RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491522.1

PHF21B-210, Transcript of PHD finger protein 21B, humanhuman

TSL 2

Gene PHF21B, Length 575 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21B-210ENST00000491522 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.77■■■■■ 6.68
PHF21B-210ENST00000491522 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.35■■■■■ 5.65
PHF21B-210ENST00000491522 ABCC9O60706 1549 aa48.96■■■■■ 5.43
PHF21B-210ENST00000491522 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
PHF21B-210ENST00000491522 NACADO15069 1562 aa47.26■■■■■ 5.16
PHF21B-210ENST00000491522 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.25■■■■■ 5.15
PHF21B-210ENST00000491522 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.24■■■■■ 5.15
PHF21B-210ENST00000491522 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.09■■■■■ 5.13
PHF21B-210ENST00000491522 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47■■■■■ 5.12
PHF21B-210ENST00000491522 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.11■■■■■ 4.97
PHF21B-210ENST00000491522 SCRIBQ14160 1630 aa45.97■■■■■ 4.95
PHF21B-210ENST00000491522 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.79■■■■■ 4.92
PHF21B-210ENST00000491522 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.78■■■■■ 4.92
PHF21B-210ENST00000491522 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.38■■■■■ 4.86
PHF21B-210ENST00000491522 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.6■■■■■ 4.73
PHF21B-210ENST00000491522 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
PHF21B-210ENST00000491522 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.29■■■■■ 4.68
PHF21B-210ENST00000491522 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.18■■■■■ 4.66
PHF21B-210ENST00000491522 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
PHF21B-210ENST00000491522 SMARCA4P51532 1647 aa43.99■■■■■ 4.63
PHF21B-210ENST00000491522 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.75■■■■■ 4.59
PHF21B-210ENST00000491522 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.68■■■■■ 4.58
PHF21B-210ENST00000491522 SMARCA2P51531 1590 aa43.65■■■■■ 4.58
PHF21B-210ENST00000491522 NCAPD3P42695 1498 aa43.59■■■■■ 4.57
PHF21B-210ENST00000491522 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.56■■■■■ 4.56
PHF21B-210ENST00000491522 HMGXB3Q12766 1538 aa43.44■■■■■ 4.54
PHF21B-210ENST00000491522 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
PHF21B-210ENST00000491522 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
PHF21B-210ENST00000491522 WIZO95785 1651 aa43.28■■■■■ 4.52
PHF21B-210ENST00000491522 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
PHF21B-210ENST00000491522 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
PHF21B-210ENST00000491522 NESP48681 1621 aa42.45■■■■■ 4.39
PHF21B-210ENST00000491522 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.4■■■■■ 4.38
PHF21B-210ENST00000491522 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.35■■■■■ 4.37
PHF21B-210ENST00000491522 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.34■■■■■ 4.37
PHF21B-210ENST00000491522 ERCC6Q03468 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
PHF21B-210ENST00000491522 CFTRP13569 1480 aa42.17■■■■■ 4.34
PHF21B-210ENST00000491522 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.12■■■■■ 4.33
PHF21B-210ENST00000491522 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.95■■■■■ 4.31
PHF21B-210ENST00000491522 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.87■■■■■ 4.29
PHF21B-210ENST00000491522 PRDM2Q13029 1718 aa41.84■■■■■ 4.29
PHF21B-210ENST00000491522 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.8■■■■■ 4.28
PHF21B-210ENST00000491522 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
PHF21B-210ENST00000491522 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.68■■■■■ 4.26
PHF21B-210ENST00000491522 CUX2O14529 1486 aa41.65■■■■■ 4.26
PHF21B-210ENST00000491522 WDR62O43379 1518 aa41.54■■■■■ 4.24
PHF21B-210ENST00000491522 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
PHF21B-210ENST00000491522 ABCC8Q09428 1581 aa41.24■■■■■ 4.19
