RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468956.1

ELK1-204, Transcript of ELK1, ETS transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene ELK1, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1-204ENST00000468956 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.99■■■■■ 5.27
ELK1-204ENST00000468956 ABCC9O60706 1549 aa44.36■■■■■ 4.69
ELK1-204ENST00000468956 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.41■■■■■ 4.54
ELK1-204ENST00000468956 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.5■■■■■ 4.39
ELK1-204ENST00000468956 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.78■■■■■ 4.28
ELK1-204ENST00000468956 NACADO15069 1562 aa41.27■■■■■ 4.2
ELK1-204ENST00000468956 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
ELK1-204ENST00000468956 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.92■■■■■ 4.14
ELK1-204ENST00000468956 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.86■■■■■ 4.13
ELK1-204ENST00000468956 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.65■■■■■ 4.1
ELK1-204ENST00000468956 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.41■■■■■ 4.06
ELK1-204ENST00000468956 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.05■■■■■ 4
ELK1-204ENST00000468956 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.01■■■■■ 4
ELK1-204ENST00000468956 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.94■■■■□ 3.98
ELK1-204ENST00000468956 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
ELK1-204ENST00000468956 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.64■■■■□ 3.94
ELK1-204ENST00000468956 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
ELK1-204ENST00000468956 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.56■■■■□ 3.92
ELK1-204ENST00000468956 SCRIBQ14160 1630 aa39.54■■■■□ 3.92
ELK1-204ENST00000468956 CUX2O14529 1486 aa38.57■■■■□ 3.76
ELK1-204ENST00000468956 ERCC6Q03468 1493 aa38.34■■■■□ 3.73
ELK1-204ENST00000468956 NCAPD3P42695 1498 aa38.15■■■■□ 3.7
ELK1-204ENST00000468956 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.91■■■■□ 3.66
ELK1-204ENST00000468956 NESP48681 1621 aa37.87■■■■□ 3.65
ELK1-204ENST00000468956 HMGXB3Q12766 1538 aa37.75■■■■□ 3.63
ELK1-204ENST00000468956 SMARCA2P51531 1590 aa37.72■■■■□ 3.63
ELK1-204ENST00000468956 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
ELK1-204ENST00000468956 SMARCA4P51532 1647 aa37.62■■■■□ 3.61
ELK1-204ENST00000468956 TRIM41Q8WV44 630 aa37.52■■■■□ 3.6
ELK1-204ENST00000468956 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
ELK1-204ENST00000468956 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.4■■■■□ 3.58
ELK1-204ENST00000468956 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.31■■■■□ 3.56
ELK1-204ENST00000468956 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
ELK1-204ENST00000468956 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.26■■■■□ 3.56
ELK1-204ENST00000468956 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.23■■■■□ 3.55
ELK1-204ENST00000468956 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.99■■■■□ 3.51
ELK1-204ENST00000468956 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.97■■■■□ 3.51
ELK1-204ENST00000468956 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.95■■■■□ 3.51
ELK1-204ENST00000468956 WDR62O43379 1518 aa36.9■■■■□ 3.5
ELK1-204ENST00000468956 OSCARQ8IYS5 282 aa36.69■■■■□ 3.46
ELK1-204ENST00000468956 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.63■■■■□ 3.45
ELK1-204ENST00000468956 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.53■■■■□ 3.44
ELK1-204ENST00000468956 WIZO95785 1651 aa36.49■■■■□ 3.43
ELK1-204ENST00000468956 CFTRP13569 1480 aa36.33■■■■□ 3.41
ELK1-204ENST00000468956 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
ELK1-204ENST00000468956 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
ELK1-204ENST00000468956 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
ELK1-204ENST00000468956 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
ELK1-204ENST00000468956 ARHGEF11O15085 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
ELK1-204ENST00000468956 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
ELK1-204ENST00000468956 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
ELK1-204ENST00000468956 IFT140Q96RY7 1462 aa35.93■■■■□ 3.34
ELK1-204ENST00000468956 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.91■■■■□ 3.34
ELK1-204ENST00000468956 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
ELK1-204ENST00000468956 PRDM2Q13029 1718 aa35.84■■■■□ 3.33
ELK1-204ENST00000468956 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
ELK1-204ENST00000468956 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
ELK1-204ENST00000468956 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
ELK1-204ENST00000468956 ARAP1Q96P48 1450 aa35.7■■■■□ 3.31
ELK1-204ENST00000468956 CHD1O14646 1710 aa35.63■■■■□ 3.29
ELK1-204ENST00000468956 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.58■■■■□ 3.29
ELK1-204ENST00000468956 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.281e-7■■■■■ 35.9
ELK1-204ENST00000468956 ABCC8Q09428 1581 aa35.55■■■■□ 3.28
ELK1-204ENST00000468956 FBLN2P98095 1184 aa35.5■■■■□ 3.27
ELK1-204ENST00000468956 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.5■■■■□ 3.27
ELK1-204ENST00000468956 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
ELK1-204ENST00000468956 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
ELK1-204ENST00000468956 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
ELK1-204ENST00000468956 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.22■■■■□ 3.23
ELK1-204ENST00000468956 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.22■■■■□ 3.23
ELK1-204ENST00000468956 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
ELK1-204ENST00000468956 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.16■■■■□ 3.22
ELK1-204ENST00000468956 SOGA1O94964 1423 aa35.14■■■■□ 3.22
ELK1-204ENST00000468956 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ELK1-204ENST00000468956 SYNJ1O43426 1573 aa35.08■■■■□ 3.21
ELK1-204ENST00000468956 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
ELK1-204ENST00000468956 WDR97A6NE52 1622 aa35■■■■□ 3.19
ELK1-204ENST00000468956 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.97■■■■□ 3.19
ELK1-204ENST00000468956 GRIN2BQ13224 1484 aa34.92■■■■□ 3.18
ELK1-204ENST00000468956 SYNJ2O15056 1496 aa34.91■■■■□ 3.18
ELK1-204ENST00000468956 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.91■■■■□ 3.18
ELK1-204ENST00000468956 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
ELK1-204ENST00000468956 PBRM1Q86U86 1689 aa34.7■■■■□ 3.15
ELK1-204ENST00000468956 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.64■■■■□ 3.14
ELK1-204ENST00000468956 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.53■■■■□ 3.12
ELK1-204ENST00000468956 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.5■■■■□ 3.11
ELK1-204ENST00000468956 GRIN2AQ12879 1464 aa34.48■■■■□ 3.11
ELK1-204ENST00000468956 CEP170Q5SW79 1584 aa34.47■■■■□ 3.11
ELK1-204ENST00000468956 NUP160Q12769 1436 aa34.41■■■■□ 3.1
ELK1-204ENST00000468956 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.4■■■■□ 3.1
ELK1-204ENST00000468956 SHROOM2Q13796 1616 aa34.34■■■■□ 3.09
ELK1-204ENST00000468956 ADAMTS12P58397 1594 aa34.34■■■■□ 3.09
ELK1-204ENST00000468956 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.21■■■■□ 3.07
ELK1-204ENST00000468956 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
ELK1-204ENST00000468956 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
ELK1-204ENST00000468956 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.14■■■■□ 3.06
ELK1-204ENST00000468956 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.12■■■■□ 3.05
ELK1-204ENST00000468956 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.07■■■■□ 3.04
ELK1-204ENST00000468956 JPH4Q96JJ6 628 aa34.07■■■■□ 3.04
ELK1-204ENST00000468956 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
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