RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482466.5

LRRFIP2-215, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 2, human

TSL 4

Gene LRRFIP2, Length 462 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRFIP2-215	ENST00000482466	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.41	■■■■■ 6.78
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.02	■■■■■ 5.76
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ABCC9	O60706	1549 aa		50.31	■■■■■ 5.65
LRRFIP2-215	ENST00000482466	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.48	■■■■■ 5.35
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.26	■■■■■ 5.32
LRRFIP2-215	ENST00000482466	NACAD	O15069	1562 aa		48.12	■■■■■ 5.29
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.73	■■■■■ 5.23
LRRFIP2-215	ENST00000482466	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.67	■■■■■ 5.22
LRRFIP2-215	ENST00000482466	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.41	■■■■■ 5.18
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.09	■■■■■ 5.13
LRRFIP2-215	ENST00000482466	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.98	■■■■■ 5.11
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.68	■■■■■ 5.06
LRRFIP2-215	ENST00000482466	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.64	■■■■■ 5.06
LRRFIP2-215	ENST00000482466	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.31	■■■■■ 5
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.19	■■■■■ 4.98
LRRFIP2-215	ENST00000482466	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.53	■■■■■ 4.88
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.41	■■■■■ 4.86
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.22	■■■■■ 4.83
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.56	■■■■■ 4.72
LRRFIP2-215	ENST00000482466	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.54	■■■■■ 4.72
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.41	■■■■■ 4.7
LRRFIP2-215	ENST00000482466	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.4	■■■■■ 4.7
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.37	■■■■■ 4.69
LRRFIP2-215	ENST00000482466	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.24	■■■■■ 4.67
LRRFIP2-215	ENST00000482466	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.11	■■■■■ 4.65
LRRFIP2-215	ENST00000482466	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.11	■■■■■ 4.65
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.05	■■■■■ 4.64
LRRFIP2-215	ENST00000482466	WIZ	O95785	1651 aa		43.76	■■■■■ 4.6
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.71	■■■■■ 4.59
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.47	■■■■■ 4.55
LRRFIP2-215	ENST00000482466	NES	P48681	1621 aa		43.42	■■■■■ 4.54
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
LRRFIP2-215	ENST00000482466	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.26	■■■■■ 4.52
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.18	■■■■■ 4.5
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.1	■■■■■ 4.49
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CUX2	O14529	1486 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.83	■■■■■ 4.45
LRRFIP2-215	ENST00000482466	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.82	■■■■■ 4.45
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CFTR	P13569	1480 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
LRRFIP2-215	ENST00000482466	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
LRRFIP2-215	ENST00000482466	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LRRFIP2-215	ENST00000482466	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LRRFIP2-215	ENST00000482466	WDR62	O43379	1518 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.35	■■■■■ 4.37
LRRFIP2-215	ENST00000482466	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.98	■■■■■ 4.31
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LRRFIP2-215	ENST00000482466	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LRRFIP2-215	ENST00000482466	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.84	■■■■■ 4.29
LRRFIP2-215	ENST00000482466	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.75	■■■■■ 4.27
LRRFIP2-215	ENST00000482466	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.55	■■■■■ 4.24
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.54	■■■■■ 4.24
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CUX1	P39880	1505 aa		41.5	■■■■■ 4.23
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SOGA1	O94964	1423 aa		41.5	■■■■■ 4.23
LRRFIP2-215	ENST00000482466	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.46	■■■■■ 4.23
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.43	■■■■■ 4.22
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
LRRFIP2-215	ENST00000482466	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.36	■■■■■ 4.21	4e-8	■■■■■ 34.1
LRRFIP2-215	ENST00000482466	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.32	■■■■■ 4.21
LRRFIP2-215	ENST00000482466	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.2
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.29	■■■■■ 4.2
LRRFIP2-215	ENST00000482466	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.28	■■■■■ 4.2	9e-6	■■■■■ 50.1
LRRFIP2-215	ENST00000482466	FBLN2	P98095	1184 aa		41.14	■■■■■ 4.18
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.1	■■■■■ 4.17
LRRFIP2-215	ENST00000482466	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.07	■■■■■ 4.17
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.07	■■■■■ 4.16
LRRFIP2-215	ENST00000482466	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.05	■■■■■ 4.16
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.01	■■■■■ 4.16
LRRFIP2-215	ENST00000482466	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.98	■■■■■ 4.15
LRRFIP2-215	ENST00000482466	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.97	■■■■■ 4.15
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.93	■■■■■ 4.14
LRRFIP2-215	ENST00000482466	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CHD1	O14646	1710 aa		40.82	■■■■■ 4.13
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.78	■■■■■ 4.12
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.78	■■■■■ 4.12
LRRFIP2-215	ENST00000482466	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.71	■■■■■ 4.11
LRRFIP2-215	ENST00000482466	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.65	■■■■■ 4.1
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.52	■■■■■ 4.08
LRRFIP2-215	ENST00000482466	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.49	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.48	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.45	■■■■■ 4.07
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.44	■■■■■ 4.06
LRRFIP2-215	ENST00000482466	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.41	■■■■■ 4.06
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.35	■■■■■ 4.05
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.31	■■■■■ 4.04
LRRFIP2-215	ENST00000482466	IGF1R	P08069	1367 aa		40.28	■■■■■ 4.04
LRRFIP2-215	ENST00000482466	NUP160	Q12769	1436 aa		40.19	■■■■■ 4.02
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.16	■■■■■ 4.02
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CUL7	Q14999	1698 aa		40.11	■■■■■ 4.01
LRRFIP2-215	ENST00000482466	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.1	■■■■■ 4.01
LRRFIP2-215	ENST00000482466	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.08	■■■■■ 4.01
LRRFIP2-215	ENST00000482466	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.98	■■■■□ 3.99
LRRFIP2-215	ENST00000482466	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.96	■■■■□ 3.99
LRRFIP2-215	ENST00000482466	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.86	■■■■□ 3.97

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