RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488445.1

COQ10B-204, Transcript of coenzyme Q10B, humanhuman

TSL 4

Gene COQ10B, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10B-204ENST00000488445 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.38■■■□□ 2.13
COQ10B-204ENST00000488445 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.04■■□□□ 1.6
COQ10B-204ENST00000488445 ABCC9O60706 1549 aa24.15■■□□□ 1.46
COQ10B-204ENST00000488445 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
COQ10B-204ENST00000488445 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.61■■□□□ 1.37
COQ10B-204ENST00000488445 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.61■■□□□ 1.37
COQ10B-204ENST00000488445 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.6■■□□□ 1.37
COQ10B-204ENST00000488445 NACADO15069 1562 aa23.56■■□□□ 1.36
COQ10B-204ENST00000488445 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.48■■□□□ 1.35
COQ10B-204ENST00000488445 SCRIBQ14160 1630 aa22.79■■□□□ 1.24
COQ10B-204ENST00000488445 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.7■■□□□ 1.22
COQ10B-204ENST00000488445 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
COQ10B-204ENST00000488445 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.62■■□□□ 1.21
COQ10B-204ENST00000488445 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.59■■□□□ 1.21
COQ10B-204ENST00000488445 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
COQ10B-204ENST00000488445 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
COQ10B-204ENST00000488445 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.97■■□□□ 1.11
COQ10B-204ENST00000488445 SMARCA4P51532 1647 aa21.88■■□□□ 1.09
COQ10B-204ENST00000488445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.83■■□□□ 1.08
COQ10B-204ENST00000488445 SMARCA2P51531 1590 aa21.81■■□□□ 1.08
COQ10B-204ENST00000488445 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.79■■□□□ 1.08
COQ10B-204ENST00000488445 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.79■■□□□ 1.08
COQ10B-204ENST00000488445 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
COQ10B-204ENST00000488445 NCAPD3P42695 1498 aa21.76■■□□□ 1.07
COQ10B-204ENST00000488445 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.76■■□□□ 1.07
COQ10B-204ENST00000488445 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.74■■□□□ 1.07
COQ10B-204ENST00000488445 HMGXB3Q12766 1538 aa21.65■■□□□ 1.06
COQ10B-204ENST00000488445 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
COQ10B-204ENST00000488445 WIZO95785 1651 aa21.5■■□□□ 1.03
COQ10B-204ENST00000488445 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
COQ10B-204ENST00000488445 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
COQ10B-204ENST00000488445 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.17■□□□□ 0.98
COQ10B-204ENST00000488445 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.15■□□□□ 0.98
COQ10B-204ENST00000488445 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.09■□□□□ 0.97
COQ10B-204ENST00000488445 CFTRP13569 1480 aa21.07■□□□□ 0.96
COQ10B-204ENST00000488445 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.04■□□□□ 0.96
COQ10B-204ENST00000488445 NESP48681 1621 aa20.93■□□□□ 0.94
COQ10B-204ENST00000488445 ERCC6Q03468 1493 aa20.91■□□□□ 0.94
COQ10B-204ENST00000488445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.85■□□□□ 0.93
COQ10B-204ENST00000488445 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.81■□□□□ 0.92
COQ10B-204ENST00000488445 PRDM2Q13029 1718 aa20.71■□□□□ 0.91
COQ10B-204ENST00000488445 ABCC8Q09428 1581 aa20.71■□□□□ 0.91
COQ10B-204ENST00000488445 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.7■□□□□ 0.9
COQ10B-204ENST00000488445 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.62■□□□□ 0.89
COQ10B-204ENST00000488445 CUX2O14529 1486 aa20.59■□□□□ 0.89
COQ10B-204ENST00000488445 WDR62O43379 1518 aa20.58■□□□□ 0.89
COQ10B-204ENST00000488445 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
