RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486313.1

AKAP9-210, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP9, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-210ENST00000486313 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.71■■■□□ 2.99
AKAP9-210ENST00000486313 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
AKAP9-210ENST00000486313 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.97■■■□□ 2.39
AKAP9-210ENST00000486313 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.68■■■□□ 2.34
AKAP9-210ENST00000486313 ABCC9O60706 1549 aa28.48■■■□□ 2.15
AKAP9-210ENST00000486313 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
AKAP9-210ENST00000486313 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.92■■■□□ 2.06
AKAP9-210ENST00000486313 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.82■■■□□ 2.04
AKAP9-210ENST00000486313 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.82■■■□□ 2.04
AKAP9-210ENST00000486313 NACADO15069 1562 aa27.76■■■□□ 2.03
AKAP9-210ENST00000486313 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.63■■■□□ 2.01
AKAP9-210ENST00000486313 SCRIBQ14160 1630 aa27.12■■□□□ 1.93
AKAP9-210ENST00000486313 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.1■■□□□ 1.93
AKAP9-210ENST00000486313 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
AKAP9-210ENST00000486313 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.88■■□□□ 1.89
AKAP9-210ENST00000486313 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
AKAP9-210ENST00000486313 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
AKAP9-210ENST00000486313 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
AKAP9-210ENST00000486313 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.23■■□□□ 1.79
AKAP9-210ENST00000486313 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
AKAP9-210ENST00000486313 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
AKAP9-210ENST00000486313 SMARCA4P51532 1647 aa26.02■■□□□ 1.76
AKAP9-210ENST00000486313 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.01■■□□□ 1.75
AKAP9-210ENST00000486313 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
AKAP9-210ENST00000486313 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.8■■□□□ 1.72
AKAP9-210ENST00000486313 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.78■■□□□ 1.72
AKAP9-210ENST00000486313 WIZO95785 1651 aa25.75■■□□□ 1.71
AKAP9-210ENST00000486313 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.74■■□□□ 1.71
AKAP9-210ENST00000486313 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.7■■□□□ 1.7
AKAP9-210ENST00000486313 SMARCA2P51531 1590 aa25.69■■□□□ 1.7
AKAP9-210ENST00000486313 NCAPD3P42695 1498 aa25.64■■□□□ 1.69
AKAP9-210ENST00000486313 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
AKAP9-210ENST00000486313 HMGXB3Q12766 1538 aa25.54■■□□□ 1.68
AKAP9-210ENST00000486313 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
AKAP9-210ENST00000486313 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AKAP9-210ENST00000486313 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.21■■□□□ 1.63
AKAP9-210ENST00000486313 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.91■■□□□ 1.58
AKAP9-210ENST00000486313 CFTRP13569 1480 aa24.89■■□□□ 1.58
AKAP9-210ENST00000486313 NESP48681 1621 aa24.86■■□□□ 1.57
AKAP9-210ENST00000486313 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.83■■□□□ 1.57
AKAP9-210ENST00000486313 PRDM2Q13029 1718 aa24.74■■□□□ 1.55
AKAP9-210ENST00000486313 FOXD1Q16676 465 aa24.7■■□□□ 1.54
AKAP9-210ENST00000486313 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
AKAP9-210ENST00000486313 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.6■■□□□ 1.53
AKAP9-210ENST00000486313 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.56■■□□□ 1.52
AKAP9-210ENST00000486313 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
AKAP9-210ENST00000486313 ABCC8Q09428 1581 aa24.45■■□□□ 1.5
AKAP9-210ENST00000486313 ERCC6Q03468 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
AKAP9-210ENST00000486313 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.49
AKAP9-210ENST00000486313 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
AKAP9-210ENST00000486313 CUX1P39880 1505 aa24.35■■□□□ 1.49
AKAP9-210ENST00000486313 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.35■■□□□ 1.49
AKAP9-210ENST00000486313 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AKAP9-210ENST00000486313 SYNJ1O43426 1573 aa24.32■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.3■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 TOPBP1Q92547 1522 aa24.3■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.28■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 TOP2BQ02880 1626 aa24.28■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 WDR62O43379 1518 aa24.27■■□□□ 1.48
AKAP9-210ENST00000486313 TRIM41Q8WV44 630 aa24.16■■□□□ 1.46
AKAP9-210ENST00000486313 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.14■■□□□ 1.46
AKAP9-210ENST00000486313 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
AKAP9-210ENST00000486313 CUX2O14529 1486 aa24.09■■□□□ 1.45
AKAP9-210ENST00000486313 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.09■■□□□ 1.45
AKAP9-210ENST00000486313 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.03■■□□□ 1.44
AKAP9-210ENST00000486313 SOGA1O94964 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
AKAP9-210ENST00000486313 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AKAP9-210ENST00000486313 IFT140Q96RY7 1462 aa23.97■■□□□ 1.43
AKAP9-210ENST00000486313 WDR97A6NE52 1622 aa23.96■■□□□ 1.43
AKAP9-210ENST00000486313 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.95■■□□□ 1.43
AKAP9-210ENST00000486313 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
AKAP9-210ENST00000486313 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.85■■□□□ 1.41
AKAP9-210ENST00000486313 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
AKAP9-210ENST00000486313 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.81■■□□□ 1.4
AKAP9-210ENST00000486313 KIF27Q86VH2 1401 aa23.79■■□□□ 1.4
AKAP9-210ENST00000486313 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
AKAP9-210ENST00000486313 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
AKAP9-210ENST00000486313 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AKAP9-210ENST00000486313 EEA1Q15075 1411 aa23.72■■□□□ 1.39
AKAP9-210ENST00000486313 IGF1RP08069 1367 aa23.69■■□□□ 1.38
AKAP9-210ENST00000486313 PBRM1Q86U86 1689 aa23.67■■□□□ 1.38
AKAP9-210ENST00000486313 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.66■■□□□ 1.38
AKAP9-210ENST00000486313 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
AKAP9-210ENST00000486313 GRIN2BQ13224 1484 aa23.66■■□□□ 1.38
AKAP9-210ENST00000486313 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.64■■□□□ 1.37
AKAP9-210ENST00000486313 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.56■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 PRXQ9BXM0 1461 aa23.56■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 CUL7Q14999 1698 aa23.54■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.52■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
AKAP9-210ENST00000486313 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.5■■□□□ 1.35
AKAP9-210ENST00000486313 KIF21BO75037 1637 aa23.48■■□□□ 1.35
AKAP9-210ENST00000486313 SYNJ2O15056 1496 aa23.44■■□□□ 1.34
AKAP9-210ENST00000486313 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
AKAP9-210ENST00000486313 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.44■■□□□ 1.34
AKAP9-210ENST00000486313 ADRA2BP18089 450 aa23.41■■□□□ 1.34
AKAP9-210ENST00000486313 GRIN2AQ12879 1464 aa23.36■■□□□ 1.33
AKAP9-210ENST00000486313 CHD1O14646 1710 aa23.36■■□□□ 1.33
AKAP9-210ENST00000486313 GOLGA3Q08378 1498 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms