RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.83■■■■□ 3.81
THBS3-207ENST00000486260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.17■■■■□ 3.06
THBS3-207ENST00000486260 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.86
THBS3-207ENST00000486260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
THBS3-207ENST00000486260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.3■■■□□ 2.76
THBS3-207ENST00000486260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.1■■■□□ 2.73
THBS3-207ENST00000486260 NACADO15069 1562 aa31.98■■■□□ 2.71
THBS3-207ENST00000486260 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.97■■■□□ 2.71
THBS3-207ENST00000486260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.86■■■□□ 2.69
THBS3-207ENST00000486260 SCRIBQ14160 1630 aa31.32■■■□□ 2.61
THBS3-207ENST00000486260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.21■■■□□ 2.59
THBS3-207ENST00000486260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.19■■■□□ 2.58
THBS3-207ENST00000486260 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.91■■■□□ 2.54
THBS3-207ENST00000486260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
THBS3-207ENST00000486260 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.23■■■□□ 2.43
THBS3-207ENST00000486260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
THBS3-207ENST00000486260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
THBS3-207ENST00000486260 SMARCA4P51532 1647 aa29.99■■■□□ 2.39
THBS3-207ENST00000486260 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.98■■■□□ 2.39
THBS3-207ENST00000486260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
THBS3-207ENST00000486260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.75■■■□□ 2.35
THBS3-207ENST00000486260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
THBS3-207ENST00000486260 WIZO95785 1651 aa29.7■■■□□ 2.34
THBS3-207ENST00000486260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.66■■■□□ 2.34
THBS3-207ENST00000486260 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.64■■■□□ 2.34
THBS3-207ENST00000486260 SMARCA2P51531 1590 aa29.63■■■□□ 2.33
THBS3-207ENST00000486260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.62■■■□□ 2.33
THBS3-207ENST00000486260 NCAPD3P42695 1498 aa29.52■■■□□ 2.32
THBS3-207ENST00000486260 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
THBS3-207ENST00000486260 HMGXB3Q12766 1538 aa29.42■■■□□ 2.3
THBS3-207ENST00000486260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
THBS3-207ENST00000486260 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.06■■■□□ 2.24
THBS3-207ENST00000486260 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.72■■■□□ 2.19
THBS3-207ENST00000486260 CFTRP13569 1480 aa28.68■■■□□ 2.18
THBS3-207ENST00000486260 NESP48681 1621 aa28.68■■■□□ 2.18
THBS3-207ENST00000486260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.63■■■□□ 2.17
THBS3-207ENST00000486260 PRDM2Q13029 1718 aa28.48■■■□□ 2.15
THBS3-207ENST00000486260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.43■■■□□ 2.14
THBS3-207ENST00000486260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.39■■■□□ 2.14
THBS3-207ENST00000486260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.32■■■□□ 2.12
THBS3-207ENST00000486260 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
THBS3-207ENST00000486260 ERCC6Q03468 1493 aa28.27■■■□□ 2.12
THBS3-207ENST00000486260 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
THBS3-207ENST00000486260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.09
THBS3-207ENST00000486260 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.1■■■□□ 2.09
THBS3-207ENST00000486260 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.09■■■□□ 2.09
THBS3-207ENST00000486260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
THBS3-207ENST00000486260 CUX1P39880 1505 aa28.08■■■□□ 2.09
THBS3-207ENST00000486260 SYNJ1O43426 1573 aa28.05■■■□□ 2.08
THBS3-207ENST00000486260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
THBS3-207ENST00000486260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.02■■■□□ 2.08
THBS3-207ENST00000486260 TOPBP1Q92547 1522 aa28.02■■■□□ 2.08
THBS3-207ENST00000486260 TRIM41Q8WV44 630 aa27.99■■■□□ 2.07
THBS3-207ENST00000486260 TOP2BQ02880 1626 aa27.98■■■□□ 2.07
THBS3-207ENST00000486260 WDR62O43379 1518 aa27.97■■■□□ 2.07
THBS3-207ENST00000486260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.96■■■□□ 2.07
THBS3-207ENST00000486260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.87■■■□□ 2.05
THBS3-207ENST00000486260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
THBS3-207ENST00000486260 CUX2O14529 1486 aa27.74■■■□□ 2.03
THBS3-207ENST00000486260 SOGA1O94964 1423 aa27.74■■■□□ 2.03
THBS3-207ENST00000486260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.74■■■□□ 2.03
THBS3-207ENST00000486260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
THBS3-207ENST00000486260 IFT140Q96RY7 1462 aa27.65■■■□□ 2.02
THBS3-207ENST00000486260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.61■■■□□ 2.01
THBS3-207ENST00000486260 WDR97A6NE52 1622 aa27.57■■■□□ 2
THBS3-207ENST00000486260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
THBS3-207ENST00000486260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
THBS3-207ENST00000486260 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.52■■■□□ 2
THBS3-207ENST00000486260 KIF27Q86VH2 1401 aa27.49■■□□□ 1.99
THBS3-207ENST00000486260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
THBS3-207ENST00000486260 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
THBS3-207ENST00000486260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.43■■□□□ 1.98
THBS3-207ENST00000486260 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.43■■□□□ 1.98
THBS3-207ENST00000486260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
THBS3-207ENST00000486260 EEA1Q15075 1411 aa27.38■■□□□ 1.97
THBS3-207ENST00000486260 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.32■■□□□ 1.96
THBS3-207ENST00000486260 IGF1RP08069 1367 aa27.32■■□□□ 1.96
THBS3-207ENST00000486260 GRIN2BQ13224 1484 aa27.31■■□□□ 1.96
THBS3-207ENST00000486260 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
THBS3-207ENST00000486260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.27■■□□□ 1.96
THBS3-207ENST00000486260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.2■■□□□ 1.95
THBS3-207ENST00000486260 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.17■■□□□ 1.94
THBS3-207ENST00000486260 CUL7Q14999 1698 aa27.15■■□□□ 1.94
THBS3-207ENST00000486260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
THBS3-207ENST00000486260 PRXQ9BXM0 1461 aa27.13■■□□□ 1.93
THBS3-207ENST00000486260 ADAMTS12P58397 1594 aa27.12■■□□□ 1.93
THBS3-207ENST00000486260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.11■■□□□ 1.93
THBS3-207ENST00000486260 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.09■■□□□ 1.93
THBS3-207ENST00000486260 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
THBS3-207ENST00000486260 KIF21BO75037 1637 aa27.06■■□□□ 1.92
THBS3-207ENST00000486260 SYNJ2O15056 1496 aa27.04■■□□□ 1.92
THBS3-207ENST00000486260 FBLN2P98095 1184 aa27.04■■□□□ 1.92
THBS3-207ENST00000486260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
THBS3-207ENST00000486260 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.01■■□□□ 1.91
THBS3-207ENST00000486260 GOLGA3Q08378 1498 aa26.97■■□□□ 1.91
THBS3-207ENST00000486260 GRIN2AQ12879 1464 aa26.97■■□□□ 1.91
THBS3-207ENST00000486260 CHD1O14646 1710 aa26.94■■□□□ 1.9
THBS3-207ENST00000486260 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
THBS3-207ENST00000486260 CEP170Q5SW79 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
THBS3-207ENST00000486260 NUP160Q12769 1436 aa26.8■■□□□ 1.88
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