COQ10B-204ENST00000488445 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
COQ10B-204ENST00000488445 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
COQ10B-204ENST00000488445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.53■□□□□ 0.88
COQ10B-204ENST00000488445 TOPBP1Q92547 1522 aa20.52■□□□□ 0.87
COQ10B-204ENST00000488445 CUX1P39880 1505 aa20.43■□□□□ 0.86
COQ10B-204ENST00000488445 TOP2BQ02880 1626 aa20.4■□□□□ 0.86
COQ10B-204ENST00000488445 IFT140Q96RY7 1462 aa20.4■□□□□ 0.86
COQ10B-204ENST00000488445 TRIM41Q8WV44 630 aa20.37■□□□□ 0.85
COQ10B-204ENST00000488445 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
COQ10B-204ENST00000488445 SOGA1O94964 1423 aa20.36■□□□□ 0.85
COQ10B-204ENST00000488445 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.36■□□□□ 0.85
COQ10B-204ENST00000488445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.34■□□□□ 0.85
COQ10B-204ENST00000488445 SYNJ1O43426 1573 aa20.32■□□□□ 0.84
COQ10B-204ENST00000488445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.24■□□□□ 0.83
COQ10B-204ENST00000488445 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.24■□□□□ 0.83
COQ10B-204ENST00000488445 WDR97A6NE52 1622 aa20.24■□□□□ 0.83
COQ10B-204ENST00000488445 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.22■□□□□ 0.83
COQ10B-204ENST00000488445 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
COQ10B-204ENST00000488445 KIF27Q86VH2 1401 aa20.16■□□□□ 0.82
COQ10B-204ENST00000488445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
COQ10B-204ENST00000488445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
COQ10B-204ENST00000488445 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.11■□□□□ 0.81
COQ10B-204ENST00000488445 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
COQ10B-204ENST00000488445 GRIN2BQ13224 1484 aa20.1■□□□□ 0.81
COQ10B-204ENST00000488445 EEA1Q15075 1411 aa20.07■□□□□ 0.8
COQ10B-204ENST00000488445 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
COQ10B-204ENST00000488445 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.02■□□□□ 0.8
COQ10B-204ENST00000488445 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
COQ10B-204ENST00000488445 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.02■□□□□ 0.79
COQ10B-204ENST00000488445 IGF1RP08069 1367 aa19.97■□□□□ 0.79
COQ10B-204ENST00000488445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
COQ10B-204ENST00000488445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.94■□□□□ 0.78
COQ10B-204ENST00000488445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.93■□□□□ 0.78
COQ10B-204ENST00000488445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.92■□□□□ 0.78
COQ10B-204ENST00000488445 SYNJ2O15056 1496 aa19.92■□□□□ 0.78
COQ10B-204ENST00000488445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.88■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 FBLN2P98095 1184 aa19.88■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 OSCARQ8IYS5 282 aa19.86■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 CUL7Q14999 1698 aa19.86■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 PBRM1Q86U86 1689 aa19.85■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.83■□□□□ 0.77
COQ10B-204ENST00000488445 ADAMTS12P58397 1594 aa19.82■□□□□ 0.76
COQ10B-204ENST00000488445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.79■□□□□ 0.76
COQ10B-204ENST00000488445 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
COQ10B-204ENST00000488445 GRIN2AQ12879 1464 aa19.79■□□□□ 0.76
COQ10B-204ENST00000488445 PRXQ9BXM0 1461 aa19.79■□□□□ 0.76
COQ10B-204ENST00000488445 NUP160Q12769 1436 aa19.7■□□□□ 0.74
COQ10B-204ENST00000488445 KIF21BO75037 1637 aa19.65■□□□□ 0.74
COQ10B-204ENST00000488445 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.64■□□□□ 0.73
COQ10B-204ENST00000488445 CHD1O14646 1710 aa19.63■□□□□ 0.73
COQ10B-204ENST00000488445 GOLGA3Q08378 1498 aa19.63■□□□□ 0.73
COQ10B-204ENST00000488445 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
COQ10B-204ENST00000488445 JPH4Q96JJ6 628 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms