RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490726.2

MEIS1-210, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS1, Length 474 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-210ENST00000490726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.45■■■□□ 2.63
MEIS1-210ENST00000490726 ABCC9O60706 1549 aa31.11■■■□□ 2.57
MEIS1-210ENST00000490726 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.02■■■□□ 2.56
MEIS1-210ENST00000490726 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS1-210ENST00000490726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.14■■■□□ 2.26
MEIS1-210ENST00000490726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.67■■■□□ 2.18
MEIS1-210ENST00000490726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
MEIS1-210ENST00000490726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.21■■■□□ 2.11
MEIS1-210ENST00000490726 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
MEIS1-210ENST00000490726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS1-210ENST00000490726 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.03■■■□□ 2.08
MEIS1-210ENST00000490726 NACADO15069 1562 aa27.96■■■□□ 2.07
MEIS1-210ENST00000490726 TRIM41Q8WV44 630 aa27.73■■■□□ 2.03
MEIS1-210ENST00000490726 CUX2O14529 1486 aa27.57■■■□□ 2
MEIS1-210ENST00000490726 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
MEIS1-210ENST00000490726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.34■■□□□ 1.97
MEIS1-210ENST00000490726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.26■■□□□ 1.95
MEIS1-210ENST00000490726 ERCC6Q03468 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
MEIS1-210ENST00000490726 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.88■■□□□ 1.89
MEIS1-210ENST00000490726 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
MEIS1-210ENST00000490726 SCRIBQ14160 1630 aa26.47■■□□□ 1.83
MEIS1-210ENST00000490726 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
MEIS1-210ENST00000490726 NESP48681 1621 aa26.19■■□□□ 1.78
MEIS1-210ENST00000490726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
MEIS1-210ENST00000490726 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
MEIS1-210ENST00000490726 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
MEIS1-210ENST00000490726 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.97■■□□□ 1.75
MEIS1-210ENST00000490726 SMARCA2P51531 1590 aa25.95■■□□□ 1.75
MEIS1-210ENST00000490726 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
MEIS1-210ENST00000490726 OSCARQ8IYS5 282 aa25.92■■□□□ 1.74
MEIS1-210ENST00000490726 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
MEIS1-210ENST00000490726 NCAPD3P42695 1498 aa25.84■■□□□ 1.73
MEIS1-210ENST00000490726 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.83■■□□□ 1.73
MEIS1-210ENST00000490726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.81■■□□□ 1.72
MEIS1-210ENST00000490726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
MEIS1-210ENST00000490726 ARHGEF11O15085 1522 aa25.63■■□□□ 1.69
MEIS1-210ENST00000490726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.6■■□□□ 1.69
MEIS1-210ENST00000490726 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS1-210ENST00000490726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.5■■□□□ 1.67
MEIS1-210ENST00000490726 HMGXB3Q12766 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
MEIS1-210ENST00000490726 WDR62O43379 1518 aa25.46■■□□□ 1.67
MEIS1-210ENST00000490726 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.45■■□□□ 1.66
MEIS1-210ENST00000490726 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.42■■□□□ 1.66
MEIS1-210ENST00000490726 ARAP1Q96P48 1450 aa25.26■■□□□ 1.63
MEIS1-210ENST00000490726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MEIS1-210ENST00000490726 SMARCA4P51532 1647 aa25.01■■□□□ 1.59
MEIS1-210ENST00000490726 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.93■■□□□ 1.58
MEIS1-210ENST00000490726 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
MEIS1-210ENST00000490726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
MEIS1-210ENST00000490726 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.76■■□□□ 1.55
MEIS1-210ENST00000490726 CHD1O14646 1710 aa24.74■■□□□ 1.55
MEIS1-210ENST00000490726 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
MEIS1-210ENST00000490726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.7■■□□□ 1.55
MEIS1-210ENST00000490726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
MEIS1-210ENST00000490726 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.64■■□□□ 1.54
MEIS1-210ENST00000490726 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
MEIS1-210ENST00000490726 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEIS1-210ENST00000490726 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.46■■□□□ 1.51
MEIS1-210ENST00000490726 IFT140Q96RY7 1462 aa24.45■■□□□ 1.51
MEIS1-210ENST00000490726 FBXO41Q8TF61 875 aa24.45■■□□□ 1.5
MEIS1-210ENST00000490726 FBLN2P98095 1184 aa24.37■■□□□ 1.49
MEIS1-210ENST00000490726 SOCS7O14512 581 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS1-210ENST00000490726 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.35■■□□□ 1.49
MEIS1-210ENST00000490726 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.33■■□□□ 1.49
MEIS1-210ENST00000490726 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.33■■□□□ 1.48
MEIS1-210ENST00000490726 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS1-210ENST00000490726 CFTRP13569 1480 aa24.26■■□□□ 1.47
MEIS1-210ENST00000490726 ILDR2Q71H61 639 aa24.23■■□□□ 1.47
MEIS1-210ENST00000490726 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.2■■□□□ 1.47
MEIS1-210ENST00000490726 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
MEIS1-210ENST00000490726 SYNJ1O43426 1573 aa24.08■■□□□ 1.44
MEIS1-210ENST00000490726 TOPBP1Q92547 1522 aa24.04■■□□□ 1.44
MEIS1-210ENST00000490726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MEIS1-210ENST00000490726 KDM6BO15054 1643 aa24■■□□□ 1.43
MEIS1-210ENST00000490726 SYNJ2O15056 1496 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS1-210ENST00000490726 ADGRL1O94910 1474 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS1-210ENST00000490726 PRDM2Q13029 1718 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS1-210ENST00000490726 WIZO95785 1651 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS1-210ENST00000490726 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS1-210ENST00000490726 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.88■■□□□ 1.41
MEIS1-210ENST00000490726 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
MEIS1-210ENST00000490726 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.78■■□□□ 1.4
MEIS1-210ENST00000490726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.76■■□□□ 1.39
MEIS1-210ENST00000490726 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.75■■□□□ 1.39
MEIS1-210ENST00000490726 ABCC8Q09428 1581 aa23.73■■□□□ 1.39
MEIS1-210ENST00000490726 TSPOAP1O95153 1857 aa23.71■■□□□ 1.39
MEIS1-210ENST00000490726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
MEIS1-210ENST00000490726 DIP2BQ9P265 1576 aa23.7■■□□□ 1.38
MEIS1-210ENST00000490726 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
MEIS1-210ENST00000490726 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MEIS1-210ENST00000490726 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.62■■□□□ 1.37
MEIS1-210ENST00000490726 CEP170Q5SW79 1584 aa23.56■■□□□ 1.36
MEIS1-210ENST00000490726 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.56■■□□□ 1.36
MEIS1-210ENST00000490726 WDR97A6NE52 1622 aa23.52■■□□□ 1.36
MEIS1-210ENST00000490726 MAPKBP1O60336 1514 aa23.52■■□□□ 1.36
MEIS1-210ENST00000490726 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
MEIS1-210ENST00000490726 SOGA1O94964 1423 aa23.45■■□□□ 1.34
MEIS1-210ENST00000490726 SHROOM2Q13796 1616 aa23.41■■□□□ 1.34
MEIS1-210ENST00000490726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
MEIS1-210ENST00000490726 PBRM1Q86U86 1689 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms