RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 NISCHQ9Y2I1 1504 aa79.37■■■■■ 10.3
CHKB-210ENST00000484266 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa70.43■■■■■ 8.86
CHKB-210ENST00000484266 ABCC9O60706 1549 aa68.47■■■■■ 8.55
CHKB-210ENST00000484266 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP66.22■■■■■ 8.19
CHKB-210ENST00000484266 NACADO15069 1562 aa66.07■■■■■ 8.17
CHKB-210ENST00000484266 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa66.05■■■■■ 8.16
CHKB-210ENST00000484266 DCAF8L2P0C7V8 631 aa66.05■■■■■ 8.16
CHKB-210ENST00000484266 MYO15BQ96JP2 1530 aa65.81■■■■■ 8.13
CHKB-210ENST00000484266 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa65.69■■■■■ 8.11
CHKB-210ENST00000484266 UNC13AQ9UPW8 1703 aa64.67■■■■■ 7.94
CHKB-210ENST00000484266 SCRIBQ14160 1630 aa64.28■■■■■ 7.88
CHKB-210ENST00000484266 BICRAQ9NZM4 1560 aa64.09■■■■■ 7.85
CHKB-210ENST00000484266 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP64.02■■■■■ 7.849e-7■□□□□ 10.2
CHKB-210ENST00000484266 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa63.39■■■■■ 7.74
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC5BQ9UF47 199 aa62.48■■■■■ 7.59
CHKB-210ENST00000484266 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP62.34■■■■■ 7.57
CHKB-210ENST00000484266 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa61.99■■■■■ 7.51
CHKB-210ENST00000484266 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.8■■■■■ 7.48
CHKB-210ENST00000484266 SMARCA4P51532 1647 aa61.53■■■■■ 7.44
CHKB-210ENST00000484266 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP61.49■■■■■ 7.43
CHKB-210ENST00000484266 MROH2BQ7Z745 1585 aa61.2■■■■■ 7.39
CHKB-210ENST00000484266 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa61.05■■■■■ 7.36
CHKB-210ENST00000484266 SMARCA2P51531 1590 aa61■■■■■ 7.36
CHKB-210ENST00000484266 NCAPD3P42695 1498 aa60.95■■■■■ 7.35
CHKB-210ENST00000484266 PEG3Q9GZU2 1588 aa60.92■■■■■ 7.34
CHKB-210ENST00000484266 HMGXB3Q12766 1538 aa60.72■■■■■ 7.31
CHKB-210ENST00000484266 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP60.62■■■■■ 7.29
CHKB-210ENST00000484266 WIZO95785 1651 aa60.59■■■■■ 7.29
CHKB-210ENST00000484266 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP60.57■■■■■ 7.29
CHKB-210ENST00000484266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP59.93■■■■■ 7.19
CHKB-210ENST00000484266 NESP48681 1621 aa59.4■■■■■ 7.1
CHKB-210ENST00000484266 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP59.32■■■■■ 7.09
CHKB-210ENST00000484266 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa59.3■■■■■ 7.08
CHKB-210ENST00000484266 CCDC88BA6NC98 1476 aa59.21■■■■■ 7.07
CHKB-210ENST00000484266 CADPSQ9ULU8 1353 aa59.18■■■■■ 7.06
CHKB-210ENST00000484266 ERCC6Q03468 1493 aa58.95■■■■■ 7.03
CHKB-210ENST00000484266 CFTRP13569 1480 aa58.94■■■■■ 7.03
CHKB-210ENST00000484266 PDS5BQ9NTI5 1447 aa58.83■■■■■ 7.01
CHKB-210ENST00000484266 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa58.76■■■■■ 7
CHKB-210ENST00000484266 PRDM2Q13029 1718 aa58.63■■■■■ 6.98
CHKB-210ENST00000484266 FANCD2Q9BXW9 1451 aa58.52■■■■■ 6.96
CHKB-210ENST00000484266 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP58.44■■■■■ 6.95
CHKB-210ENST00000484266 CEP164Q9UPV0 1460 aa58.41■■■■■ 6.94
CHKB-210ENST00000484266 MRC2Q9UBG0 1479 aa58.25■■■■■ 6.91
CHKB-210ENST00000484266 CUX2O14529 1486 aa58.2■■■■■ 6.91
CHKB-210ENST00000484266 WDR62O43379 1518 aa58.07■■■■■ 6.89
CHKB-210ENST00000484266 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP57.94■■■■■ 6.87
CHKB-210ENST00000484266 TOPBP1Q92547 1522 aa57.65■■■■■ 6.82
CHKB-210ENST00000484266 ABCC8Q09428 1581 aa57.63■■■■■ 6.82
CHKB-210ENST00000484266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa57.63■■■■■ 6.82
CHKB-210ENST00000484266 CUX1P39880 1505 aa57.38■■■■■ 6.78
CHKB-210ENST00000484266 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP57.19■■■■■ 6.75
CHKB-210ENST00000484266 IFT140Q96RY7 1462 aa57.16■■■■■ 6.74
CHKB-210ENST00000484266 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP57.13■■■■■ 6.74
CHKB-210ENST00000484266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa57.11■■■■■ 6.73
CHKB-210ENST00000484266 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP57.03■■■■■ 6.72
CHKB-210ENST00000484266 SYNJ1O43426 1573 aa57.03■■■■■ 6.72
CHKB-210ENST00000484266 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa57.01■■■■■ 6.72
CHKB-210ENST00000484266 TOP2BQ02880 1626 aa57■■■■■ 6.72
CHKB-210ENST00000484266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa56.93■■■■■ 6.7
CHKB-210ENST00000484266 SOGA1O94964 1423 aa56.92■■■■■ 6.7
CHKB-210ENST00000484266 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.9■■■■■ 6.7
CHKB-210ENST00000484266 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP56.72■■■■■ 6.67
CHKB-210ENST00000484266 WDR97A6NE52 1622 aa56.69■■■■■ 6.67
CHKB-210ENST00000484266 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP56.61■■■■■ 6.653e-8■■■■■ 28.1
CHKB-210ENST00000484266 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa56.58■■■■■ 6.65
CHKB-210ENST00000484266 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP56.56■■■■■ 6.64
CHKB-210ENST00000484266 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa56.35■■■■■ 6.61
CHKB-210ENST00000484266 GAPVD1Q14C86 1478 aa56.29■■■■■ 6.6
CHKB-210ENST00000484266 PBRM1Q86U86 1689 aa56.22■■■■■ 6.59
CHKB-210ENST00000484266 GRIN2BQ13224 1484 aa56.22■■■■■ 6.59
CHKB-210ENST00000484266 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa56.11■■■■■ 6.57
CHKB-210ENST00000484266 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP56.04■■■■■ 6.56
CHKB-210ENST00000484266 TRIM41Q8WV44 630 aa56■■■■■ 6.56
CHKB-210ENST00000484266 CHD1O14646 1710 aa55.96■■■■■ 6.55
CHKB-210ENST00000484266 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.9■■■■■ 6.54
CHKB-210ENST00000484266 ERICH3Q5RHP9 1530 aa55.9■■■■■ 6.54
CHKB-210ENST00000484266 KIF27Q86VH2 1401 aa55.89■■■■■ 6.54
CHKB-210ENST00000484266 SYNJ2O15056 1496 aa55.82■■■■■ 6.53
CHKB-210ENST00000484266 OSCARQ8IYS5 282 aa55.81■■■■■ 6.53
CHKB-210ENST00000484266 FBLN2P98095 1184 aa55.79■■■■■ 6.52
CHKB-210ENST00000484266 ADAMTS12P58397 1594 aa55.78■■■■■ 6.52
CHKB-210ENST00000484266 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP55.71■■■■■ 6.51
CHKB-210ENST00000484266 FHAD1B1AJZ9 1412 aa55.64■■■■■ 6.5
CHKB-210ENST00000484266 CHIC1Q5VXU3 224 aa55.63■■■■■ 6.5
CHKB-210ENST00000484266 IGF1RP08069 1367 aa55.61■■■■■ 6.49
CHKB-210ENST00000484266 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa55.56■■■■■ 6.48
CHKB-210ENST00000484266 GRIN2AQ12879 1464 aa55.52■■■■■ 6.48
CHKB-210ENST00000484266 CUL7Q14999 1698 aa55.5■■■■■ 6.48
CHKB-210ENST00000484266 CLASP1Q7Z460 1538 aa55.33■■■■■ 6.45
CHKB-210ENST00000484266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa55.29■■■■■ 6.44
CHKB-210ENST00000484266 CEP170Q5SW79 1584 aa55.26■■■■■ 6.44
CHKB-210ENST00000484266 NUP160Q12769 1436 aa55.26■■■■■ 6.44
CHKB-210ENST00000484266 EEA1Q15075 1411 aa55.08■■■■■ 6.41
CHKB-210ENST00000484266 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa55.02■■■■■ 6.4
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF11O15085 1522 aa54.99■■■■■ 6.39
CHKB-210ENST00000484266 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa54.98■■■■■ 6.39
CHKB-210ENST00000484266 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa54.98■■■■■ 6.39
CHKB-210ENST00000484266 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa54.98■■■■■ 6.39
CHKB-210ENST00000484266 PRXQ9BXM0 1461 aa54.95■■■■■ 6.39
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