RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.94■■■■■ 7.99
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.79■■■■■ 6.84
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC9O60706 1549 aa56.99■■■■■ 6.71
CCZ1B-211ENST00000486840 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.84■■■■■ 6.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.68■■■■■ 6.34
CCZ1B-211ENST00000486840 NACADO15069 1562 aa54.51■■■■■ 6.32
CCZ1B-211ENST00000486840 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.02■■■■■ 6.24
CCZ1B-211ENST00000486840 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.97■■■■■ 6.23
CCZ1B-211ENST00000486840 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.68■■■■■ 6.18
CCZ1B-211ENST00000486840 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.31■■■■■ 6.12
CCZ1B-211ENST00000486840 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.14■■■■■ 6.1
CCZ1B-211ENST00000486840 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.8■■■■■ 6.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SCRIBQ14160 1630 aa52.8■■■■■ 6.04
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.46■■■■■ 5.99
CCZ1B-211ENST00000486840 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.4■■■■■ 5.98
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.57■■■■■ 5.85
CCZ1B-211ENST00000486840 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.43■■■■■ 5.82
CCZ1B-211ENST00000486840 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.26■■■■■ 5.8
CCZ1B-211ENST00000486840 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.42■■■■■ 5.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SMARCA4P51532 1647 aa50.41■■■■■ 5.66
CCZ1B-211ENST00000486840 NCAPD3P42695 1498 aa50.29■■■■■ 5.64
CCZ1B-211ENST00000486840 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.27■■■■■ 5.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SMARCA2P51531 1590 aa50.26■■■■■ 5.64
CCZ1B-211ENST00000486840 MROH2BQ7Z745 1585 aa50■■■■■ 5.6
CCZ1B-211ENST00000486840 HMGXB3Q12766 1538 aa49.97■■■■■ 5.59
CCZ1B-211ENST00000486840 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.95■■■■■ 5.59
CCZ1B-211ENST00000486840 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.86■■■■■ 5.57
CCZ1B-211ENST00000486840 WIZO95785 1651 aa49.44■■■■■ 5.5
CCZ1B-211ENST00000486840 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.39■■■■■ 5.5
CCZ1B-211ENST00000486840 ERCC6Q03468 1493 aa49.3■■■■■ 5.48
CCZ1B-211ENST00000486840 NESP48681 1621 aa49.13■■■■■ 5.46
CCZ1B-211ENST00000486840 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.02■■■■■ 5.44
CCZ1B-211ENST00000486840 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.95■■■■■ 5.43
CCZ1B-211ENST00000486840 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.9■■■■■ 5.42
CCZ1B-211ENST00000486840 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.87■■■■■ 5.41
CCZ1B-211ENST00000486840 CUX2O14529 1486 aa48.73■■■■■ 5.39
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.47■■■■■ 5.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CFTRP13569 1480 aa48.46■■■■■ 5.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.42■■■■■ 5.34
CCZ1B-211ENST00000486840 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
CCZ1B-211ENST00000486840 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.32■■■■■ 5.33
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.31■■■■■ 5.32
CCZ1B-211ENST00000486840 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.27■■■■■ 5.32
CCZ1B-211ENST00000486840 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR62O43379 1518 aa48■■■■■ 5.27
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM2Q13029 1718 aa47.92■■■■■ 5.26
CCZ1B-211ENST00000486840 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.64■■■■■ 5.22
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC8Q09428 1581 aa47.58■■■■■ 5.21
CCZ1B-211ENST00000486840 TOPBP1Q92547 1522 aa47.46■■■■■ 5.19
CCZ1B-211ENST00000486840 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.37■■■■■ 5.17
CCZ1B-211ENST00000486840 IFT140Q96RY7 1462 aa47.31■■■■■ 5.16
CCZ1B-211ENST00000486840 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.12
CCZ1B-211ENST00000486840 SOGA1O94964 1423 aa46.97■■■■■ 5.11
CCZ1B-211ENST00000486840 CUX1P39880 1505 aa46.93■■■■■ 5.1
CCZ1B-211ENST00000486840 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.9■■■■■ 5.1
CCZ1B-211ENST00000486840 OSCARQ8IYS5 282 aa46.87■■■■■ 5.09
CCZ1B-211ENST00000486840 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.85■■■■■ 5.09
CCZ1B-211ENST00000486840 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
CCZ1B-211ENST00000486840 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.8■■■■■ 5.08
CCZ1B-211ENST00000486840 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
CCZ1B-211ENST00000486840 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
CCZ1B-211ENST00000486840 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.69■■■■■ 5.06
CCZ1B-211ENST00000486840 FBLN2P98095 1184 aa46.59■■■■■ 5.05
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR97A6NE52 1622 aa46.56■■■■■ 5.04
CCZ1B-211ENST00000486840 TOP2BQ02880 1626 aa46.47■■■■■ 5.03
CCZ1B-211ENST00000486840 GRIN2BQ13224 1484 aa46.42■■■■■ 5.02
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.41■■■■■ 5.02
CCZ1B-211ENST00000486840 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.41■■■■■ 5.02
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNJ1O43426 1573 aa46.39■■■■■ 5.02
CCZ1B-211ENST00000486840 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.38■■■■■ 5.01
CCZ1B-211ENST00000486840 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
CCZ1B-211ENST00000486840 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.34■■■■■ 5.01
CCZ1B-211ENST00000486840 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
CCZ1B-211ENST00000486840 CHD1O14646 1710 aa46.21■■■■■ 4.99
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM41Q8WV44 630 aa46.14■■■■■ 4.98
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.14■■■■■ 4.98
CCZ1B-211ENST00000486840 PBRM1Q86U86 1689 aa46.12■■■■■ 4.97
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNJ2O15056 1496 aa46.12■■■■■ 4.97
CCZ1B-211ENST00000486840 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.87■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF11O15085 1522 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF27Q86VH2 1401 aa45.8■■■■■ 4.92
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAMTS12P58397 1594 aa45.77■■■■■ 4.92
CCZ1B-211ENST00000486840 GRIN2AQ12879 1464 aa45.76■■■■■ 4.92
CCZ1B-211ENST00000486840 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.7■■■■■ 4.91
CCZ1B-211ENST00000486840 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.69■■■■■ 4.9
CCZ1B-211ENST00000486840 IGF1RP08069 1367 aa45.55■■■■■ 4.88
CCZ1B-211ENST00000486840 NUP160Q12769 1436 aa45.52■■■■■ 4.88
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP170Q5SW79 1584 aa45.44■■■■■ 4.86
CCZ1B-211ENST00000486840 ARAP1Q96P48 1450 aa45.42■■■■■ 4.86
CCZ1B-211ENST00000486840 CUL7Q14999 1698 aa45.39■■■■■ 4.86
CCZ1B-211ENST00000486840 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.36■■■■■ 4.85
CCZ1B-211ENST00000486840 JPH4Q96JJ6 628 aa45.27■■■■■ 4.84
CCZ1B-211ENST00000486840 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.11■■■■■ 4.81
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