RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486744.3

KRBA1-204, Transcript of KRAB-A domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene KRBA1, Length 596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1-204ENST00000486744 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.24■■■■■ 6.75
KRBA1-204ENST00000486744 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.84■■■■■ 5.73
KRBA1-204ENST00000486744 ABCC9O60706 1549 aa49.47■■■■■ 5.51
KRBA1-204ENST00000486744 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
KRBA1-204ENST00000486744 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.78■■■■■ 5.24
KRBA1-204ENST00000486744 NACADO15069 1562 aa47.76■■■■■ 5.24
KRBA1-204ENST00000486744 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
KRBA1-204ENST00000486744 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.54■■■■■ 5.2
KRBA1-204ENST00000486744 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.4■■■■■ 5.18
KRBA1-204ENST00000486744 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.57■■■■■ 5.05
KRBA1-204ENST00000486744 SCRIBQ14160 1630 aa46.35■■■■■ 5.01
KRBA1-204ENST00000486744 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
KRBA1-204ENST00000486744 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.17■■■■■ 4.98
KRBA1-204ENST00000486744 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.87■■■■■ 4.93
KRBA1-204ENST00000486744 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.1■■■■■ 4.81
KRBA1-204ENST00000486744 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
KRBA1-204ENST00000486744 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.76■■■■■ 4.76
KRBA1-204ENST00000486744 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.49■■■■■ 4.71
KRBA1-204ENST00000486744 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
KRBA1-204ENST00000486744 SMARCA4P51532 1647 aa44.36■■■■■ 4.69
KRBA1-204ENST00000486744 SMARCA2P51531 1590 aa44.09■■■■■ 4.65
KRBA1-204ENST00000486744 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.06■■■■■ 4.64
KRBA1-204ENST00000486744 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.06■■■■■ 4.64
KRBA1-204ENST00000486744 NCAPD3P42695 1498 aa44.03■■■■■ 4.64
KRBA1-204ENST00000486744 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.92■■■■■ 4.62
KRBA1-204ENST00000486744 HMGXB3Q12766 1538 aa43.83■■■■■ 4.61
KRBA1-204ENST00000486744 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
KRBA1-204ENST00000486744 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
KRBA1-204ENST00000486744 WIZO95785 1651 aa43.62■■■■■ 4.57
KRBA1-204ENST00000486744 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
KRBA1-204ENST00000486744 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.87■■■■■ 4.45
KRBA1-204ENST00000486744 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
KRBA1-204ENST00000486744 NESP48681 1621 aa42.82■■■■■ 4.44
KRBA1-204ENST00000486744 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.78■■■■■ 4.44
KRBA1-204ENST00000486744 ERCC6Q03468 1493 aa42.73■■■■■ 4.43
KRBA1-204ENST00000486744 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.68■■■■■ 4.42
KRBA1-204ENST00000486744 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.63■■■■■ 4.41
KRBA1-204ENST00000486744 CFTRP13569 1480 aa42.55■■■■■ 4.4
KRBA1-204ENST00000486744 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.37■■■■■ 4.37
KRBA1-204ENST00000486744 PRDM2Q13029 1718 aa42.28■■■■■ 4.36
KRBA1-204ENST00000486744 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.28■■■■■ 4.36
KRBA1-204ENST00000486744 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
KRBA1-204ENST00000486744 CUX2O14529 1486 aa42.17■■■■■ 4.34
KRBA1-204ENST00000486744 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
KRBA1-204ENST00000486744 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
KRBA1-204ENST00000486744 WDR62O43379 1518 aa41.93■■■■■ 4.3
KRBA1-204ENST00000486744 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
KRBA1-204ENST00000486744 ABCC8Q09428 1581 aa41.75■■■■■ 4.27
