RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468454.1

PTPRN-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-212ENST00000468454 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
PTPRN-212ENST00000468454 ABCC9O60706 1549 aa34.88■■■■□ 3.17
PTPRN-212ENST00000468454 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.79■■■■□ 3
PTPRN-212ENST00000468454 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.65■■■□□ 2.98
PTPRN-212ENST00000468454 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.63■■■□□ 2.81
PTPRN-212ENST00000468454 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.78
PTPRN-212ENST00000468454 NACADO15069 1562 aa32.18■■■□□ 2.74
PTPRN-212ENST00000468454 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.09■■■□□ 2.73
PTPRN-212ENST00000468454 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32■■■□□ 2.71
PTPRN-212ENST00000468454 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRN-212ENST00000468454 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.45■■■□□ 2.62
PTPRN-212ENST00000468454 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.4■■■□□ 2.62
PTPRN-212ENST00000468454 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.38■■■□□ 2.61
PTPRN-212ENST00000468454 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.36■■■□□ 2.61
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PTPRN-212ENST00000468454 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRN-212ENST00000468454 SCRIBQ14160 1630 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRN-212ENST00000468454 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PTPRN-212ENST00000468454 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.68■■■□□ 2.5
PTPRN-212ENST00000468454 CUX2O14529 1486 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRN-212ENST00000468454 ERCC6Q03468 1493 aa30.08■■■□□ 2.41
PTPRN-212ENST00000468454 NCAPD3P42695 1498 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRN-212ENST00000468454 NESP48681 1621 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRN-212ENST00000468454 TRIM41Q8WV44 630 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRN-212ENST00000468454 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRN-212ENST00000468454 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PTPRN-212ENST00000468454 HMGXB3Q12766 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRN-212ENST00000468454 SMARCA2P51531 1590 aa29.37■■■□□ 2.29
PTPRN-212ENST00000468454 SMARCA4P51532 1647 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRN-212ENST00000468454 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.25■■■□□ 2.27
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PTPRN-212ENST00000468454 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRN-212ENST00000468454 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.08■■■□□ 2.25
PTPRN-212ENST00000468454 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PTPRN-212ENST00000468454 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.98■■■□□ 2.23
PTPRN-212ENST00000468454 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRN-212ENST00000468454 WDR62O43379 1518 aa28.87■■■□□ 2.21
PTPRN-212ENST00000468454 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.86■■■□□ 2.21
PTPRN-212ENST00000468454 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.85■■■□□ 2.21
PTPRN-212ENST00000468454 OSCARQ8IYS5 282 aa28.81■■■□□ 2.2
PTPRN-212ENST00000468454 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRN-212ENST00000468454 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRN-212ENST00000468454 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRN-212ENST00000468454 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.56■■■□□ 2.16
PTPRN-212ENST00000468454 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.54■■■□□ 2.16
PTPRN-212ENST00000468454 WIZO95785 1651 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRN-212ENST00000468454 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PTPRN-212ENST00000468454 ARHGEF11O15085 1522 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-212ENST00000468454 CFTRP13569 1480 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRN-212ENST00000468454 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRN-212ENST00000468454 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRN-212ENST00000468454 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRN-212ENST00000468454 ARAP1Q96P48 1450 aa28.06■■■□□ 2.08
PTPRN-212ENST00000468454 IFT140Q96RY7 1462 aa28.06■■■□□ 2.08
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PTPRN-212ENST00000468454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
PTPRN-212ENST00000468454 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PTPRN-212ENST00000468454 CHD1O14646 1710 aa27.93■■■□□ 2.06
PTPRN-212ENST00000468454 TOPBP1Q92547 1522 aa27.91■■■□□ 2.06
PTPRN-212ENST00000468454 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PTPRN-212ENST00000468454 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.05
PTPRN-212ENST00000468454 FBLN2P98095 1184 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRN-212ENST00000468454 PRDM2Q13029 1718 aa27.87■■■□□ 2.05
PTPRN-212ENST00000468454 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRN-212ENST00000468454 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PTPRN-212ENST00000468454 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.68■■■□□ 2.02
PTPRN-212ENST00000468454 ABCC8Q09428 1581 aa27.64■■■□□ 2.01
PTPRN-212ENST00000468454 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.58■■■□□ 2.01
PTPRN-212ENST00000468454 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PTPRN-212ENST00000468454 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PTPRN-212ENST00000468454 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.57■■■□□ 2
PTPRN-212ENST00000468454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRN-212ENST00000468454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PTPRN-212ENST00000468454 SOGA1O94964 1423 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRN-212ENST00000468454 SYNJ1O43426 1573 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRN-212ENST00000468454 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRN-212ENST00000468454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRN-212ENST00000468454 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-212ENST00000468454 SYNJ2O15056 1496 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-212ENST00000468454 GRIN2BQ13224 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-212ENST00000468454 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-212ENST00000468454 WDR97A6NE52 1622 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-212ENST00000468454 CUX1P39880 1505 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-212ENST00000468454 PBRM1Q86U86 1689 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRN-212ENST00000468454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-212ENST00000468454 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27■■□□□ 1.91
PTPRN-212ENST00000468454 CEP170Q5SW79 1584 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRN-212ENST00000468454 GRIN2AQ12879 1464 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRN-212ENST00000468454 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRN-212ENST00000468454 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRN-212ENST00000468454 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRN-212ENST00000468454 NUP160Q12769 1436 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRN-212ENST00000468454 SHROOM2Q13796 1616 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRN-212ENST00000468454 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRN-212ENST00000468454 ADAMTS12P58397 1594 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRN-212ENST00000468454 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRN-212ENST00000468454 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRN-212ENST00000468454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRN-212ENST00000468454 DIP2BQ9P265 1576 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRN-212ENST00000468454 JPH4Q96JJ6 628 aa26.63■■□□□ 1.85
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