RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480099.1

PKDCC-206, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 787 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-206ENST00000480099 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.63■■■■□ 3.77
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.32■■■■□ 3.08
PKDCC-206ENST00000480099 ABCC9O60706 1549 aa33.1■■■□□ 2.89
PKDCC-206ENST00000480099 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
PKDCC-206ENST00000480099 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.16■■■□□ 2.74
PKDCC-206ENST00000480099 NACADO15069 1562 aa32.08■■■□□ 2.73
PKDCC-206ENST00000480099 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.07■■■□□ 2.72
PKDCC-206ENST00000480099 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.95■■■□□ 2.71
PKDCC-206ENST00000480099 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.93■■■□□ 2.7
PKDCC-206ENST00000480099 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.49■■■□□ 2.63
PKDCC-206ENST00000480099 SCRIBQ14160 1630 aa31.33■■■□□ 2.61
PKDCC-206ENST00000480099 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-206ENST00000480099 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
PKDCC-206ENST00000480099 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.78■■■□□ 2.52
PKDCC-206ENST00000480099 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
PKDCC-206ENST00000480099 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.01■■■□□ 2.4
PKDCC-206ENST00000480099 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.01■■■□□ 2.39
PKDCC-206ENST00000480099 SMARCA4P51532 1647 aa29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-206ENST00000480099 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-206ENST00000480099 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.86■■■□□ 2.37
PKDCC-206ENST00000480099 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
PKDCC-206ENST00000480099 SMARCA2P51531 1590 aa29.67■■■□□ 2.34
PKDCC-206ENST00000480099 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.61■■■□□ 2.33
PKDCC-206ENST00000480099 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.6■■■□□ 2.33
PKDCC-206ENST00000480099 WIZO95785 1651 aa29.58■■■□□ 2.33
PKDCC-206ENST00000480099 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PKDCC-206ENST00000480099 NCAPD3P42695 1498 aa29.49■■■□□ 2.31
PKDCC-206ENST00000480099 HMGXB3Q12766 1538 aa29.48■■■□□ 2.31
PKDCC-206ENST00000480099 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
PKDCC-206ENST00000480099 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PKDCC-206ENST00000480099 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.83■■■□□ 2.21
PKDCC-206ENST00000480099 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.79■■■□□ 2.2
PKDCC-206ENST00000480099 NESP48681 1621 aa28.74■■■□□ 2.19
PKDCC-206ENST00000480099 PRDM2Q13029 1718 aa28.72■■■□□ 2.19
PKDCC-206ENST00000480099 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.67■■■□□ 2.18
PKDCC-206ENST00000480099 CFTRP13569 1480 aa28.59■■■□□ 2.17
PKDCC-206ENST00000480099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.58■■■□□ 2.16
PKDCC-206ENST00000480099 ERCC6Q03468 1493 aa28.55■■■□□ 2.16
PKDCC-206ENST00000480099 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.52■■■□□ 2.16
PKDCC-206ENST00000480099 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.4■■■□□ 2.14
PKDCC-206ENST00000480099 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.38■■■□□ 2.13
PKDCC-206ENST00000480099 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PKDCC-206ENST00000480099 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.22■■■□□ 2.11
PKDCC-206ENST00000480099 WDR62O43379 1518 aa28.13■■■□□ 2.09
PKDCC-206ENST00000480099 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
PKDCC-206ENST00000480099 CUX2O14529 1486 aa28.05■■■□□ 2.08
PKDCC-206ENST00000480099 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.05■■■□□ 2.08
PKDCC-206ENST00000480099 ABCC8Q09428 1581 aa28.03■■■□□ 2.08
PKDCC-206ENST00000480099 TOPBP1Q92547 1522 aa28■■■□□ 2.07
PKDCC-206ENST00000480099 CUX1P39880 1505 aa27.92■■■□□ 2.06
PKDCC-206ENST00000480099 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
PKDCC-206ENST00000480099 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.88■■■□□ 2.05
PKDCC-206ENST00000480099 SYNJ1O43426 1573 aa27.85■■■□□ 2.05
PKDCC-206ENST00000480099 TOP2BQ02880 1626 aa27.84■■■□□ 2.05
PKDCC-206ENST00000480099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.79■■■□□ 2.04
PKDCC-206ENST00000480099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
PKDCC-206ENST00000480099 IFT140Q96RY7 1462 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-206ENST00000480099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PKDCC-206ENST00000480099 SOGA1O94964 1423 aa27.66■■■□□ 2.02
PKDCC-206ENST00000480099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.64■■■□□ 2.02
PKDCC-206ENST00000480099 WDR97A6NE52 1622 aa27.64■■■□□ 2.02
PKDCC-206ENST00000480099 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PKDCC-206ENST00000480099 TRIM41Q8WV44 630 aa27.5■■□□□ 1.99
PKDCC-206ENST00000480099 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.5■■□□□ 1.99
PKDCC-206ENST00000480099 PBRM1Q86U86 1689 aa27.47■■□□□ 1.99
PKDCC-206ENST00000480099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.46■■□□□ 1.99
PKDCC-206ENST00000480099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.44■■□□□ 1.98
PKDCC-206ENST00000480099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PKDCC-206ENST00000480099 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.43■■□□□ 1.98
PKDCC-206ENST00000480099 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.37■■□□□ 1.97
PKDCC-206ENST00000480099 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.34■■□□□ 1.97
PKDCC-206ENST00000480099 GRIN2BQ13224 1484 aa27.31■■□□□ 1.96
PKDCC-206ENST00000480099 KIF27Q86VH2 1401 aa27.28■■□□□ 1.96
PKDCC-206ENST00000480099 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.24■■□□□ 1.95
PKDCC-206ENST00000480099 CHD1O14646 1710 aa27.23■■□□□ 1.95
PKDCC-206ENST00000480099 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.22■■□□□ 1.95
PKDCC-206ENST00000480099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
PKDCC-206ENST00000480099 CUL7Q14999 1698 aa27.15■■□□□ 1.94
PKDCC-206ENST00000480099 ADAMTS12P58397 1594 aa27.15■■□□□ 1.94
PKDCC-206ENST00000480099 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.12■■□□□ 1.93
PKDCC-206ENST00000480099 SYNJ2O15056 1496 aa27.08■■□□□ 1.93
PKDCC-206ENST00000480099 FBLN2P98095 1184 aa27.08■■□□□ 1.93
PKDCC-206ENST00000480099 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.04■■□□□ 1.92
PKDCC-206ENST00000480099 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PKDCC-206ENST00000480099 EEA1Q15075 1411 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-206ENST00000480099 IGF1RP08069 1367 aa27.02■■□□□ 1.92
PKDCC-206ENST00000480099 GRIN2AQ12879 1464 aa26.97■■□□□ 1.91
PKDCC-206ENST00000480099 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PKDCC-206ENST00000480099 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.94■■□□□ 1.9
PKDCC-206ENST00000480099 OSCARQ8IYS5 282 aa26.91■■□□□ 1.9
PKDCC-206ENST00000480099 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.87■■□□□ 1.89
PKDCC-206ENST00000480099 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
PKDCC-206ENST00000480099 CEP170Q5SW79 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
PKDCC-206ENST00000480099 PRXQ9BXM0 1461 aa26.8■■□□□ 1.88
PKDCC-206ENST00000480099 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.79■■□□□ 1.88
PKDCC-206ENST00000480099 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.78■■□□□ 1.88
PKDCC-206ENST00000480099 KIF21BO75037 1637 aa26.78■■□□□ 1.88
PKDCC-206ENST00000480099 NUP160Q12769 1436 aa26.77■■□□□ 1.88
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