KRBA1-204ENST00000486744 TOPBP1Q92547 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
KRBA1-204ENST00000486744 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.6■■■■■ 4.25
KRBA1-204ENST00000486744 IFT140Q96RY7 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
KRBA1-204ENST00000486744 CUX1P39880 1505 aa41.34■■■■■ 4.21
KRBA1-204ENST00000486744 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
KRBA1-204ENST00000486744 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.19
KRBA1-204ENST00000486744 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.2■■■■■ 4.19
KRBA1-204ENST00000486744 SOGA1O94964 1423 aa41.16■■■■■ 4.18
KRBA1-204ENST00000486744 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
KRBA1-204ENST00000486744 TOP2BQ02880 1626 aa41.09■■■■■ 4.17
KRBA1-204ENST00000486744 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.17
KRBA1-204ENST00000486744 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.05■■■■■ 4.16
KRBA1-204ENST00000486744 SYNJ1O43426 1573 aa41.03■■■■■ 4.16
KRBA1-204ENST00000486744 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
KRBA1-204ENST00000486744 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
KRBA1-204ENST00000486744 WDR97A6NE52 1622 aa40.91■■■■■ 4.14
KRBA1-204ENST00000486744 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.87■■■■■ 4.13
KRBA1-204ENST00000486744 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
KRBA1-204ENST00000486744 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.83■■■■■ 4.13
KRBA1-204ENST00000486744 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.68■■■■■ 4.1
KRBA1-204ENST00000486744 GRIN2BQ13224 1484 aa40.65■■■■■ 4.1
KRBA1-204ENST00000486744 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.61■■■■■ 4.09
KRBA1-204ENST00000486744 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.59■■■■■ 4.09
KRBA1-204ENST00000486744 PBRM1Q86U86 1689 aa40.55■■■■■ 4.08
KRBA1-204ENST00000486744 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
KRBA1-204ENST00000486744 OSCARQ8IYS5 282 aa40.52■■■■■ 4.08
KRBA1-204ENST00000486744 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.51■■■■■ 4.08
KRBA1-204ENST00000486744 TRIM41Q8WV44 630 aa40.5■■■■■ 4.07
KRBA1-204ENST00000486744 FBLN2P98095 1184 aa40.46■■■■■ 4.07
KRBA1-204ENST00000486744 KIF27Q86VH2 1401 aa40.41■■■■■ 4.06
KRBA1-204ENST00000486744 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
KRBA1-204ENST00000486744 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.37■■■■■ 4.05
KRBA1-204ENST00000486744 CHD1O14646 1710 aa40.37■■■■■ 4.05
KRBA1-204ENST00000486744 SYNJ2O15056 1496 aa40.35■■■■■ 4.05
KRBA1-204ENST00000486744 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.23■■■■■ 4.03
KRBA1-204ENST00000486744 ADAMTS12P58397 1594 aa40.22■■■■■ 4.03
KRBA1-204ENST00000486744 IGF1RP08069 1367 aa40.13■■■■■ 4.02
KRBA1-204ENST00000486744 GRIN2AQ12879 1464 aa40.1■■■■■ 4.01
KRBA1-204ENST00000486744 CUL7Q14999 1698 aa40.08■■■■■ 4.01
KRBA1-204ENST00000486744 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.04■■■■■ 4
KRBA1-204ENST00000486744 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.95■■■■□ 3.99
KRBA1-204ENST00000486744 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
KRBA1-204ENST00000486744 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.91■■■■□ 3.98
KRBA1-204ENST00000486744 NUP160Q12769 1436 aa39.88■■■■□ 3.97
KRBA1-204ENST00000486744 CEP170Q5SW79 1584 aa39.83■■■■□ 3.97
KRBA1-204ENST00000486744 EEA1Q15075 1411 aa39.82■■■■□ 3.96
KRBA1-204ENST00000486744 ARHGEF11O15085 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
KRBA1-204ENST00000486744 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.74■■■■□ 3.95
KRBA1-204ENST00000486744 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.72■■■■□ 3.95
KRBA1-204ENST00000486744 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.72■■■■□ 3.95
KRBA1-204ENST00000486744 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.72■■■■□ 3.95
KRBA1-204ENST00000486744 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.7■■■■□ 3.95
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