RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474324.1

HOXB-AS3-207, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 421 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ABCC9O60706 1549 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NACADO15069 1562 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-207ENST00000474324 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.51■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-207ENST00000474324 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SCRIBQ14160 1630 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CUX2O14529 1486 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ERCC6Q03468 1493 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NCAPD3P42695 1498 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NESP48681 1621 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TRIM41Q8WV44 630 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-207ENST00000474324 HMGXB3Q12766 1538 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-207ENST00000474324 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SMARCA2P51531 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SMARCA4P51532 1647 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-207ENST00000474324 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WDR62O43379 1518 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-207ENST00000474324 OSCARQ8IYS5 282 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WIZO95785 1651 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CFTRP13569 1480 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ARHGEF11O15085 1522 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-207ENST00000474324 IFT140Q96RY7 1462 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ARAP1Q96P48 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TOPBP1Q92547 1522 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-207ENST00000474324 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-207ENST00000474324 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-207ENST00000474324 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FBLN2P98095 1184 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CHD1O14646 1710 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ABCC8Q09428 1581 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-207ENST00000474324 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SOGA1O94964 1423 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SYNJ1O43426 1573 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SYNJ2O15056 1496 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GRIN2BQ13224 1484 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WDR97A6NE52 1622 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CUX1P39880 1505 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PBRM1Q86U86 1689 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GRIN2AQ12879 1464 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CEP170Q5SW79 1584 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NUP160Q12769 1436 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SHROOM2Q13796 1616 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ADAMTS12P58397 1594 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 JPH4Q96JJ6 628 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
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