PHF21B-210ENST00000491522 TOPBP1Q92547 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
PHF21B-210ENST00000491522 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.23■■■■■ 4.19
PHF21B-210ENST00000491522 CUX1P39880 1505 aa41.03■■■■■ 4.16
PHF21B-210ENST00000491522 IFT140Q96RY7 1462 aa40.92■■■■■ 4.14
PHF21B-210ENST00000491522 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PHF21B-210ENST00000491522 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
PHF21B-210ENST00000491522 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.86■■■■■ 4.13
PHF21B-210ENST00000491522 SYNJ1O43426 1573 aa40.78■■■■■ 4.12
PHF21B-210ENST00000491522 TOP2BQ02880 1626 aa40.77■■■■■ 4.12
PHF21B-210ENST00000491522 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.76■■■■■ 4.12
PHF21B-210ENST00000491522 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
PHF21B-210ENST00000491522 SOGA1O94964 1423 aa40.73■■■■■ 4.11
PHF21B-210ENST00000491522 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.71■■■■■ 4.11
PHF21B-210ENST00000491522 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
PHF21B-210ENST00000491522 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PHF21B-210ENST00000491522 WDR97A6NE52 1622 aa40.5■■■■■ 4.07
PHF21B-210ENST00000491522 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.48■■■■■ 4.07
PHF21B-210ENST00000491522 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.07
PHF21B-210ENST00000491522 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
PHF21B-210ENST00000491522 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.3■■■■■ 4.04
PHF21B-210ENST00000491522 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.28■■■■■ 4.04
PHF21B-210ENST00000491522 GRIN2BQ13224 1484 aa40.25■■■■■ 4.03
PHF21B-210ENST00000491522 PBRM1Q86U86 1689 aa40.17■■■■■ 4.02
PHF21B-210ENST00000491522 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.15■■■■■ 4.02
PHF21B-210ENST00000491522 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
PHF21B-210ENST00000491522 TRIM41Q8WV44 630 aa40.1■■■■■ 4.01
PHF21B-210ENST00000491522 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
PHF21B-210ENST00000491522 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40■■■■□ 3.99
PHF21B-210ENST00000491522 CHD1O14646 1710 aa39.95■■■■□ 3.99
PHF21B-210ENST00000491522 SYNJ2O15056 1496 aa39.94■■■■□ 3.98
PHF21B-210ENST00000491522 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.94■■■■□ 3.98
PHF21B-210ENST00000491522 FBLN2P98095 1184 aa39.92■■■■□ 3.98
PHF21B-210ENST00000491522 OSCARQ8IYS5 282 aa39.92■■■■□ 3.98
PHF21B-210ENST00000491522 ADAMTS12P58397 1594 aa39.91■■■■□ 3.98
PHF21B-210ENST00000491522 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
PHF21B-210ENST00000491522 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.83■■■■□ 3.97
PHF21B-210ENST00000491522 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.8■■■■□ 3.96
PHF21B-210ENST00000491522 IGF1RP08069 1367 aa39.78■■■■□ 3.96
PHF21B-210ENST00000491522 GRIN2AQ12879 1464 aa39.73■■■■□ 3.95
PHF21B-210ENST00000491522 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.71■■■■□ 3.95
PHF21B-210ENST00000491522 CUL7Q14999 1698 aa39.7■■■■□ 3.95
PHF21B-210ENST00000491522 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.58■■■■□ 3.93
PHF21B-210ENST00000491522 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.56■■■■□ 3.92
PHF21B-210ENST00000491522 NUP160Q12769 1436 aa39.54■■■■□ 3.92
PHF21B-210ENST00000491522 CEP170Q5SW79 1584 aa39.51■■■■□ 3.92
PHF21B-210ENST00000491522 EEA1Q15075 1411 aa39.47■■■■□ 3.91
PHF21B-210ENST00000491522 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.38■■■■□ 3.9
PHF21B-210ENST00000491522 PRXQ9BXM0 1461 aa39.32■■■■□ 3.89
PHF21B-210ENST00000491522 ARHGEF11O15085 1522 aa39.32■■■■□ 3.89
PHF21B-210ENST00000491522 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.32■■■■□ 3.89
PHF21B-210ENST00000491522 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.28■■■■□ 3.88
PHF21B-210ENST00000491522 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.28■■■■□ 3.88
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