RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471274.1

PTPRD-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRD, Length 1,205 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-208ENST00000471274 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRD-208ENST00000471274 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRD-208ENST00000471274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRD-208ENST00000471274 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRD-208ENST00000471274 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRD-208ENST00000471274 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRD-208ENST00000471274 ABCC9O60706 1549 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRD-208ENST00000471274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
PTPRD-208ENST00000471274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRD-208ENST00000471274 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRD-208ENST00000471274 NACADO15069 1562 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRD-208ENST00000471274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRD-208ENST00000471274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRD-208ENST00000471274 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRD-208ENST00000471274 FOXD1Q16676 465 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRD-208ENST00000471274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19■□□□□ 0.63
PTPRD-208ENST00000471274 SCRIBQ14160 1630 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRD-208ENST00000471274 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRD-208ENST00000471274 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRD-208ENST00000471274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
PTPRD-208ENST00000471274 ADRA2BP18089 450 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-208ENST00000471274 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRD-208ENST00000471274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-208ENST00000471274 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRD-208ENST00000471274 SMARCA4P51532 1647 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRD-208ENST00000471274 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRD-208ENST00000471274 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRD-208ENST00000471274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-208ENST00000471274 SMARCA2P51531 1590 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-208ENST00000471274 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-208ENST00000471274 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRD-208ENST00000471274 HMGXB3Q12766 1538 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRD-208ENST00000471274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PTPRD-208ENST00000471274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18■□□□□ 0.47
PTPRD-208ENST00000471274 NCAPD3P42695 1498 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRD-208ENST00000471274 WIZO95785 1651 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRD-208ENST00000471274 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRD-208ENST00000471274 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-208ENST00000471274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRD-208ENST00000471274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-208ENST00000471274 MSH5O43196 834 aa17.62■□□□□ 0.41
PTPRD-208ENST00000471274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-208ENST00000471274 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRD-208ENST00000471274 PRDM2Q13029 1718 aa17.47■□□□□ 0.39
PTPRD-208ENST00000471274 CFTRP13569 1480 aa17.44■□□□□ 0.38
PTPRD-208ENST00000471274 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.43■□□□□ 0.38
PTPRD-208ENST00000471274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRD-208ENST00000471274 NESP48681 1621 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRD-208ENST00000471274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRD-208ENST00000471274 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRD-208ENST00000471274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRD-208ENST00000471274 ERCC6Q03468 1493 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRD-208ENST00000471274 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRD-208ENST00000471274 ABCC8Q09428 1581 aa17.14■□□□□ 0.33
PTPRD-208ENST00000471274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
PTPRD-208ENST00000471274 WDR62O43379 1518 aa17.1■□□□□ 0.33
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PTPRD-208ENST00000471274 CUX2O14529 1486 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRD-208ENST00000471274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRD-208ENST00000471274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 TOPBP1Q92547 1522 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 TOP2BQ02880 1626 aa17■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 CUX1P39880 1505 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRD-208ENST00000471274 SYNJ1O43426 1573 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRD-208ENST00000471274 WDR97A6NE52 1622 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRD-208ENST00000471274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRD-208ENST00000471274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRD-208ENST00000471274 IFT140Q96RY7 1462 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRD-208ENST00000471274 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRD-208ENST00000471274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRD-208ENST00000471274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRD-208ENST00000471274 SOGA1O94964 1423 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRD-208ENST00000471274 TRIM41Q8WV44 630 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRD-208ENST00000471274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRD-208ENST00000471274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRD-208ENST00000471274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRD-208ENST00000471274 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-208ENST00000471274 KIF27Q86VH2 1401 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-208ENST00000471274 PBRM1Q86U86 1689 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-208ENST00000471274 EEA1Q15075 1411 aa16.64■□□□□ 0.25
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PTPRD-208ENST00000471274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-208ENST00000471274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-208ENST00000471274 GRIN2BQ13224 1484 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-208ENST00000471274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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PTPRD-208ENST00000471274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-208ENST00000471274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
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PTPRD-208ENST00000471274 ADAMTS12P58397 1594 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-208ENST00000471274 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-208ENST00000471274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-208ENST00000471274 SYNJ2O15056 1496 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-208ENST00000471274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-208ENST00000471274 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRD-208ENST00000471274 IGF1RP08069 1367 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRD-208ENST00000471274 CHD1O14646 1710 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRD-208ENST00000471274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.42■□□□□ 0.22
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