RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.27■■■■□ 3.56
SYP-204ENST00000469389 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.01■■■□□ 2.87
SYP-204ENST00000469389 ABCC9O60706 1549 aa31.88■■■□□ 2.69
SYP-204ENST00000469389 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.16■■■□□ 2.58
SYP-204ENST00000469389 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
SYP-204ENST00000469389 NACADO15069 1562 aa30.95■■■□□ 2.54
SYP-204ENST00000469389 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.91■■■□□ 2.54
SYP-204ENST00000469389 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.87■■■□□ 2.53
SYP-204ENST00000469389 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.85■■■□□ 2.53
SYP-204ENST00000469389 SCRIBQ14160 1630 aa30.15■■■□□ 2.42
SYP-204ENST00000469389 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.1■■■□□ 2.41
SYP-204ENST00000469389 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
SYP-204ENST00000469389 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.79■■■□□ 2.36
SYP-204ENST00000469389 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.76■■■□□ 2.35
SYP-204ENST00000469389 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SYP-204ENST00000469389 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SYP-204ENST00000469389 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.93■■■□□ 2.22
SYP-204ENST00000469389 SMARCA4P51532 1647 aa28.85■■■□□ 2.21
SYP-204ENST00000469389 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.84■■■□□ 2.21
SYP-204ENST00000469389 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.73■■■□□ 2.19
SYP-204ENST00000469389 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.7■■■□□ 2.18
SYP-204ENST00000469389 SMARCA2P51531 1590 aa28.64■■■□□ 2.18
SYP-204ENST00000469389 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.56■■■□□ 2.16
SYP-204ENST00000469389 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SYP-204ENST00000469389 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.52■■■□□ 2.16
SYP-204ENST00000469389 NCAPD3P42695 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
SYP-204ENST00000469389 WIZO95785 1651 aa28.45■■■□□ 2.14
SYP-204ENST00000469389 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SYP-204ENST00000469389 HMGXB3Q12766 1538 aa28.42■■■□□ 2.14
SYP-204ENST00000469389 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SYP-204ENST00000469389 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SYP-204ENST00000469389 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.83■■■□□ 2.05
SYP-204ENST00000469389 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.73■■■□□ 2.03
SYP-204ENST00000469389 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.73■■■□□ 2.03
SYP-204ENST00000469389 NESP48681 1621 aa27.65■■■□□ 2.02
SYP-204ENST00000469389 CFTRP13569 1480 aa27.61■■■□□ 2.01
SYP-204ENST00000469389 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.58■■■□□ 2.01
SYP-204ENST00000469389 ERCC6Q03468 1493 aa27.57■■■□□ 2
SYP-204ENST00000469389 PRDM2Q13029 1718 aa27.5■■□□□ 1.99
SYP-204ENST00000469389 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.41■■□□□ 1.98
SYP-204ENST00000469389 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.38■■□□□ 1.97
SYP-204ENST00000469389 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.38■■□□□ 1.97
SYP-204ENST00000469389 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.22■■□□□ 1.95
SYP-204ENST00000469389 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SYP-204ENST00000469389 ABCC8Q09428 1581 aa27.12■■□□□ 1.93
SYP-204ENST00000469389 WDR62O43379 1518 aa27.07■■□□□ 1.92
SYP-204ENST00000469389 CUX2O14529 1486 aa27.05■■□□□ 1.92
SYP-204ENST00000469389 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SYP-204ENST00000469389 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.03■■□□□ 1.92
SYP-204ENST00000469389 TOPBP1Q92547 1522 aa27■■□□□ 1.91
SYP-204ENST00000469389 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
SYP-204ENST00000469389 CUX1P39880 1505 aa26.91■■□□□ 1.9
SYP-204ENST00000469389 TOP2BQ02880 1626 aa26.84■■□□□ 1.89
SYP-204ENST00000469389 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.83■■□□□ 1.88
SYP-204ENST00000469389 SYNJ1O43426 1573 aa26.81■■□□□ 1.88
SYP-204ENST00000469389 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.81■■□□□ 1.88
SYP-204ENST00000469389 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SYP-204ENST00000469389 IFT140Q96RY7 1462 aa26.78■■□□□ 1.88
SYP-204ENST00000469389 SOGA1O94964 1423 aa26.74■■□□□ 1.87
SYP-204ENST00000469389 TRIM41Q8WV44 630 aa26.72■■□□□ 1.87
SYP-204ENST00000469389 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.65■■□□□ 1.86
SYP-204ENST00000469389 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SYP-204ENST00000469389 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.56■■□□□ 1.84
SYP-204ENST00000469389 WDR97A6NE52 1622 aa26.55■■□□□ 1.84
SYP-204ENST00000469389 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.54■■□□□ 1.84
SYP-204ENST00000469389 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SYP-204ENST00000469389 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SYP-204ENST00000469389 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SYP-204ENST00000469389 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
SYP-204ENST00000469389 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.44■■□□□ 1.82
SYP-204ENST00000469389 KIF27Q86VH2 1401 aa26.43■■□□□ 1.82
SYP-204ENST00000469389 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.39■■□□□ 1.82
SYP-204ENST00000469389 GRIN2BQ13224 1484 aa26.39■■□□□ 1.82
SYP-204ENST00000469389 PBRM1Q86U86 1689 aa26.35■■□□□ 1.81
SYP-204ENST00000469389 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
SYP-204ENST00000469389 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SYP-204ENST00000469389 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.26■■□□□ 1.79
SYP-204ENST00000469389 EEA1Q15075 1411 aa26.22■■□□□ 1.79
SYP-204ENST00000469389 FBLN2P98095 1184 aa26.22■■□□□ 1.79
SYP-204ENST00000469389 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 CUL7Q14999 1698 aa26.17■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 IGF1RP08069 1367 aa26.16■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 SYNJ2O15056 1496 aa26.16■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.15■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.15■■□□□ 1.78
SYP-204ENST00000469389 ADAMTS12P58397 1594 aa26.13■■□□□ 1.77
SYP-204ENST00000469389 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SYP-204ENST00000469389 CHD1O14646 1710 aa26.09■■□□□ 1.77
SYP-204ENST00000469389 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.09■■□□□ 1.77
SYP-204ENST00000469389 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.08■■□□□ 1.77
SYP-204ENST00000469389 OSCARQ8IYS5 282 aa26.06■■□□□ 1.76
SYP-204ENST00000469389 GRIN2AQ12879 1464 aa26.02■■□□□ 1.76
SYP-204ENST00000469389 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.98■■□□□ 1.75
SYP-204ENST00000469389 PRXQ9BXM0 1461 aa25.91■■□□□ 1.74
SYP-204ENST00000469389 KIF21BO75037 1637 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-204ENST00000469389 NUP160Q12769 1436 aa25.84■■□□□ 1.73
SYP-204ENST00000469389 CEP170Q5SW79 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
SYP-204ENST00000469389 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.77■■□□□ 1.72
SYP-204ENST00000469389 GOLGA3Q08378 1498 aa25.77■■□□□ 1.72
SYP-204ENST00000469389 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.76■■□□□ 1.71
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