RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486662.1

IWS1-209, Transcript of IWS1, SUPT6H interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IWS1, Length 870 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IWS1-209ENST00000486662 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.08■■■■■ 5.77
IWS1-209ENST00000486662 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.34■■■■■ 4.85
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IWS1-209ENST00000486662 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
IWS1-209ENST00000486662 NACADO15069 1562 aa42.55■■■■■ 4.4
IWS1-209ENST00000486662 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.54■■■■■ 4.4
IWS1-209ENST00000486662 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.53■■■■■ 4.4
IWS1-209ENST00000486662 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.39■■■■■ 4.38
IWS1-209ENST00000486662 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.3■■■■■ 4.36
IWS1-209ENST00000486662 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.55■■■■■ 4.24
IWS1-209ENST00000486662 SCRIBQ14160 1630 aa41.34■■■■■ 4.21
IWS1-209ENST00000486662 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.2■■■■■ 4.19
IWS1-209ENST00000486662 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
IWS1-209ENST00000486662 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.91■■■■■ 4.14
IWS1-209ENST00000486662 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.85■■■■■ 4.13
IWS1-209ENST00000486662 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
IWS1-209ENST00000486662 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.87■■■■□ 3.97
IWS1-209ENST00000486662 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
IWS1-209ENST00000486662 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
IWS1-209ENST00000486662 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
IWS1-209ENST00000486662 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.35■■■■□ 3.89
IWS1-209ENST00000486662 SMARCA2P51531 1590 aa39.29■■■■□ 3.88
IWS1-209ENST00000486662 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.28■■■■□ 3.88
IWS1-209ENST00000486662 NCAPD3P42695 1498 aa39.24■■■■□ 3.87
IWS1-209ENST00000486662 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.2■■■■□ 3.87
IWS1-209ENST00000486662 HMGXB3Q12766 1538 aa39.09■■■■□ 3.85
IWS1-209ENST00000486662 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
IWS1-209ENST00000486662 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
IWS1-209ENST00000486662 WIZO95785 1651 aa38.95■■■■□ 3.83
IWS1-209ENST00000486662 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
IWS1-209ENST00000486662 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.33■■■■□ 3.73
IWS1-209ENST00000486662 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
IWS1-209ENST00000486662 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.19■■■■□ 3.7
IWS1-209ENST00000486662 NESP48681 1621 aa38.18■■■■□ 3.7
IWS1-209ENST00000486662 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.1■■■■□ 3.69
IWS1-209ENST00000486662 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.09■■■■□ 3.69
IWS1-209ENST00000486662 ERCC6Q03468 1493 aa37.97■■■■□ 3.67
IWS1-209ENST00000486662 CFTRP13569 1480 aa37.94■■■■□ 3.66
IWS1-209ENST00000486662 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.91■■■■□ 3.66
IWS1-209ENST00000486662 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.77■■■■□ 3.64
IWS1-209ENST00000486662 PRDM2Q13029 1718 aa37.72■■■■□ 3.63
IWS1-209ENST00000486662 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.67■■■■□ 3.62
IWS1-209ENST00000486662 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.61■■■■□ 3.61
IWS1-209ENST00000486662 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
IWS1-209ENST00000486662 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.5■■■■□ 3.59
IWS1-209ENST00000486662 CUX2O14529 1486 aa37.49■■■■□ 3.59
IWS1-209ENST00000486662 WDR62O43379 1518 aa37.36■■■■□ 3.57
IWS1-209ENST00000486662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
IWS1-209ENST00000486662 ABCC8Q09428 1581 aa37.15■■■■□ 3.54
IWS1-209ENST00000486662 TOPBP1Q92547 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
IWS1-209ENST00000486662 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.09■■■■□ 3.53
IWS1-209ENST00000486662 CUX1P39880 1505 aa36.9■■■■□ 3.5
IWS1-209ENST00000486662 IFT140Q96RY7 1462 aa36.82■■■■□ 3.48
IWS1-209ENST00000486662 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
IWS1-209ENST00000486662 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
IWS1-209ENST00000486662 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
IWS1-209ENST00000486662 TOP2BQ02880 1626 aa36.69■■■■□ 3.46
IWS1-209ENST00000486662 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.69■■■■□ 3.46
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IWS1-209ENST00000486662 SYNJ1O43426 1573 aa36.66■■■■□ 3.46
IWS1-209ENST00000486662 SOGA1O94964 1423 aa36.66■■■■□ 3.46
IWS1-209ENST00000486662 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.62■■■■□ 3.45
IWS1-209ENST00000486662 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
IWS1-209ENST00000486662 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
IWS1-209ENST00000486662 WDR97A6NE52 1622 aa36.45■■■■□ 3.43
IWS1-209ENST00000486662 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.423e-6■■■■□ 24.7
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IWS1-209ENST00000486662 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
IWS1-209ENST00000486662 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.25■■■■□ 3.39
IWS1-209ENST00000486662 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
IWS1-209ENST00000486662 GRIN2BQ13224 1484 aa36.21■■■■□ 3.39
IWS1-209ENST00000486662 TRIM41Q8WV44 630 aa36.21■■■■□ 3.39
IWS1-209ENST00000486662 PBRM1Q86U86 1689 aa36.16■■■■□ 3.38
IWS1-209ENST00000486662 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.11■■■■□ 3.37
IWS1-209ENST00000486662 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
IWS1-209ENST00000486662 KIF27Q86VH2 1401 aa36■■■■□ 3.35
IWS1-209ENST00000486662 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36■■■■□ 3.35
IWS1-209ENST00000486662 CHD1O14646 1710 aa35.98■■■■□ 3.35
IWS1-209ENST00000486662 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.98■■■■□ 3.35
IWS1-209ENST00000486662 OSCARQ8IYS5 282 aa35.97■■■■□ 3.35
IWS1-209ENST00000486662 SYNJ2O15056 1496 aa35.94■■■■□ 3.34
IWS1-209ENST00000486662 FBLN2P98095 1184 aa35.94■■■■□ 3.34
IWS1-209ENST00000486662 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
IWS1-209ENST00000486662 ADAMTS12P58397 1594 aa35.88■■■■□ 3.33
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IWS1-209ENST00000486662 IGF1RP08069 1367 aa35.79■■■■□ 3.32
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IWS1-209ENST00000486662 NUP160Q12769 1436 aa35.56■■■■□ 3.28
IWS1-209ENST00000486662 CEP170Q5SW79 1584 aa35.54■■■■□ 3.28
IWS1-209ENST00000486662 EEA1Q15075 1411 aa35.51■■■■□ 3.28
IWS1-209ENST00000486662 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.43■■■■□ 3.26
IWS1-209ENST00000486662 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.4■■■■□ 3.26
IWS1-209ENST00000486662 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
IWS1-209ENST00000486662 PRXQ9BXM0 1461 aa35.36■■■■□ 3.25
IWS1-209ENST00000486662 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.36■■■■□ 3.25
IWS1-209ENST00000486662 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.36■■■■□ 3.25
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