RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.51■■■■□ 3.6
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RALGPS1-211ENST00000471643 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.59■■■□□ 2.65
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RALGPS1-211ENST00000471643 NESP48681 1621 aa29.6■■■□□ 2.33
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RALGPS1-211ENST00000471643 SMARCA4P51532 1647 aa29.39■■■□□ 2.3
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RALGPS1-211ENST00000471643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.12■■■□□ 2.25
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RALGPS1-211ENST00000471643 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.86■■■□□ 2.21
RALGPS1-211ENST00000471643 WDR62O43379 1518 aa28.84■■■□□ 2.21
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RALGPS1-211ENST00000471643 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.59■■■□□ 2.17
RALGPS1-211ENST00000471643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.53■■■□□ 2.16
RALGPS1-211ENST00000471643 WIZO95785 1651 aa28.51■■■□□ 2.15
RALGPS1-211ENST00000471643 CFTRP13569 1480 aa28.4■■■□□ 2.14
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RALGPS1-211ENST00000471643 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.35■■■□□ 2.13
RALGPS1-211ENST00000471643 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.35■■■□□ 2.13
RALGPS1-211ENST00000471643 ARHGEF11O15085 1522 aa28.2■■■□□ 2.1
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RALGPS1-211ENST00000471643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
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RALGPS1-211ENST00000471643 PRDM2Q13029 1718 aa27.93■■■□□ 2.06
RALGPS1-211ENST00000471643 TOPBP1Q92547 1522 aa27.92■■■□□ 2.06
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RALGPS1-211ENST00000471643 ABCC8Q09428 1581 aa27.75■■■□□ 2.03
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RALGPS1-211ENST00000471643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.73■■■□□ 2.03
RALGPS1-211ENST00000471643 FBLN2P98095 1184 aa27.69■■■□□ 2.02
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RALGPS1-211ENST00000471643 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.53■■■□□ 2
RALGPS1-211ENST00000471643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.53■■■□□ 2
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RALGPS1-211ENST00000471643 SOGA1O94964 1423 aa27.45■■□□□ 1.98
RALGPS1-211ENST00000471643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RALGPS1-211ENST00000471643 SYNJ1O43426 1573 aa27.36■■□□□ 1.97
RALGPS1-211ENST00000471643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.26■■□□□ 1.95
RALGPS1-211ENST00000471643 CUX1P39880 1505 aa27.2■■□□□ 1.94
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RALGPS1-211ENST00000471643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
RALGPS1-211ENST00000471643 GRIN2AQ12879 1464 aa26.93■■□□□ 1.9
RALGPS1-211ENST00000471643 CEP170Q5SW79 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
RALGPS1-211ENST00000471643 NUP160Q12769 1436 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-211ENST00000471643 SHROOM2Q13796 1616 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-211ENST00000471643 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.84■■□□□ 1.89
RALGPS1-211ENST00000471643 ADAMTS12P58397 1594 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-211ENST00000471643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-211ENST00000471643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
RALGPS1-211ENST00000471643 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-211ENST00000471643 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.64■■□□□ 1.86
RALGPS1-211ENST00000471643 JPH4Q96JJ6 628 aa26.61■■□□□ 1.85
RALGPS1-211ENST00000471643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.59■■□□□ 1.85
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