RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489731.1

NOTCH2-204, Transcript of notch 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOTCH2, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-204ENST00000489731 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.88■■■□□ 2.05
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.56■■□□□ 1.52
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCC9O60706 1549 aa23.51■■□□□ 1.35
NOTCH2-204ENST00000489731 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NOTCH2-204ENST00000489731 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.19■■□□□ 1.3
NOTCH2-204ENST00000489731 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.16■■□□□ 1.3
NOTCH2-204ENST00000489731 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.08■■□□□ 1.28
NOTCH2-204ENST00000489731 NACADO15069 1562 aa23.01■■□□□ 1.27
NOTCH2-204ENST00000489731 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.9■■□□□ 1.26
NOTCH2-204ENST00000489731 SCRIBQ14160 1630 aa22.39■■□□□ 1.18
NOTCH2-204ENST00000489731 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.34■■□□□ 1.17
NOTCH2-204ENST00000489731 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.15■■□□□ 1.14
NOTCH2-204ENST00000489731 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
NOTCH2-204ENST00000489731 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.99■■□□□ 1.11
NOTCH2-204ENST00000489731 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.91■■□□□ 1.1
NOTCH2-204ENST00000489731 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NOTCH2-204ENST00000489731 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
NOTCH2-204ENST00000489731 SMARCA4P51532 1647 aa21.49■■□□□ 1.03
NOTCH2-204ENST00000489731 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOTCH2-204ENST00000489731 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOTCH2-204ENST00000489731 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.43■■□□□ 1.02
NOTCH2-204ENST00000489731 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NOTCH2-204ENST00000489731 SMARCA2P51531 1590 aa21.35■■□□□ 1.01
NOTCH2-204ENST00000489731 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.32■■□□□ 1
NOTCH2-204ENST00000489731 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.3■■□□□ 1
NOTCH2-204ENST00000489731 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.26■□□□□ 0.99
NOTCH2-204ENST00000489731 WIZO95785 1651 aa21.21■□□□□ 0.99
NOTCH2-204ENST00000489731 NCAPD3P42695 1498 aa21.2■□□□□ 0.98
NOTCH2-204ENST00000489731 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
NOTCH2-204ENST00000489731 HMGXB3Q12766 1538 aa21.15■□□□□ 0.98
NOTCH2-204ENST00000489731 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NOTCH2-204ENST00000489731 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.83■□□□□ 0.93
NOTCH2-204ENST00000489731 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.64■□□□□ 0.89
NOTCH2-204ENST00000489731 CFTRP13569 1480 aa20.6■□□□□ 0.89
NOTCH2-204ENST00000489731 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.57■□□□□ 0.88
NOTCH2-204ENST00000489731 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.49■□□□□ 0.87
NOTCH2-204ENST00000489731 PRDM2Q13029 1718 aa20.43■□□□□ 0.86
NOTCH2-204ENST00000489731 NESP48681 1621 aa20.38■□□□□ 0.85
NOTCH2-204ENST00000489731 CUX2O14529 1486 aa20.38■□□□□ 0.85
NOTCH2-204ENST00000489731 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.37■□□□□ 0.85
NOTCH2-204ENST00000489731 ERCC6Q03468 1493 aa20.36■□□□□ 0.85
NOTCH2-204ENST00000489731 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.33■□□□□ 0.85
NOTCH2-204ENST00000489731 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
NOTCH2-204ENST00000489731 TRIM41Q8WV44 630 aa20.28■□□□□ 0.84
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCC8Q09428 1581 aa20.27■□□□□ 0.84
NOTCH2-204ENST00000489731 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.27■□□□□ 0.84
NOTCH2-204ENST00000489731 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.2■□□□□ 0.82
NOTCH2-204ENST00000489731 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.17■□□□□ 0.82
NOTCH2-204ENST00000489731 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.16■□□□□ 0.82
NOTCH2-204ENST00000489731 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.13■□□□□ 0.81
NOTCH2-204ENST00000489731 TOP2BQ02880 1626 aa20.12■□□□□ 0.81
NOTCH2-204ENST00000489731 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOTCH2-204ENST00000489731 CUX1P39880 1505 aa20.08■□□□□ 0.81
NOTCH2-204ENST00000489731 TOPBP1Q92547 1522 aa20.08■□□□□ 0.81
NOTCH2-204ENST00000489731 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.08■□□□□ 0.8
NOTCH2-204ENST00000489731 SYNJ1O43426 1573 aa20.06■□□□□ 0.8
NOTCH2-204ENST00000489731 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NOTCH2-204ENST00000489731 WDR62O43379 1518 aa20.03■□□□□ 0.8
NOTCH2-204ENST00000489731 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.99■□□□□ 0.79
NOTCH2-204ENST00000489731 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NOTCH2-204ENST00000489731 SOGA1O94964 1423 aa19.94■□□□□ 0.78
NOTCH2-204ENST00000489731 EEA1Q15075 1411 aa19.93■□□□□ 0.78
NOTCH2-204ENST00000489731 IFT140Q96RY7 1462 aa19.9■□□□□ 0.78
NOTCH2-204ENST00000489731 KIF27Q86VH2 1401 aa19.87■□□□□ 0.77
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.85■□□□□ 0.77
NOTCH2-204ENST00000489731 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.81■□□□□ 0.76
NOTCH2-204ENST00000489731 WDR97A6NE52 1622 aa19.8■□□□□ 0.76
NOTCH2-204ENST00000489731 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.75■□□□□ 0.75
NOTCH2-204ENST00000489731 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
NOTCH2-204ENST00000489731 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
NOTCH2-204ENST00000489731 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.71■□□□□ 0.75
NOTCH2-204ENST00000489731 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NOTCH2-204ENST00000489731 GRIN2BQ13224 1484 aa19.66■□□□□ 0.74
NOTCH2-204ENST00000489731 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.66■□□□□ 0.74
NOTCH2-204ENST00000489731 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.65■□□□□ 0.74
NOTCH2-204ENST00000489731 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.63■□□□□ 0.73
NOTCH2-204ENST00000489731 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
NOTCH2-204ENST00000489731 IGF1RP08069 1367 aa19.62■□□□□ 0.73
NOTCH2-204ENST00000489731 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NOTCH2-204ENST00000489731 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NOTCH2-204ENST00000489731 CUL7Q14999 1698 aa19.58■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.57■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 GOLGA3Q08378 1498 aa19.54■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 PRXQ9BXM0 1461 aa19.54■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 PBRM1Q86U86 1689 aa19.53■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.53■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 KIF21BO75037 1637 aa19.53■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.53■□□□□ 0.72
NOTCH2-204ENST00000489731 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
NOTCH2-204ENST00000489731 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.48■□□□□ 0.71
NOTCH2-204ENST00000489731 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
NOTCH2-204ENST00000489731 SYNJ2O15056 1496 aa19.45■□□□□ 0.7
NOTCH2-204ENST00000489731 ADAMTS12P58397 1594 aa19.44■□□□□ 0.7
NOTCH2-204ENST00000489731 FBLN2P98095 1184 aa19.41■□□□□ 0.7
NOTCH2-204ENST00000489731 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.39■□□□□ 0.69
NOTCH2-204ENST00000489731 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.39■□□□□ 0.69
NOTCH2-204ENST00000489731 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.38■□□□□ 0.69
NOTCH2-204ENST00000489731 GRIN2AQ12879 1464 aa19.35■□□□□ 0.69
NOTCH2-204ENST00000489731 OSCARQ8IYS5 282 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms