RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491731.1

USP20-207, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-207ENST00000491731 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.05■■■□□ 2.72
USP20-207ENST00000491731 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.48■■■□□ 2.15
USP20-207ENST00000491731 ABCC9O60706 1549 aa28.12■■■□□ 2.09
USP20-207ENST00000491731 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.02■■□□□ 1.92
USP20-207ENST00000491731 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.93■■□□□ 1.9
USP20-207ENST00000491731 NACADO15069 1562 aa26.86■■□□□ 1.89
USP20-207ENST00000491731 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
USP20-207ENST00000491731 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.62■■□□□ 1.85
USP20-207ENST00000491731 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.47■■□□□ 1.83
USP20-207ENST00000491731 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
USP20-207ENST00000491731 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.22■■□□□ 1.79
USP20-207ENST00000491731 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.08■■□□□ 1.77
USP20-207ENST00000491731 SCRIBQ14160 1630 aa26.07■■□□□ 1.76
USP20-207ENST00000491731 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.91■■□□□ 1.74
USP20-207ENST00000491731 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
USP20-207ENST00000491731 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
USP20-207ENST00000491731 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.36■■□□□ 1.65
USP20-207ENST00000491731 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.26■■□□□ 1.63
USP20-207ENST00000491731 SMARCA4P51532 1647 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-207ENST00000491731 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
USP20-207ENST00000491731 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.81■■□□□ 1.56
USP20-207ENST00000491731 NCAPD3P42695 1498 aa24.8■■□□□ 1.56
USP20-207ENST00000491731 SMARCA2P51531 1590 aa24.76■■□□□ 1.55
USP20-207ENST00000491731 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.71■■□□□ 1.55
USP20-207ENST00000491731 HMGXB3Q12766 1538 aa24.64■■□□□ 1.53
USP20-207ENST00000491731 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP20-207ENST00000491731 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.61■■□□□ 1.53
USP20-207ENST00000491731 WIZO95785 1651 aa24.43■■□□□ 1.5
USP20-207ENST00000491731 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP20-207ENST00000491731 NESP48681 1621 aa24.28■■□□□ 1.48
USP20-207ENST00000491731 ERCC6Q03468 1493 aa24.26■■□□□ 1.47
USP20-207ENST00000491731 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
USP20-207ENST00000491731 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-207ENST00000491731 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.11■■□□□ 1.45
USP20-207ENST00000491731 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.05■■□□□ 1.44
USP20-207ENST00000491731 CUX2O14529 1486 aa23.98■■□□□ 1.43
USP20-207ENST00000491731 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.92■■□□□ 1.42
USP20-207ENST00000491731 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.91■■□□□ 1.42
USP20-207ENST00000491731 CFTRP13569 1480 aa23.91■■□□□ 1.42
USP20-207ENST00000491731 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP20-207ENST00000491731 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.83■■□□□ 1.41
USP20-207ENST00000491731 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
USP20-207ENST00000491731 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.81■■□□□ 1.4
USP20-207ENST00000491731 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.79■■□□□ 1.4
USP20-207ENST00000491731 WDR62O43379 1518 aa23.68■■□□□ 1.38
USP20-207ENST00000491731 PRDM2Q13029 1718 aa23.62■■□□□ 1.37
USP20-207ENST00000491731 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
USP20-207ENST00000491731 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.43■■□□□ 1.34
USP20-207ENST00000491731 TOPBP1Q92547 1522 aa23.42■■□□□ 1.34
USP20-207ENST00000491731 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
USP20-207ENST00000491731 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.36■■□□□ 1.33
USP20-207ENST00000491731 IFT140Q96RY7 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
USP20-207ENST00000491731 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
USP20-207ENST00000491731 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP20-207ENST00000491731 CUX1P39880 1505 aa23.18■■□□□ 1.3
USP20-207ENST00000491731 SOGA1O94964 1423 aa23.16■■□□□ 1.3
USP20-207ENST00000491731 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.15■■□□□ 1.3
USP20-207ENST00000491731 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.15■■□□□ 1.3
USP20-207ENST00000491731 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
USP20-207ENST00000491731 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.295e-9■■■■□ 24.2
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USP20-207ENST00000491731 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP20-207ENST00000491731 OSCARQ8IYS5 282 aa23.05■■□□□ 1.28
USP20-207ENST00000491731 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
USP20-207ENST00000491731 TOP2BQ02880 1626 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 SYNJ1O43426 1573 aa22.94■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 FBLN2P98095 1184 aa22.93■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 WDR97A6NE52 1622 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.91■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.9■■□□□ 1.26
USP20-207ENST00000491731 GRIN2BQ13224 1484 aa22.87■■□□□ 1.25
USP20-207ENST00000491731 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.86■■□□□ 1.25
USP20-207ENST00000491731 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.86■■□□□ 1.25
USP20-207ENST00000491731 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP20-207ENST00000491731 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP20-207ENST00000491731 CHD1O14646 1710 aa22.79■■□□□ 1.24
USP20-207ENST00000491731 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.78■■□□□ 1.24
USP20-207ENST00000491731 PBRM1Q86U86 1689 aa22.75■■□□□ 1.23
USP20-207ENST00000491731 SYNJ2O15056 1496 aa22.73■■□□□ 1.23
USP20-207ENST00000491731 TRIM41Q8WV44 630 aa22.7■■□□□ 1.22
USP20-207ENST00000491731 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 ARHGEF11O15085 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 ADAMTS12P58397 1594 aa22.59■■□□□ 1.21
USP20-207ENST00000491731 KIF27Q86VH2 1401 aa22.57■■□□□ 1.2
USP20-207ENST00000491731 GRIN2AQ12879 1464 aa22.57■■□□□ 1.2
USP20-207ENST00000491731 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
USP20-207ENST00000491731 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-207ENST00000491731 IGF1RP08069 1367 aa22.49■■□□□ 1.19
USP20-207ENST00000491731 NUP160Q12769 1436 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-207ENST00000491731 CEP170Q5SW79 1584 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-207ENST00000491731 ARAP1Q96P48 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-207ENST00000491731 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-207ENST00000491731 CUL7Q14999 1698 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-207ENST00000491731 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
USP20-207ENST00000491731 JPH4Q96JJ6 628 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-207ENST00000491731 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
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