RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469990.1

LMNTD2-203, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMNTD2, Length 1,232 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-203ENST00000469990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.74■■■■■ 7.95
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LMNTD2-203ENST00000469990 ABCC9O60706 1549 aa56.14■■■■■ 6.58
LMNTD2-203ENST00000469990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.18■■■■■ 6.26
LMNTD2-203ENST00000469990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.12■■■■■ 6.26
LMNTD2-203ENST00000469990 NACADO15069 1562 aa54.1■■■■■ 6.25
LMNTD2-203ENST00000469990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.9■■■■■ 6.22
LMNTD2-203ENST00000469990 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.84■■■■■ 6.21
LMNTD2-203ENST00000469990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.62■■■■■ 6.17
LMNTD2-203ENST00000469990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.67■■■■■ 6.02
LMNTD2-203ENST00000469990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.52■■■■■ 6
LMNTD2-203ENST00000469990 SCRIBQ14160 1630 aa52.39■■■■■ 5.98
LMNTD2-203ENST00000469990 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.33■■■■■ 5.97
LMNTD2-203ENST00000469990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52■■■■■ 5.92
LMNTD2-203ENST00000469990 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.4■■■■■ 5.82
LMNTD2-203ENST00000469990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.02■■■■■ 5.76
LMNTD2-203ENST00000469990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.76■■■■■ 5.72
LMNTD2-203ENST00000469990 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.48■■■■■ 5.67
LMNTD2-203ENST00000469990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.21■■■■■ 5.63
LMNTD2-203ENST00000469990 SMARCA4P51532 1647 aa50.15■■■■■ 5.62
LMNTD2-203ENST00000469990 NCAPD3P42695 1498 aa49.93■■■■■ 5.58
LMNTD2-203ENST00000469990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.92■■■■■ 5.58
LMNTD2-203ENST00000469990 SMARCA2P51531 1590 aa49.92■■■■■ 5.58
LMNTD2-203ENST00000469990 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.83■■■■■ 5.57
LMNTD2-203ENST00000469990 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.7■■■■■ 5.55
LMNTD2-203ENST00000469990 HMGXB3Q12766 1538 aa49.64■■■■■ 5.54
LMNTD2-203ENST00000469990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
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LMNTD2-203ENST00000469990 WIZO95785 1651 aa49.26■■■■■ 5.48
LMNTD2-203ENST00000469990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
LMNTD2-203ENST00000469990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.57■■■■■ 5.37
LMNTD2-203ENST00000469990 NESP48681 1621 aa48.55■■■■■ 5.36
LMNTD2-203ENST00000469990 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.5■■■■■ 5.35
LMNTD2-203ENST00000469990 ERCC6Q03468 1493 aa48.48■■■■■ 5.35
LMNTD2-203ENST00000469990 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.33■■■■■ 5.33
LMNTD2-203ENST00000469990 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.27■■■■■ 5.32
LMNTD2-203ENST00000469990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
LMNTD2-203ENST00000469990 CFTRP13569 1480 aa48.19■■■■■ 5.31
LMNTD2-203ENST00000469990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.94■■■■■ 5.26
LMNTD2-203ENST00000469990 CUX2O14529 1486 aa47.92■■■■■ 5.26
LMNTD2-203ENST00000469990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.89■■■■■ 5.26
LMNTD2-203ENST00000469990 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.84■■■■■ 5.25
LMNTD2-203ENST00000469990 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
LMNTD2-203ENST00000469990 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.73■■■■■ 5.23
LMNTD2-203ENST00000469990 PRDM2Q13029 1718 aa47.7■■■■■ 5.23
LMNTD2-203ENST00000469990 WDR62O43379 1518 aa47.52■■■■■ 5.2
