378 1498 aa45.47■■■■■ 4.87
CHKB-212ENST00000492582 CEP162Q5TB80 1403 aa45.45■■■■■ 4.87
CHKB-212ENST00000492582 KIF21BO75037 1637 aa45.36■■■■■ 4.85
CHKB-212ENST00000492582 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.33■■■■■ 4.85
CHKB-212ENST00000492582 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
CHKB-212ENST00000492582 PRDM2Q13029 1718 aa45.24■■■■■ 4.83
CHKB-212ENST00000492582 CUX1P39880 1505 aa45.23■■■■■ 4.83
CHKB-212ENST00000492582 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.11■■■■■ 4.81
CHKB-212ENST00000492582 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
CHKB-212ENST00000492582 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.07■■■■■ 4.81
CHKB-212ENST00000492582 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45■■■■■ 4.79
CHKB-212ENST00000492582 PRXQ9BXM0 1461 aa44.82■■■■■ 4.77
CHKB-212ENST00000492582 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.82■■■■■ 4.77
CHKB-212ENST00000492582 CLIP1P30622 1438 aa44.81■■■■■ 4.76
CHKB-212ENST00000492582 KIF27Q86VH2 1401 aa44.8■■■■■ 4.76
CHKB-212ENST00000492582 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
CHKB-212ENST00000492582 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.62■■■■■ 4.73
CHKB-212ENST00000492582 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.58■■■■■ 4.73
CHKB-212ENST00000492582 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.54■■■■■ 4.72
CHKB-212ENST00000492582 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
CHKB-212ENST00000492582 CUX2O14529 1486 aa44.48■■■■■ 4.71
CHKB-212ENST00000492582 NESP48681 1621 aa44.44■■■■■ 4.7
CHKB-212ENST00000492582 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.38■■■■■ 4.69
CHKB-212ENST00000492582 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.35■■■■■ 4.69
CHKB-212ENST00000492582 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
CHKB-212ENST00000492582 IGF1RP08069 1367 aa44.33■■■■■ 4.69
CHKB-212ENST00000492582 TOPBP1Q92547 1522 aa44.26■■■■■ 4.68
CHKB-212ENST00000492582 ARAP1Q96P48 1450 aa44.26■■■■■ 4.68
CHKB-212ENST00000492582 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
CHKB-212ENST00000492582 APLP2Q06481 763 aa44.13■■■■■ 4.66
CHKB-212ENST00000492582 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.12■■■■■ 4.65
CHKB-212ENST00000492582 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.11■■■■■ 4.65
CHKB-212ENST00000492582 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
CHKB-212ENST00000492582 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.09■■■■■ 4.65
CHKB-212ENST00000492582 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
CHKB-212ENST00000492582 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.03■■■■■ 4.64
CHKB-212ENST00000492582 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
CHKB-212ENST00000492582 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.98■■■■■ 4.63
CHKB-212ENST00000492582 WDR97A6NE52 1622 aa43.88■■■■■ 4.62
CHKB-212ENST00000492582 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.83■■■■■ 4.61
CHKB-212ENST00000492582 CUL7Q14999 1698 aa43.8■■■■■ 4.6
CHKB-212ENST00000492582 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.68■■■■■ 4.58
CHKB-212ENST00000492582 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
CHKB-212ENST00000492582 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
CHKB-212ENST00000492582 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
CHKB-212ENST00000492582 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.53■■■■■ 4.56
CHKB-212ENST00000492582 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.53■■■■■ 4.56
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CHKB-212ENST00000492582 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
CHKB-212ENST00000492582 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.45■■■■■ 4.55
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