RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489578.2

FBXW4-205, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene FBXW4, Length 483 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4-205ENST00000489578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.25■■■□□ 2.43
FBXW4-205ENST00000489578 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.65■■□□□ 1.86
FBXW4-205ENST00000489578 ABCC9O60706 1549 aa25.94■■□□□ 1.74
FBXW4-205ENST00000489578 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.45■■□□□ 1.66
FBXW4-205ENST00000489578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FBXW4-205ENST00000489578 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.04■■□□□ 1.6
FBXW4-205ENST00000489578 NACADO15069 1562 aa25.01■■□□□ 1.59
FBXW4-205ENST00000489578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.98■■□□□ 1.59
FBXW4-205ENST00000489578 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.88■■□□□ 1.57
FBXW4-205ENST00000489578 SCRIBQ14160 1630 aa24.5■■□□□ 1.51
FBXW4-205ENST00000489578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.41■■□□□ 1.5
FBXW4-205ENST00000489578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
FBXW4-205ENST00000489578 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.37■■□□□ 1.49
FBXW4-205ENST00000489578 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.2■■□□□ 1.47
FBXW4-205ENST00000489578 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.61■■□□□ 1.37
FBXW4-205ENST00000489578 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
FBXW4-205ENST00000489578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.52■■□□□ 1.36
FBXW4-205ENST00000489578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FBXW4-205ENST00000489578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.4■■□□□ 1.34
FBXW4-205ENST00000489578 SMARCA4P51532 1647 aa23.39■■□□□ 1.33
FBXW4-205ENST00000489578 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXW4-205ENST00000489578 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FBXW4-205ENST00000489578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.19■■□□□ 1.3
FBXW4-205ENST00000489578 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
FBXW4-205ENST00000489578 WIZO95785 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
FBXW4-205ENST00000489578 SMARCA2P51531 1590 aa23.14■■□□□ 1.3
FBXW4-205ENST00000489578 NCAPD3P42695 1498 aa23.09■■□□□ 1.29
FBXW4-205ENST00000489578 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.08■■□□□ 1.29
FBXW4-205ENST00000489578 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
FBXW4-205ENST00000489578 HMGXB3Q12766 1538 aa22.96■■□□□ 1.27
FBXW4-205ENST00000489578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
FBXW4-205ENST00000489578 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.66■■□□□ 1.22
FBXW4-205ENST00000489578 NESP48681 1621 aa22.53■■□□□ 1.2
FBXW4-205ENST00000489578 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.5■■□□□ 1.19
FBXW4-205ENST00000489578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.41■■□□□ 1.18
FBXW4-205ENST00000489578 CFTRP13569 1480 aa22.38■■□□□ 1.17
FBXW4-205ENST00000489578 PRDM2Q13029 1718 aa22.32■■□□□ 1.16
FBXW4-205ENST00000489578 ERCC6Q03468 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
FBXW4-205ENST00000489578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXW4-205ENST00000489578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.24■■□□□ 1.15
FBXW4-205ENST00000489578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW4-205ENST00000489578 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXW4-205ENST00000489578 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.05■■□□□ 1.12
FBXW4-205ENST00000489578 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.05■■□□□ 1.12
FBXW4-205ENST00000489578 ABCC8Q09428 1581 aa22■■□□□ 1.11
FBXW4-205ENST00000489578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FBXW4-205ENST00000489578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FBXW4-205ENST00000489578 TOPBP1Q92547 1522 aa21.91■■□□□ 1.1
FBXW4-205ENST00000489578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
FBXW4-205ENST00000489578 WDR62O43379 1518 aa21.9■■□□□ 1.1
FBXW4-205ENST00000489578 CUX1P39880 1505 aa21.89■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.88■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.87■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 TRIM41Q8WV44 630 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 SYNJ1O43426 1573 aa21.86■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 TOP2BQ02880 1626 aa21.84■■□□□ 1.09
FBXW4-205ENST00000489578 CUX2O14529 1486 aa21.83■■□□□ 1.08
FBXW4-205ENST00000489578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.77■■□□□ 1.08
FBXW4-205ENST00000489578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
FBXW4-205ENST00000489578 SOGA1O94964 1423 aa21.73■■□□□ 1.07
FBXW4-205ENST00000489578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.73■■□□□ 1.07
FBXW4-205ENST00000489578 IFT140Q96RY7 1462 aa21.67■■□□□ 1.06
FBXW4-205ENST00000489578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FBXW4-205ENST00000489578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FBXW4-205ENST00000489578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
FBXW4-205ENST00000489578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
FBXW4-205ENST00000489578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.54■■□□□ 1.04
FBXW4-205ENST00000489578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.52■■□□□ 1.04
FBXW4-205ENST00000489578 WDR97A6NE52 1622 aa21.5■■□□□ 1.03
FBXW4-205ENST00000489578 EEA1Q15075 1411 aa21.48■■□□□ 1.03
FBXW4-205ENST00000489578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FBXW4-205ENST00000489578 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXW4-205ENST00000489578 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FBXW4-205ENST00000489578 KIF27Q86VH2 1401 aa21.42■■□□□ 1.02
FBXW4-205ENST00000489578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.42■■□□□ 1.02
FBXW4-205ENST00000489578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.38■■□□□ 1.01
FBXW4-205ENST00000489578 GRIN2BQ13224 1484 aa21.38■■□□□ 1.01
FBXW4-205ENST00000489578 FBLN2P98095 1184 aa21.36■■□□□ 1.01
FBXW4-205ENST00000489578 PBRM1Q86U86 1689 aa21.34■■□□□ 1.01
FBXW4-205ENST00000489578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.32■■□□□ 1
FBXW4-205ENST00000489578 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.31■■□□□ 1
FBXW4-205ENST00000489578 IGF1RP08069 1367 aa21.3■■□□□ 1
FBXW4-205ENST00000489578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
FBXW4-205ENST00000489578 KIF21BO75037 1637 aa21.26■□□□□ 0.99
FBXW4-205ENST00000489578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.25■□□□□ 0.99
FBXW4-205ENST00000489578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
FBXW4-205ENST00000489578 CUL7Q14999 1698 aa21.21■□□□□ 0.99
FBXW4-205ENST00000489578 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.21■□□□□ 0.99
FBXW4-205ENST00000489578 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.2■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.2■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 SYNJ2O15056 1496 aa21.17■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 PRXQ9BXM0 1461 aa21.17■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 ADAMTS12P58397 1594 aa21.17■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 CHD1O14646 1710 aa21.16■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 GOLGA3Q08378 1498 aa21.14■□□□□ 0.98
FBXW4-205ENST00000489578 OSCARQ8IYS5 282 aa21.14■□□□□ 0.97
FBXW4-205ENST00000489578 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.13■□□□□ 0.97
FBXW4-205ENST00000489578 GRIN2AQ12879 1464 aa21.09■□□□□ 0.97
FBXW4-205ENST00000489578 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.08■□□□□ 0.97
FBXW4-205ENST00000489578 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
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