LMNTD2-203ENST00000469990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCC8Q09428 1581 aa47.27■■■■■ 5.16
LMNTD2-203ENST00000469990 TOPBP1Q92547 1522 aa47.1■■■■■ 5.13
LMNTD2-203ENST00000469990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.07■■■■■ 5.12
LMNTD2-203ENST00000469990 IFT140Q96RY7 1462 aa46.86■■■■■ 5.09
LMNTD2-203ENST00000469990 CUX1P39880 1505 aa46.74■■■■■ 5.07
LMNTD2-203ENST00000469990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
LMNTD2-203ENST00000469990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
LMNTD2-203ENST00000469990 SOGA1O94964 1423 aa46.61■■■■■ 5.05
LMNTD2-203ENST00000469990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
LMNTD2-203ENST00000469990 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
LMNTD2-203ENST00000469990 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
LMNTD2-203ENST00000469990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.48■■■■■ 5.03
LMNTD2-203ENST00000469990 TOP2BQ02880 1626 aa46.41■■■■■ 5.02
LMNTD2-203ENST00000469990 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.38■■■■■ 5.02
LMNTD2-203ENST00000469990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.36■■■■■ 5.01
LMNTD2-203ENST00000469990 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.32■■■■■ 5.01
LMNTD2-203ENST00000469990 SYNJ1O43426 1573 aa46.32■■■■■ 5.01
LMNTD2-203ENST00000469990 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
LMNTD2-203ENST00000469990 WDR97A6NE52 1622 aa46.29■■■■■ 5
LMNTD2-203ENST00000469990 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.29■■■■■ 5
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LMNTD2-203ENST00000469990 OSCARQ8IYS5 282 aa46.07■■■■■ 4.97
LMNTD2-203ENST00000469990 GRIN2BQ13224 1484 aa46.04■■■■■ 4.96
LMNTD2-203ENST00000469990 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.04■■■■■ 4.96
LMNTD2-203ENST00000469990 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.92■■■■■ 4.94
LMNTD2-203ENST00000469990 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
LMNTD2-203ENST00000469990 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.88■■■■■ 4.94
LMNTD2-203ENST00000469990 FBLN2P98095 1184 aa45.87■■■■■ 4.93
LMNTD2-203ENST00000469990 PBRM1Q86U86 1689 aa45.8■■■■■ 4.92
LMNTD2-203ENST00000469990 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
LMNTD2-203ENST00000469990 SYNJ2O15056 1496 aa45.72■■■■■ 4.91
LMNTD2-203ENST00000469990 CHD1O14646 1710 aa45.68■■■■■ 4.9
LMNTD2-203ENST00000469990 TRIM41Q8WV44 630 aa45.67■■■■■ 4.9
LMNTD2-203ENST00000469990 KIF27Q86VH2 1401 aa45.67■■■■■ 4.9
LMNTD2-203ENST00000469990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.67■■■■■ 4.9
LMNTD2-203ENST00000469990 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.54■■■■■ 4.88
LMNTD2-203ENST00000469990 ADAMTS12P58397 1594 aa45.48■■■■■ 4.87
LMNTD2-203ENST00000469990 IGF1RP08069 1367 aa45.42■■■■■ 4.86
LMNTD2-203ENST00000469990 GRIN2AQ12879 1464 aa45.4■■■■■ 4.86
LMNTD2-203ENST00000469990 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.25■■■■■ 4.83
LMNTD2-203ENST00000469990 CUL7Q14999 1698 aa45.25■■■■■ 4.83
LMNTD2-203ENST00000469990 NUP160Q12769 1436 aa45.19■■■■■ 4.83
LMNTD2-203ENST00000469990 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.18■■■■■ 4.82
LMNTD2-203ENST00000469990 ARHGEF11O15085 1522 aa45.13■■■■■ 4.82
LMNTD2-203ENST00000469990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.09■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.08■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.08■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.08■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 CEP170Q5SW79 1584 aa45.08■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.08■■■■■ 4.81
LMNTD2-203ENST00000469990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.91■■■■■ 4.78
LMNTD2-203ENST00000469990 EEA1Q15075 1411 aa44.89■■■■■ 4.78
LMNTD2-203ENST00000469990 JPH4Q96JJ6 628 aa44.85■■■■■ 4.77
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